毛果楊HDA903基因的克隆及功能分析
發(fā)布時間:2021-07-11 03:48
組蛋白去乙;福╤istone deacetylase,HDAC)在植物生長、發(fā)育和脅迫應答反應中具有重要的作用。HDAC催化組蛋白去乙酰化,能夠影響染色質的結構,調節(jié)基因的轉錄。目前,有關木本植物HDAC在鹽脅迫應答反應中的功能研究鮮有報道。本研究從毛果楊中克隆了 HDAC的RPD3/HDA1亞家族基因HDA903,研究了其蛋白質序列、基因的表達與功能。(1)毛果楊HDA903基因的ORF序列長度為1506 bp,其編碼的蛋白質含有501個氨基酸,該蛋白質的等電點為5.26,屬于穩(wěn)定、親水性蛋白質。在該蛋白質的N端存在一個HDAC結構域,系統(tǒng)進化樹分析表明毛果楊HDA903蛋白與胡楊HDA19親緣關系較近。(2)利用熒光定量PCR方法分析HDA903基因的表達。HDA903基因能夠在毛果楊不同器官中表達,但不具有組織特異性。對HDA903基因在ABA、鹽和低溫脅迫下的表達進行分析,表明鹽脅迫抑制HDA903的表達,低溫誘導HDA903的表達,ABA也能夠調節(jié)HDA903的表達。(3)通過構建HDA903-GFP載體,利用基因槍轟擊法將融合基因導入洋蔥表皮細胞中,觀察熒光信號。結果顯...
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?基因片段的PCR擴增??注:M:?DL?2000?Marker;?1:?//DJ905編碼區(qū)片段擴增結果??
殘基數(shù)目(Asp+Glu)為77,正電氨基酸殘基數(shù)目??(Arg+Lys)為53,不穩(wěn)定指數(shù)是35.29,此值不超過40,即為穩(wěn)定蛋白質。綜上結果??表明,HDA903蛋白為穩(wěn)定親水性蛋白。??ProtScals?output?for?user?sequence??3?'?I???Uphob.?/?Kyte?G.?Doolittle?—— ̄??K卿鴨議.??-4????????????0?100?200?300?400?500??Position??圖3?HDA903蛋白的親/疏水性分析??2_3.3_2?HDA903蛋白的跨膜區(qū)及磷酸化位點分析??利用?TMHMM?Server?v.?2.0?(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在線軟件,??對HDA903蛋白進行跨膜分析。結果表明,HDA903蛋白的跨膜螺旋個數(shù)為0,因此推??測HDA903蛋白不存在跨膜區(qū)(圖4)。利用KinasePhos?2.0??(http://kinasephos.mbc.nctu.edu.tw/predict.php)預測?HDA903?蛋白可能發(fā)生憐酸化的位??點,結果顯示,HDA903蛋白有64個磷酸化位點,其中絲氨酸27個,酪氨酸23個,??蘇氨酸14個。預測HDA903蛋白受磷酸化調節(jié)。??TMHMM?posterior?probabilities?for?PtHDA903??1.2????■?■?.???1?????0.8?■??>>??0.6?■??o??Ci??0.4?■?.??0.2?■??0??1???1?1??
.??-4????????????0?100?200?300?400?500??Position??圖3?HDA903蛋白的親/疏水性分析??2_3.3_2?HDA903蛋白的跨膜區(qū)及磷酸化位點分析??利用?TMHMM?Server?v.?2.0?(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在線軟件,??對HDA903蛋白進行跨膜分析。結果表明,HDA903蛋白的跨膜螺旋個數(shù)為0,因此推??測HDA903蛋白不存在跨膜區(qū)(圖4)。利用KinasePhos?2.0??(http://kinasephos.mbc.nctu.edu.tw/predict.php)預測?HDA903?蛋白可能發(fā)生憐酸化的位??點,結果顯示,HDA903蛋白有64個磷酸化位點,其中絲氨酸27個,酪氨酸23個,??蘇氨酸14個。預測HDA903蛋白受磷酸化調節(jié)。??TMHMM?posterior?probabilities?for?PtHDA903??1.2????■?■?.???1?????0.8?■??>>??0.6?■??o??Ci??0.4?■?.??0.2?■??0??1???1?1???0?100?200?300?400?500??transmembrane???inside??outside????圖4?HDA903蛋白的跨膜區(qū)分析??2_3.3.3?HDA903蛋白二級結構與結構域分析??-10-??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]表觀遺傳學研究進展[J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學:生命科學. 2017(01)
[2]植物組蛋白乙酰基轉移酶的研究進展[J]. 夏德安,劉春娟,呂世博,張彥妮,劉奕佳,馬旭俊. 生物技術通報. 2015(07)
[3]植物表觀遺傳學研究進展[J]. 韋榮昌,唐其,馬小軍,趙歡,覃喜軍,涂冬萍. 北方園藝. 2013(18)
[4]組蛋白去乙;敢种苿┭芯窟M展[J]. 譚玉梅,黃文淵,余聶芳. 藥學學報. 2009(10)
本文編號:3277272
【文章來源】:東北林業(yè)大學黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:52 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1?基因片段的PCR擴增??注:M:?DL?2000?Marker;?1:?//DJ905編碼區(qū)片段擴增結果??
殘基數(shù)目(Asp+Glu)為77,正電氨基酸殘基數(shù)目??(Arg+Lys)為53,不穩(wěn)定指數(shù)是35.29,此值不超過40,即為穩(wěn)定蛋白質。綜上結果??表明,HDA903蛋白為穩(wěn)定親水性蛋白。??ProtScals?output?for?user?sequence??3?'?I???Uphob.?/?Kyte?G.?Doolittle?—— ̄??K卿鴨議.??-4????????????0?100?200?300?400?500??Position??圖3?HDA903蛋白的親/疏水性分析??2_3.3_2?HDA903蛋白的跨膜區(qū)及磷酸化位點分析??利用?TMHMM?Server?v.?2.0?(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在線軟件,??對HDA903蛋白進行跨膜分析。結果表明,HDA903蛋白的跨膜螺旋個數(shù)為0,因此推??測HDA903蛋白不存在跨膜區(qū)(圖4)。利用KinasePhos?2.0??(http://kinasephos.mbc.nctu.edu.tw/predict.php)預測?HDA903?蛋白可能發(fā)生憐酸化的位??點,結果顯示,HDA903蛋白有64個磷酸化位點,其中絲氨酸27個,酪氨酸23個,??蘇氨酸14個。預測HDA903蛋白受磷酸化調節(jié)。??TMHMM?posterior?probabilities?for?PtHDA903??1.2????■?■?.???1?????0.8?■??>>??0.6?■??o??Ci??0.4?■?.??0.2?■??0??1???1?1??
.??-4????????????0?100?200?300?400?500??Position??圖3?HDA903蛋白的親/疏水性分析??2_3.3_2?HDA903蛋白的跨膜區(qū)及磷酸化位點分析??利用?TMHMM?Server?v.?2.0?(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在線軟件,??對HDA903蛋白進行跨膜分析。結果表明,HDA903蛋白的跨膜螺旋個數(shù)為0,因此推??測HDA903蛋白不存在跨膜區(qū)(圖4)。利用KinasePhos?2.0??(http://kinasephos.mbc.nctu.edu.tw/predict.php)預測?HDA903?蛋白可能發(fā)生憐酸化的位??點,結果顯示,HDA903蛋白有64個磷酸化位點,其中絲氨酸27個,酪氨酸23個,??蘇氨酸14個。預測HDA903蛋白受磷酸化調節(jié)。??TMHMM?posterior?probabilities?for?PtHDA903??1.2????■?■?.???1?????0.8?■??>>??0.6?■??o??Ci??0.4?■?.??0.2?■??0??1???1?1???0?100?200?300?400?500??transmembrane???inside??outside????圖4?HDA903蛋白的跨膜區(qū)分析??2_3.3.3?HDA903蛋白二級結構與結構域分析??-10-??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]表觀遺傳學研究進展[J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學:生命科學. 2017(01)
[2]植物組蛋白乙酰基轉移酶的研究進展[J]. 夏德安,劉春娟,呂世博,張彥妮,劉奕佳,馬旭俊. 生物技術通報. 2015(07)
[3]植物表觀遺傳學研究進展[J]. 韋榮昌,唐其,馬小軍,趙歡,覃喜軍,涂冬萍. 北方園藝. 2013(18)
[4]組蛋白去乙;敢种苿┭芯窟M展[J]. 譚玉梅,黃文淵,余聶芳. 藥學學報. 2009(10)
本文編號:3277272
本文鏈接:http://www.sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3277272.html
最近更新
教材專著