目的運用生物信息學方法篩選及鑒定腎透明細胞癌（ccRCC）相關的潛在靶基因及信號通路。方法在GEO網(wǎng)站搜索基因芯片GSE40435、GSE53757、GSE46699和GSE16441的數(shù)據(jù)集,用GEO2R識別ccRCC和正常腎組織之間的差異表達基因,并對4組數(shù)據(jù)的共同差異表達基因進行聚類分析。然后用DAVID網(wǎng)站對差異基因進行基因本體（gene ontology）分析和KEGG通路富集分析,最后用STRING網(wǎng)站和Cytoscape軟件構建蛋白-蛋白互作（PPI）網(wǎng)絡,同時從中篩選出最具有意義的模塊及核心基因。結果與正常腎組織相比,共計101個基因在4組ccRCC中差異表達,其中33個基因高表達,68個基因低表達�；虮倔w分析顯示大部分差異表達基因在脂質代謝、跨膜轉運、通道活性和胞外區(qū)中顯著富集,信號通路分析表明差異表達基因在代謝和黏附分子信號途徑中有共同的通路。從PPI網(wǎng)絡中共挑選出的10個核心基因全部都參與黏著斑信號通路。結論被鑒定出的10個核心基因很可能在ccRCC的發(fā)病過程中發(fā)揮重要的作用,這些基因可能成為治療的新靶點。 

【文章來源】：現(xiàn)代泌尿外科雜志. 2020,25(12)

【文章頁數(shù)】：8 頁

【部分圖文】：

共同差異表達基因DEGs圖

以GSE16441為參考所繪DEGs熱圖

三個功能組的基因表達量圖


本文編號：3261536