發(fā)布時(shí)間：2021-08-02 00:54

　　【目的】單鋅指DNA結(jié)合蛋白（DNA binding with one finger, Dof）是1類植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,在植物生長(zhǎng)發(fā)育與非生物脅迫響應(yīng)中發(fā)揮非常重要的作用。本研究旨在對(duì)陸地棉D(zhuǎn)of轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行全基因組分析,為深入研究Dof基因參與植物生長(zhǎng)發(fā)育的調(diào)控機(jī)制提供參考�！痉椒ā炕谧钚掳l(fā)布的陸地棉基因組數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)手段對(duì)陸地棉D(zhuǎn)of基因家族進(jìn)行全基因組鑒定,并系統(tǒng)分析Dof基因家族成員的理化性質(zhì)、序列特征、基因復(fù)制、系統(tǒng)進(jìn)化和表達(dá)譜。【結(jié)果】陸地棉中一共鑒定出118個(gè)Dof基因。經(jīng)聚類分析將其分成9個(gè)亞家族,同一亞家族的陸地棉D(zhuǎn)of基因有相似的內(nèi)含子/外顯子和基序分布模式。基因復(fù)制分析表明,全基因組復(fù)制可能導(dǎo)致陸地棉D(zhuǎn)of基因的擴(kuò)增。陸地棉D(zhuǎn)of基因啟動(dòng)子區(qū)域存在不同植物激素和逆境脅迫響應(yīng)元件。轉(zhuǎn)錄組分析表明,陸地棉D(zhuǎn)of基因在不同的組織、發(fā)育時(shí)期和逆境脅迫下聚為3個(gè)表達(dá)模式不同的類群,暗示了其功能多樣性�！窘Y(jié)論】陸地棉D(zhuǎn)of基因家族的全基因組鑒定和分析,有助于了解其進(jìn)化和功能,為后續(xù)研究提供重要參考。 

【文章來源】：棉花學(xué)報(bào). 2020,32(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：13 頁

【部分圖文】：

陸地棉D(zhuǎn)of基因在染色體上的分布

陸地棉與擬南芥Dof蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化樹

陸地棉D(zhuǎn)of蛋白序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹、保守基序和基因結(jié)構(gòu)分析


本文編號(hào)：3316560