干酪乳桿菌LC2W是一株高產(chǎn)胞外多糖的益生乳酸菌,其胞外多糖具有獨特的物化特性和益生活性,應(yīng)用潛力巨大。但LC2W胞外多糖（EPS）生物合成的基因調(diào)控研究較少,其核心元件啟動子尚未明確。為鑒定干酪乳桿菌LC2W中eps基因簇的啟動子,本研究采用生物信息學(xué)方法預(yù)測得到8個潛在啟動子區(qū)域,通過RT-PCR方法鑒定出6個啟動子元件P_2169-2170、P_2172-2173、P_2174-2175、P_2175-2176、P_2185-2186、P_2189-2190,為干酪乳桿菌EPS合成的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。 

【文章來源】：工業(yè)微生物. 2020,50(04)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

干酪乳桿菌LC2W中預(yù)測的eps基因簇及啟動子預(yù)測

RT-PCR結(jié)果表明(圖2)，干酪乳桿菌LC2W的eps基因簇中存在5個操縱子，其余2個基因皆為單基因轉(zhuǎn)錄單位�；虼厣洗嬖趥�6個啟動子區(qū)域，分別為P2169-2170、P2172-2173、P2174-2175、P2175-2176、P2185-2186、P2189-2190。與生物信息學(xué)方法預(yù)測的結(jié)果相比，有5個潛在啟動子區(qū)域P2179-2180、P2180-2181、P2182-2183、P2183-2184和P2187-2188不存在啟動子結(jié)構(gòu)，而P2169-2170、P2185-2186、P2189-2190是3個正確的啟動子。此外，基因簇上發(fā)現(xiàn)了3個未被預(yù)測到的啟動子P2172-2173、P2174-2175、P2175-2176。不同細菌啟動子基因的差異性會影響預(yù)測結(jié)果，這可能是造成本研究通過RT-PCR鑒定得到的啟動子與生物信息學(xué)預(yù)測結(jié)果不同的重要原因[11]。3 結(jié)論

【參考文獻】：
期刊論文
[1]肺炎鏈球菌cps操縱子的啟動子序列點突變可導(dǎo)致細菌莢膜缺失[J]. 王建敏,徐繡宇,馬峰,徐紅梅,王麗濱,邢燕,粟玉鳳,張雪梅.  微生物學(xué)報. 2015(06)



本文編號：3368416