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新發(fā)禽流感病毒HA/NA基因UTR可變區(qū)突變影響病毒生物學(xué)特性的分子機制研究

發(fā)布時間:2021-09-01 10:00
  目的:流感病毒基因組UTR可變區(qū)的堿基多態(tài)性可影響其基因的轉(zhuǎn)錄、復(fù)制和翻譯,從而影響病毒的生物學(xué)特性。本研究利用本課題組前期自主構(gòu)建的RNA聚合酶I EGFP熒光報告系統(tǒng),即新發(fā)禽流感病毒H5N6/H7N9/H9N2的HA/NA-3’UTR-EGFP-5’UTR隨機突變庫。從其中隨機挑選各亞型的突變克隆,定性及定量分析EGFP基因的表達情況。測序鑒定EGFP報告基因上調(diào)的HA/NA-UTR突變克隆并分析導(dǎo)致EGFP表達上調(diào)的UTR可變區(qū)特異SNP特征。同時利用自主構(gòu)建的雙向反向遺傳學(xué)體系包裝H9N2流感病毒和UTR區(qū)突變病毒,測定并比較其病毒感染力,從而探討流感病毒UTR區(qū)的基因突變對病毒感染能力變化的影響。方法:1.從隨機突變庫中篩選EGFP表達上調(diào)株:采用實驗室構(gòu)建的由HA/NA-UTR隨機突變RNA聚合酶I熒光報告系統(tǒng)(HA/NA-3’UTR-EGFP-5’UTR)組成的突變庫,從HA/NA-UTR隨機突變庫的H5/H7/H9和N2/N6/N9亞型中分別隨機挑選突變克隆,將突變克隆轉(zhuǎn)染至由H1N1染毒的MDCK細(xì)胞,通過熒光顯微鏡觀察EGFP基因的熒光表達情況,利用多功能酶標(biāo)儀測... 

【文章來源】:暨南大學(xué)廣東省 211工程院校

【文章頁數(shù)】:93 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

新發(fā)禽流感病毒HA/NA基因UTR可變區(qū)突變影響病毒生物學(xué)特性的分子機制研究


甲型流感病毒結(jié)構(gòu)示意圖

序列,宿主細(xì)胞,流感,病毒


暨南大學(xué)碩士學(xué)位論文4出以供細(xì)胞質(zhì)核糖體翻譯[23]。甲型流感病毒的蛋白質(zhì)合成完全依賴于宿主細(xì)胞的翻譯機制。一旦合成病毒RNA,它們就會通過核孔進入宿主細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)。核出口之后,病毒mRNA的翻譯分為細(xì)胞質(zhì)核糖體(PB1、PB2、PA、NP、NS1、NS2和M1)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)的核糖體(膜蛋白HA、NA和M2)[24]。新合成的NP蛋白和聚合酶亞基(PB1、PB2和PA)上的核定位序列將這些蛋白質(zhì)導(dǎo)向至細(xì)胞核。NP和PB2蛋白是單獨導(dǎo)入的,而PB1和PA蛋白是作為異二聚體導(dǎo)入的[25,26]。在宿主細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中,vRNP被基質(zhì)蛋白M1包圍,被導(dǎo)向定位于細(xì)胞質(zhì)膜的出芽位點,用于病毒的組裝[27,28]。HA、NA和M2穿過反式高爾基體網(wǎng)絡(luò)后,翻譯過程在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中進行。病毒被攜帶HA、NA和離子通道蛋白M2的宿主細(xì)胞衍生的脂質(zhì)膜包裹,這些蛋白質(zhì)被運輸?shù)郊?xì)胞的頂端表面以從極化細(xì)胞中排出[29]。新組裝的病毒通過破壞SA以出芽的方式釋放出來,其依賴于NA的唾液酸酶活性。圖2.甲型流感病毒在宿主細(xì)胞中的生活史Figure2.SchematicdiagramoflifecycleofinfluenzaAvirusinthehostcell.

熒光,顯微鏡,綠色,蛋白


暨南大學(xué)碩士學(xué)位論文23圖3熒光顯微鏡下H5-UTR突變克隆的綠色熒光蛋白表達情況Fig.3TheexpressionofH5-UTRmutantclonesonEGFPusingFluorescencemicroscopy圖4熒光顯微鏡下H7-UTR突變克隆的綠色熒光蛋白表達情況Fig.4TheexpressionofH7-UTRmutantclonesonEGFPusingFluorescencemicroscopy圖5熒光顯微鏡下H9-UTR突變克隆的綠色熒光蛋白表達情況Fig.5TheexpressionofH9-UTRmutantclonesonEGFPusingFluorescencemicroscopy

【參考文獻】:
碩士論文
[1]甲型流感H5/H7/H9及N2/N6/N9亞型非翻譯區(qū)隨機突變基因庫構(gòu)建及篩選[D]. 陳燕慈.暨南大學(xué) 2018



本文編號:3376778

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