目的對一個表皮松解性掌跖角化癥（EPPK）家系進(jìn)行基因突變檢測,為該家系成員提供臨床遺傳咨詢,并初步探討該家系患者特殊表型指節(jié)墊、指關(guān)節(jié)彎曲與KRT9基因突變的相關(guān)性。方法收集該家系中的先證者、先證者的父親及舅舅三人的外周血并提取基因組DNA。對以上三位家系成員進(jìn)行全外顯子組測序（WES）,通過突變位點(diǎn)頻率、突變類型、是否改變剪接或編碼氨基酸進(jìn)行篩選,并按照常染色體顯性遺傳方式篩選雜合突變,然后在家系內(nèi)進(jìn)行共分離分析,針對候選基因表達(dá)及已知功能分析,得到候選基因突變位點(diǎn),并進(jìn)行Sanger測序驗(yàn)證。應(yīng)用生物信息學(xué)軟件對KRT9基因結(jié)構(gòu)域和功能域進(jìn)行分析,針對161位氨基酸位點(diǎn)改變,進(jìn)行文獻(xiàn)綜述和基因型-表型相關(guān)性探討。結(jié)果本研究報(bào)道了一個中國EPPK家系,伴有罕見的指關(guān)節(jié)屈曲表型;WES測序檢測到KRT9基因第1外顯子存在雜合突變c.482A>G（p.N161S）,該突變在家系內(nèi)與疾病表型共分離,Sanger測序驗(yàn)證與WES結(jié)果一致。利用生物信息學(xué)軟件預(yù)測到N161突變成S161后,角蛋白9的無規(guī)則卷曲發(fā)生空間位置改變,α螺旋結(jié)構(gòu)有明顯缺少,突變位點(diǎn)附近氫鍵數(shù)量增加,鍵長變長。對... 

【文章來源】：解剖科學(xué)進(jìn)展. 2020,26(05)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 研究對象
    1.2 標(biāo)本的采集和DNA提取
    1.3 WES測序和數(shù)據(jù)分析
    1.4 PCR擴(kuò)增候選突變位點(diǎn)及Sanger測序分析
    1.5 生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果
    2.1 EPPK家系情況及患者臨床表型
    2.2 WES測序結(jié)果分析和Sanger測序驗(yàn)證
    2.3 突變位點(diǎn)生物信息學(xué)分析
3 討論



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