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胃癌發(fā)生和轉(zhuǎn)移相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組分析及COL10A1促胃癌轉(zhuǎn)移的研究

發(fā)布時(shí)間:2021-06-25 00:47
  研究目的和意義:盡管在過去幾十年中手術(shù)和化療在腫瘤治療上取得很大進(jìn)展,但胃癌(GC)仍是全球癌癥相關(guān)死亡率的第三大常見原因,其占所有癌癥相關(guān)死亡人數(shù)的8.8%。早期檢測中缺乏生物標(biāo)志物和發(fā)生腹膜轉(zhuǎn)移是胃癌治療失敗的主要原因。所以找到預(yù)測疾病進(jìn)展的分子生物標(biāo)志物可能促進(jìn)胃癌藥物的開發(fā)和治療策略的改善。研究方法:高通量mRNA測序(RNA-seq)結(jié)果顯示X型膠原蛋白1(COL10A1)是疾病進(jìn)展相關(guān)基因。103例胃癌患者的組織樣本QPCR分析結(jié)果顯示,COL10A1 mRNA高表達(dá)與胃癌轉(zhuǎn)移和存活率降低存在顯著相關(guān)性。我們使用UCSC基因組網(wǎng)站和JASPAR數(shù)據(jù)庫分析COL10A1的啟動子序列,預(yù)測潛在的轉(zhuǎn)錄因子SOX9結(jié)合位點(diǎn)。收集胃癌患者的癌組織和對應(yīng)的正常胃粘膜組織,利用免疫組化技術(shù)進(jìn)行SOX9和COL10A1表達(dá)的定位定量檢測分析。同時(shí),收集受檢患者的臨床資料及隨訪生存預(yù)后的相關(guān)信息。接著通過QPCR和Western blot實(shí)驗(yàn)分別在轉(zhuǎn)錄水平和翻譯水平驗(yàn)證SOX9和COL10A1的臨床相關(guān)性。構(gòu)建過表達(dá)COL10A1和敲低COL10A1的穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株,同時(shí)用轉(zhuǎn)化生長因子-β1(T... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:209 頁

【學(xué)位級別】:博士

【部分圖文】:

胃癌發(fā)生和轉(zhuǎn)移相關(guān)的轉(zhuǎn)錄組分析及COL10A1促胃癌轉(zhuǎn)移的研究


圖1-1胃癌組織和相應(yīng)正常胃粘膜組織HE染色??結(jié)果分別以xlOO,?x2〇〇顯示

分布概況,差異表達(dá)基因


胃粘膜和胃癌組織之間有58種差異表達(dá)基因,有50?(86.2%)種基因表達(dá)上調(diào),??8?(13.8%)種基因表達(dá)下調(diào)。分組間差異基因的結(jié)果見表1-8、表1-9、表1-10、??表1-11、圖1-3和圖1-4。??表1-8分組間差異基因的個(gè)數(shù)??Table?1-8?Number?of?differentially?expressed?genes?between?groups??Pairs?DiffGene(Up)?DiffGene(Down)?AH?DiffGene??EGN-vs-EGT?2800?(93.5%)?194?(6.5%)?2994??AGN-vs-AGT?50?(86.2%)?8?(13.8%)?58??表1-8各項(xiàng)指標(biāo)說明??Term?意義??Pairs?成對比較??DiffGene(Up)?顯著上調(diào)的差異基因個(gè)數(shù)??DiffGene(Down)?顯著下調(diào)的差異基因個(gè)數(shù)??All?DiffGene?顯著差異表達(dá)的基因數(shù)目??28??

維恩圖,腫瘤分期,差異表達(dá)基因,火山


以幫助我們了解差異表達(dá)基因的整體分布情況;鹕綀D中紅色的點(diǎn)代表顯著差??異表達(dá)上調(diào)的基因,綠色的點(diǎn)代表顯著差異表達(dá)下調(diào)的基因,黑色的點(diǎn)代表非顯??著性差異表達(dá)的基因。早期胃癌組和晚期胃癌組的火山圖見


本文編號:3248153

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