在當今精準醫(yī)療的發(fā)展背景下,隨著測序成本的大幅下降和測序技術(shù)的普及應(yīng)用,基于基因組學(xué)的診斷和醫(yī)學(xué)服務(wù)已經(jīng)被越來越廣泛地應(yīng)用于臨床,其中包括產(chǎn)前檢查、單基因遺傳病檢查、腫瘤個體化治療、易感基因檢查、全基因組測序等�，F(xiàn)在人們可以方便地利用先進的高通量測序技術(shù),對個人基因組中的30億個堿基進行測序和分析,結(jié)合最新的科研進展,根據(jù)個人特有的遺傳信息,提供個性化的健康建議、生育指導(dǎo)、用藥提示、飲食建議、營養(yǎng)指導(dǎo)等全生命周期的健康管理方案�；蛘{(diào)控網(wǎng)絡(luò)通過調(diào)控基因的表達控制生物體的細胞活動,進而調(diào)控生物體的生命活動。所以掌握基因表達調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的內(nèi)在規(guī)律有助于幫助了解生命活動的本質(zhì)以及疾病產(chǎn)生的內(nèi)在原因,有助于人們更好的治療疾病,保持并享有一個健康的生活。從上世紀60年代到現(xiàn)在,已有多種數(shù)學(xué)模型被用于嘗試構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并取得了一定的成果。其中使用較廣的模型有布爾網(wǎng)絡(luò),互信息模型,貝葉斯網(wǎng)絡(luò),微分方程,神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)等。但是在這些模型的使用過程中也發(fā)現(xiàn)了一些缺點,如現(xiàn)有的模型直接用于構(gòu)建基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)普遍存在不能足夠精確地預(yù)測基因的表達水平和識別基因間的調(diào)控關(guān)系的問題,往往需要針對具體的網(wǎng)絡(luò)進行相應(yīng)的模型調(diào)... 

【文章來源】：濟南大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

一個簡單的貝葉斯網(wǎng)絡(luò)在貝葉斯網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)之上引入時間維度形成了動態(tài)貝葉斯網(wǎng)絡(luò)，能夠很好地表示隨P(B)=0.0710……

圖 3.1 一個四層的 FNT 模型示意圖樹的結(jié)構(gòu)靈活，輸入、輸出和結(jié)構(gòu)無需事先設(shè)計，F(xiàn)NT的結(jié)構(gòu)和參數(shù)，模型的總輸出是通過深度優(yōu)先搜索從左了構(gòu)造 FNT 模型，需要事先定義函數(shù)集 F 和終端指令合適的結(jié)構(gòu)訓(xùn)練算法和參數(shù)訓(xùn)練算法對模型進行訓(xùn)練S = F T = ) 代表的是非葉子節(jié)點指令，表示的是操作對 是葉子節(jié)點指令，沒有操作對象。如圖 3.2 所示，非元計算。3+2+3X3X2X1X1W1

CLN1 0.016249 0.089526 0.213857CLN2 0.016447 0.126583 0.278403SWI4 0.024368 0.194035 0.165873SIC1 0.017265 0.203846 0.183027CDC28 0.132847 0.278524 0.054208MBP1 0.022548 0.190697 0.130824CLB5 0.034756 0.180469 0.304872CDC6 0.151469 0.354627 0.284053CDC20 0.048536 0.201857 0.210381CLB6 0.024863 0.063894 0.053024均值 0.057809 0.197227 0.182015使用本文提出的模型預(yù)測的 SWI6 和 MBP1 的基因表達兩個測試集上的擬合曲線，橫坐標代表時間點，縱坐標代左半部分代表了 SWI6 基因的擬合曲線，右半部分則代半部分是在 cdc28arrest 數(shù)據(jù)子集上的表現(xiàn)，下半部分是現(xiàn)。

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]基于計算智能的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)建模研究[D]. 楊斌.山東大學(xué) 2014
[2]基于互信息的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建方法研究[D]. 張秀軍.上海大學(xué) 2013



本文編號：3373026