近些年以來,癌癥的發(fā)病率越來越高。肺癌是最常見的癌癥類型,也是導致身亡的主要癌癥類型之一。而非小細胞肺癌（NSCLC）是所有肺癌類型中最為重要的一種。以往的研究發(fā)現,肺癌主要是由于基因組變異的累積引起的。其中,KRAS基因是目前最常見的一種由于基因編碼突變導致肺癌的重要基因。單核苷酸多態(tài)性（SNPs）是一種基因變異,主要指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性。單核苷酸多態(tài)性（SNPs）是一種很常見的人類可遺傳變異,在人類基因組中廣泛存在。整個人類基因組中每200-300bp就會有一個SNP變異,占所有已知多態(tài)性的80%以上。在多種SNPs突變類型中,發(fā)生在外顯子區(qū)域的非同義替換（nsSNPs）會引起轉錄或翻譯的機制改變,導致蛋白質二級序列改變,從而影響蛋白質的正�；蛘{控和原始功能。所以,nsSNPs會導致多種類型的疾病,是非常有害的單核苷酸變異。在以往的研究看來,實驗是無法在分子機制上探究突變是如何對KRAS基因和蛋白質產生影響的。本課題通過計算篩選和分子動力學方法研究了KRAS基因中與肺癌相關的nsSNPs突變,解決了上述這一問題。我們使用經過高度訓練和優(yōu)化的計... 

【文章來源】：上海交通大學上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

各種癌癥發(fā)病率和死亡率的百分比[3]

上海交通大學碩士學位論文3三重要癌癥類型。就死亡的人數來說，肝癌、胃癌是除了肺癌之外，死亡人數最多的另外兩種癌癥。在女性的惡性腫瘤中，患病與死亡人數最多的是乳腺癌這種惡性腫瘤，結直腸癌和肺癌是患病和死亡人數排名第二的癌癥類型。排名第四的是患宮頸癌，其患病人數和因它死亡的人數見圖1-2。在中國的所有惡性腫瘤中，患肺癌和因此去世的人數也是最多的，在剛過去的幾年里，患肺癌的數量越來越多，逐年增長，極大的威脅著人類的健康。所以惡性腫瘤的研究是醫(yī)學及科研人員需要攻克的一個重大難題，也是受到關注的重點方向。然而就目前的階段而言，各種癌癥的發(fā)病原因、治療程序等尚不清楚，因此，對惡性腫瘤的研究顯得非常有必要的，且迫在眉睫。特別是患病和死亡人數排名第一的肺癌。圖1-1各種癌癥發(fā)病率和死亡率的百分比[3]Fig.1-1Percentageofmorbidityandmortalityofvariouscancers圖1-2全世界所有年齡段的男性、女性癌癥發(fā)病率和死亡人數估計[3]Fig.1-2EstimatesofcancerincidenceandmortalityinmenandwomenofallagesworldwideTotal:9555027Total:18078957

上海交通大學碩士學位論文8圖1-3Ras的信號通路圖[10]Fig.1-3TheRassignallingpathway1.4單核苷酸多態(tài)性（SNP）1.4.1SNP含義和特點單核苷酸多態(tài)性(SNPs)是在生物體的基因組中存在的一種可以被遺傳的重要突變[24]，90％以上的遺傳多態(tài)性都屬于單核苷酸多態(tài)性。SNP通常發(fā)生在同類生物不同個體之間的同一個等位DNA序列上，是指由于一個核苷酸的插入、缺失或被替代變成其它核苷酸，進而造成差異的現象[25,26]。在人類中的整個基因組中每200-300bp就會有一個SNP變異[27]。在人類中SNP存在一定的頻率（>1%）[28]，所以人類的基因組才會出現多樣性。有一些SNP被稱為是功能性的，這些SNP突變會導致其編碼表達的蛋白質功能發(fā)生變化。在多種突變類型中，發(fā)生在外顯子區(qū)域突變的非同義替換(nsSNP)會使轉錄或翻譯的機制改變，導致蛋白質二級序列改變，從而影響蛋白質的正�；蛘{控或自然功能，進而引起有機體的許多疾


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