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BoEMS1和BoDAD基因控制甘藍雄性不育的功能研究

發(fā)布時間:2021-07-28 20:13
  結(jié)球甘藍(Brassica oleracea L.var.capitata L.),簡稱甘藍,是十字花科蕓薹屬甘藍種中兩年生的重要蔬菜作物。甘藍為典型的異花授粉作物,具有自交不親和的特點,長期依賴于人工蕾期自交授粉繁殖自交不親和原種,工作量大,雜交率很難達到100%。進入本世紀(jì)以后,甘藍雜交育種的重點轉(zhuǎn)向了雄性不育系的選育和利用。其中細胞質(zhì)雄性不育(CMS)的利用最為普遍,存在恢復(fù)源限制,胞質(zhì)負效應(yīng)、胞質(zhì)單一化等問題。針對當(dāng)前甘藍雄性不育工作中存在的雄性不育遺傳資源狹窄,過度利用蘿卜Ogura CMS不育源,單一胞質(zhì)使用的潛在風(fēng)險以及因嚴重缺乏優(yōu)良甘藍自交親和系制約了甘藍雄性不育雜交育種發(fā)展和應(yīng)用等問題,本研究擬通過甘藍細胞核不育系和自交親和性系的創(chuàng)制,擴大甘藍雄性不育資源,規(guī)避單一胞質(zhì)使用風(fēng)險,促進甘藍雄性不育雜交育種的發(fā)展。隨著控制甘藍雄性不育和自交不親和性基因明確,以基因組編輯為主的反向遺傳學(xué)技術(shù)可以對目的基因的靶位點進行定點改造,為培育自交親和的雄性不育系提供了可能。本試驗以甘藍為研究對象,利用RNAi、優(yōu)化的CRISPR/Cas9等技術(shù),對甘藍BoEMS1、BoSRK以及Bo... 

【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:113 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

BoEMS1和BoDAD基因控制甘藍雄性不育的功能研究


茉莉酸(JA)生物合成途徑Fig.1-1Biosynthesisofjasmonates

示意圖,機制,示意圖,外源


進一步分析 CRISPR/Cas 的結(jié)構(gòu)主要如下三個部分:一個 CRISPR 簇,包括一段非常保守的重復(fù)序列(repeat)和長度相似的間隔序列(spacer);CRISPR 簇前端的引導(dǎo)序列(leader sequence);CRISPR 簇側(cè)翼的一些輔助基因(CRISPRassociated genes,cas),如圖 1-2 所示。目前研究發(fā)現(xiàn) CRISPER/Csa9 系統(tǒng)有 3 種,即Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型,由于Ⅰ型和Ⅲ型的工作機制較為復(fù)雜,需要復(fù)雜的 Cas 蛋白系統(tǒng)參與完成。而Ⅱ型只需要 Cas9 這一種蛋白參與免疫過程,其結(jié)構(gòu)組成相對簡單,是目前研究最深入類型(Makarova et al.,2011)。CRISPER/Csa9 Ⅱ型系統(tǒng)一般經(jīng)過3 個階段:(1)間隔區(qū) spacer 的獲得;(2)crRNA(CRISPR-derived RNA)的加工;(3)target 的干擾(Wiedenheft et al.,2012)。第一階段將外源 DNA 片段通過非同源重組整合到 CRISPR 簇中,形成一個新的間隔序列;第二階段的完成是在前導(dǎo)序列 PAMs 作用下的 CRISPR 基因座位點形成前體 RNA(pre-crRNA),通過 Cas9蛋白和 RNAaseⅢ核酸酶的剪切、加工形成成熟 crRNA(Karginov et al.,2010);第三階段當(dāng)宿主菌再次受到外源 DNA 侵染時,crRNA 和 tracrRNA(trans-activatingchimeric RNA)形成的復(fù)合體特異性結(jié)合外源 DNA,在 Cas9 蛋白核酸內(nèi)切酶的作用下剪切雙鏈 DNA 最終達到保護宿主菌的目的(Garneau et al.,2010)。

示意圖,作用原理,示意圖,靶向


(3) tRNA-sgRNA 表達系統(tǒng)CRISPR/Cas9 的靶向能力和多重編輯效率往往會受到 sgRNA 表達策略的限制。為此,賓夕法尼亞大學(xué)的 Yang 教授的研究團隊開發(fā)了一個基于 CRISPR 編輯技術(shù)的新系統(tǒng),以期尋找一種簡便、高效編輯多基因位點的方法。tRNA 加工系統(tǒng)包含了啟動子元件、poⅢ等,其作用相當(dāng)于轉(zhuǎn)錄增強子,能夠精確切割 tRNA 前體兩端且 tRNA 大量存在于細胞中,基于以上這些特點研究人員將 tRNA 與 gRNA 結(jié)合起來,合成一個多順反子基因 PTG,將多個 sgRNA 與 tRNA 串聯(lián)在同一表達載體上(Xie et al.,2015)(圖 1-3)。研究顯示,內(nèi)源 tRNA 加工系統(tǒng)能夠精確加工這個合成基因,有效生成大量攜帶正確靶向序列的 gRNA,引導(dǎo) Cas9 編輯多個目標(biāo)染色體。這一策略能夠在穩(wěn)定的轉(zhuǎn)基因水稻中高效(高達 100%)實現(xiàn)多重基因組編輯和染色體片段的刪除(Xie et al.,2015)。此后,tRNA-sgRNA 這套系統(tǒng)還成功應(yīng)用于敲除與玉米(Qi et al.,2016)、小麥(Wang et al.,2016)生長發(fā)育相關(guān)的基因,顯著提高了 CRISPR/Cas9 的靶向能力和多重編輯效率,極大程度促進作物遺傳及品種改良等研究。

【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于SRK基因序列分析的甘藍自交不親和系單倍型鑒定及驗證[J]. 鄭敏,朱陳曾,劉夢慈,徐冰冰,馬存發(fā),李勤菲,任雪松,司軍,宋洪元.  中國蔬菜. 2018(03)
[2]兩種密碼子優(yōu)化的Cas9編碼基因在斑馬魚胚胎中基因敲除效率的比較[J]. 張峰華,王厚鵬,黃思雨,熊鳳,朱作言,孫永華.  遺傳. 2016(02)
[3]CRISPR/Cas9的應(yīng)用及脫靶效應(yīng)研究進展[J]. 鄭武,谷峰.  遺傳. 2015(10)
[4]辣椒雄性不育系及保持系小孢子發(fā)育的細胞學(xué)比較[J]. 王蘭蘭,王曉林,魏兵強,陳靈芝,張茹.  西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2015(01)
[5]水稻隱性核雄性不育基因研究進展及育種應(yīng)用探討[J]. 馬西青,方才臣,鄧聯(lián)武,萬向元.  中國水稻科學(xué). 2012(05)
[6]甘藍胞質(zhì)雄性不育系CMS158小孢子發(fā)生的細胞學(xué)研究[J]. 許忠民,張恩慧,程永安,鞏振輝,馬青山.  西北農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2012(03)
[7]兩種甘藍Ogura細胞質(zhì)雄性不育源的分子鑒別[J]. 張揚勇,方智遠,王慶彪,劉玉梅,楊麗梅,莊木,孫培田.  中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(14)
[8]甘藍細胞質(zhì)雄性不育材料分子鑒定及花器官形態(tài)對核背景的響應(yīng)[J]. 張艷,王小佳,李成瓊,宋洪元,任雪松,司軍.  園藝學(xué)報. 2010(06)
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[10]蕓薹屬自交不親和功能因子及分子機制研究進展[J]. 盧軍,李樂玉,陳曉丹,朱利泉,王小佳.  廣西農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(06)

博士論文
[1]CRISPR-Cas9介導(dǎo)的玉米基因組定點編輯研究[D]. 朱金潔.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]四種類型甘藍雄性不育系花藥敗育特征及基因表達譜分析[D]. 康俊根.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2006

碩士論文
[1]利用CRISPR/Cas9技術(shù)編輯甘藍基因的初步研究[D]. 馬存發(fā).西南大學(xué) 2017
[2]擬南芥ms1回復(fù)突變篩選及基因定位[D]. 李亞東.四川農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016



本文編號:3308568

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