野生稻長芒新基因Awn8的精細定位和候選基因分析
發(fā)布時間:2021-06-19 14:47
芒普遍存在于野生稻中,可以幫助種子散布,同時防止鳥獸啄食。現(xiàn)代栽培稻一般為無芒或個別短芒,水稻長芒性狀的喪失是水稻馴化的重要事件之一,開展水稻芒發(fā)育相關(guān)基因的定位、克隆及分子調(diào)控的研究,對深入了解芒的遺傳基礎(chǔ)、發(fā)育機制及水稻的馴化機制具有重要意義。此外,芒作為與株高、穗型、粒色等類似的直觀形態(tài)標記,了解其形態(tài)發(fā)生的遺傳機制可為形態(tài)標記在水稻品種選育的利用積累資料,也可為其他植物的功能基因研究提供理論依據(jù)。本研究利用廣西普通野生稻DP15和秈稻9311構(gòu)建染色體片段代換系庫,獲得以9311為背景的的高代回交群體(>BC5代),從中篩選出遺傳穩(wěn)定的具有長芒表型的代換系XL138,通過遺傳分離大群體的構(gòu)建和多輪的分子標記設(shè)計,對存在于XL138的長芒性狀基因進行了精細定位,并對定位區(qū)域的候選基因進行了預(yù)測,發(fā)現(xiàn)XL138攜帶的長芒基因是一個新的基因位點,命名為Awn8。主要的研究結(jié)果如下:(1)染色體片段代換系XL138的性狀分析。以輪回親本9311作比較,對染色體片段代換系XL138和9311進行表型分析,表明代換系XL138和9311在株高、分蘗數(shù)和每穗粒數(shù)上不存在顯著性差異,芒長...
【文章來源】:廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1野生稻長刺芒可以保護種子不被鳥啄食(華磊,2015)??A:具有長芒的野生稻在種子灌漿后沒有受到鳥類的啄食,右下角為其主莖穗特寫;??
野生稻長芒新基因dlTO#的精細定位和候選基因分析??芒的有無和長短與抗蟲害也有關(guān)系,長芒對鳥類有一種重要的震懾作用,水稻??籽粒無芒、短芒及無刺芒會遭受大量鳥的捕食(圖1A),相反水稻籽粒有芒、長芒??及有刺芒就很大程度上免受鳥類的捕食(圖〗B)。??■■祕r??7?4?2?Nk>?awn??F?Awn?length?(cm)??■1??圖1-2水稻帶芒籽粒的粘附實驗和自由落體實驗(華磊,2015)??A-C:芒的粘附實驗(A:具7cm刺芒的種了粘附在羊毛織物上的比例為?80%:?B:具2cm短光芒??的種子粘附在羊毛織物上的比例?45%;?C:芒刺能顯著提高粘附比例);D-F:帶芒種子0.5?m高處的??自由落體實驗(D:具7?cm芒的種子90%的種子能夠直立于培養(yǎng)基;E:具有2?cm短芒的種子在培養(yǎng)??基上保持直立的比例較低40%;?F:芒長的增加能夠顯著提高內(nèi)我種植的比例)??Fig.?1-2?The?adhesion?and?free?fall?experiments?of?rice?grains?with?long
野生稻長芒新基因乂》7於的精細定位和候選基因分析??面的角度不同,長芒的種子從高處下落后能夠保持直立的概率遠遠大于短芒和無芒??的(圖1-2?D-F),因此長芒能夠幫助種子在下落時保持直立,有利于種子的萌發(fā)和??幼苗的形態(tài)建成。??圖1-3吸濕芒的機構(gòu)和傳播體的運動原理(李哲等2015,?Elbaume丨aL,2007)??左:(a)野麥麥芒的橫截面;(b)老鸛草芒的橫截面;(c)野燕麥麥芒的橫截面;右:I:種子和部分??芒進入土壤中,紅色箭頭表示其中一個芒刺;T丨:由于濕度的增加,芒拉直。固著在芒上的芒刺??阻止向上運動,因此,種子向下移動一段距離d,解釋了在I中增加垂直方向的長度:丨II:環(huán)境??干燥后,芒又彎曲,縮短了在垂直方向上的長度,因為芒刺鎖住位置,種子不能往后向上運??動
【參考文獻】:
期刊論文
[1]多環(huán)境下陸地棉染色體片段代換系及F1皮棉產(chǎn)量與纖維品質(zhì)的表型分析[J]. 黎波濤,石玉真,龔舉武,李俊文,劉愛英,王濤,商海紅,鞏萬奎,陳婷婷,葛群,張金鳳,王永波,胡玉樞,袁有祿. 棉花學報. 2016(01)
[2]植物吸濕芒的結(jié)構(gòu)及其運動的力學機制綜述[J]. 李哲,劉溪源,徐獻忠. 應(yīng)用力學學報. 2015(04)
[3]2013年中國植物科學若干領(lǐng)域重要研究進展[J]. 袁明,瞿禮嘉,王小菁,錢前,楊維才,王臺,孔宏智,蔣高明,種康. 植物學報. 2014(04)
[4]基于染色體單片段代換系的水稻芒性QTL定位[J]. 王軍,朱金燕,周勇,楊杰,范方軍,李文奇,梁國華,仲維功. 華北農(nóng)學報. 2013(03)
[5]利用磁珠富集馬鈴薯BAC文庫中NBS-LRR類晚疫病抗性基因[J]. 徐建飛,金黎平,龐萬福,卞春松,段紹光,劉杰,黃三文,屈冬玉. 作物學報. 2011(05)
[6]中國作物新基因發(fā)掘:現(xiàn)狀、挑戰(zhàn)與展望[J]. 邱麗娟,郭勇,黎裕,王曉波,周國安,劉章雄,周時榮,李新海,馬有志,王建康,萬建民. 作物學報. 2011(01)
[7]利用近等基因系對水稻芒基因AWN3-1的遺傳定位[J]. 姚國新,張強,吳建濤,胡廣隆,李自超. 中國農(nóng)業(yè)大學學報. 2010(05)
[8]關(guān)聯(lián)分析定位水稻第4號染色體的芒性基因并結(jié)合連鎖分析精細定位Awn4.1[J]. 胡廣隆,張冬玲,潘慧喬,李本,吳建濤,周雪崖,張群遠,周雷,姚國新,李俊周,李金杰,張洪亮,李自超. 科學通報. 2010(Z2)
[9]圖位克隆技術(shù)在農(nóng)作物基因分離中的應(yīng)用與評價[J]. 何俊平,阮松林,祝水金,馬華升. 遺傳. 2010(09)
[10]利用染色體單片段置換系對水稻芒性狀的4個QTLs進行定位分析[J]. 林靜,朱文銀,張亞東,朱鎮(zhèn),趙凌,陳濤,趙慶勇,周麗慧,方先文,王艷平,王才林. 分子植物育種. 2010(03)
博士論文
[1]野生稻長、刺芒基因的克隆及其分子演化[D]. 華磊.中國農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]甘藍型油菜含油量QTLs定位及候選基因篩選[D]. 孫美玉.中國農(nóng)業(yè)科學院 2012
[3]馬鈴薯抗晚疫病主效位點的基因定位和遺傳分析[D]. 徐建飛.中國農(nóng)業(yè)科學院 2008
[4]甘藍型油菜遺傳圖譜的構(gòu)建和品質(zhì)相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 付福友.西南大學 2007
碩士論文
[1]利用OsPHR3培育磷高效轉(zhuǎn)基因水稻的研究[D]. 李長英.浙江大學 2014
[2]鯉遺傳—物理整合圖譜的構(gòu)建及鯉與斑馬魚的比較作圖[D]. 趙蘭.大連海洋大學 2013
[3]基于EMA-PCR/qPCR的檢疫性有害生物傳病風險評估新技術(shù)的建立[D]. 熊書.重慶大學 2013
[4]利用黑殼子粳/蘇御糯重組自交系群體分析部分農(nóng)藝性狀的QTL[D]. 賈豐羽.南京農(nóng)業(yè)大學 2012
[5]水稻光溫敏不育系DS的遺傳分析與基因定位[D]. 王嫘.天津科技大學 2012
[6]黃瓜無側(cè)枝基因nlb的定位及矮牽牛種質(zhì)資源多樣性分析[D]. 吳志祥.上海交通大學 2012
[7]山西省華北落葉松天然種群遺傳多樣性的AFLP分析[D]. 李曉楠.山西大學 2011
[8]球毛殼ND35菌株在植物上的侵染、定殖檢測和對植物生長的影響[D]. 戴楊.山東農(nóng)業(yè)大學 2011
[9]水稻Ds插入具芒突變體的鑒定與相關(guān)基因的克隆[D]. 張楠.蘇州大學 2011
[10]28個小麥微核心種質(zhì)的抗葉銹性分析[D]. 丁艷紅.河北農(nóng)業(yè)大學 2010
本文編號:3238013
【文章來源】:廣西大學廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁數(shù)】:87 頁
【學位級別】:博士
【部分圖文】:
圖1-1野生稻長刺芒可以保護種子不被鳥啄食(華磊,2015)??A:具有長芒的野生稻在種子灌漿后沒有受到鳥類的啄食,右下角為其主莖穗特寫;??
野生稻長芒新基因dlTO#的精細定位和候選基因分析??芒的有無和長短與抗蟲害也有關(guān)系,長芒對鳥類有一種重要的震懾作用,水稻??籽粒無芒、短芒及無刺芒會遭受大量鳥的捕食(圖1A),相反水稻籽粒有芒、長芒??及有刺芒就很大程度上免受鳥類的捕食(圖〗B)。??■■祕r??7?4?2?Nk>?awn??F?Awn?length?(cm)??■1??圖1-2水稻帶芒籽粒的粘附實驗和自由落體實驗(華磊,2015)??A-C:芒的粘附實驗(A:具7cm刺芒的種了粘附在羊毛織物上的比例為?80%:?B:具2cm短光芒??的種子粘附在羊毛織物上的比例?45%;?C:芒刺能顯著提高粘附比例);D-F:帶芒種子0.5?m高處的??自由落體實驗(D:具7?cm芒的種子90%的種子能夠直立于培養(yǎng)基;E:具有2?cm短芒的種子在培養(yǎng)??基上保持直立的比例較低40%;?F:芒長的增加能夠顯著提高內(nèi)我種植的比例)??Fig.?1-2?The?adhesion?and?free?fall?experiments?of?rice?grains?with?long
野生稻長芒新基因乂》7於的精細定位和候選基因分析??面的角度不同,長芒的種子從高處下落后能夠保持直立的概率遠遠大于短芒和無芒??的(圖1-2?D-F),因此長芒能夠幫助種子在下落時保持直立,有利于種子的萌發(fā)和??幼苗的形態(tài)建成。??圖1-3吸濕芒的機構(gòu)和傳播體的運動原理(李哲等2015,?Elbaume丨aL,2007)??左:(a)野麥麥芒的橫截面;(b)老鸛草芒的橫截面;(c)野燕麥麥芒的橫截面;右:I:種子和部分??芒進入土壤中,紅色箭頭表示其中一個芒刺;T丨:由于濕度的增加,芒拉直。固著在芒上的芒刺??阻止向上運動,因此,種子向下移動一段距離d,解釋了在I中增加垂直方向的長度:丨II:環(huán)境??干燥后,芒又彎曲,縮短了在垂直方向上的長度,因為芒刺鎖住位置,種子不能往后向上運??動
【參考文獻】:
期刊論文
[1]多環(huán)境下陸地棉染色體片段代換系及F1皮棉產(chǎn)量與纖維品質(zhì)的表型分析[J]. 黎波濤,石玉真,龔舉武,李俊文,劉愛英,王濤,商海紅,鞏萬奎,陳婷婷,葛群,張金鳳,王永波,胡玉樞,袁有祿. 棉花學報. 2016(01)
[2]植物吸濕芒的結(jié)構(gòu)及其運動的力學機制綜述[J]. 李哲,劉溪源,徐獻忠. 應(yīng)用力學學報. 2015(04)
[3]2013年中國植物科學若干領(lǐng)域重要研究進展[J]. 袁明,瞿禮嘉,王小菁,錢前,楊維才,王臺,孔宏智,蔣高明,種康. 植物學報. 2014(04)
[4]基于染色體單片段代換系的水稻芒性QTL定位[J]. 王軍,朱金燕,周勇,楊杰,范方軍,李文奇,梁國華,仲維功. 華北農(nóng)學報. 2013(03)
[5]利用磁珠富集馬鈴薯BAC文庫中NBS-LRR類晚疫病抗性基因[J]. 徐建飛,金黎平,龐萬福,卞春松,段紹光,劉杰,黃三文,屈冬玉. 作物學報. 2011(05)
[6]中國作物新基因發(fā)掘:現(xiàn)狀、挑戰(zhàn)與展望[J]. 邱麗娟,郭勇,黎裕,王曉波,周國安,劉章雄,周時榮,李新海,馬有志,王建康,萬建民. 作物學報. 2011(01)
[7]利用近等基因系對水稻芒基因AWN3-1的遺傳定位[J]. 姚國新,張強,吳建濤,胡廣隆,李自超. 中國農(nóng)業(yè)大學學報. 2010(05)
[8]關(guān)聯(lián)分析定位水稻第4號染色體的芒性基因并結(jié)合連鎖分析精細定位Awn4.1[J]. 胡廣隆,張冬玲,潘慧喬,李本,吳建濤,周雪崖,張群遠,周雷,姚國新,李俊周,李金杰,張洪亮,李自超. 科學通報. 2010(Z2)
[9]圖位克隆技術(shù)在農(nóng)作物基因分離中的應(yīng)用與評價[J]. 何俊平,阮松林,祝水金,馬華升. 遺傳. 2010(09)
[10]利用染色體單片段置換系對水稻芒性狀的4個QTLs進行定位分析[J]. 林靜,朱文銀,張亞東,朱鎮(zhèn),趙凌,陳濤,趙慶勇,周麗慧,方先文,王艷平,王才林. 分子植物育種. 2010(03)
博士論文
[1]野生稻長、刺芒基因的克隆及其分子演化[D]. 華磊.中國農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]甘藍型油菜含油量QTLs定位及候選基因篩選[D]. 孫美玉.中國農(nóng)業(yè)科學院 2012
[3]馬鈴薯抗晚疫病主效位點的基因定位和遺傳分析[D]. 徐建飛.中國農(nóng)業(yè)科學院 2008
[4]甘藍型油菜遺傳圖譜的構(gòu)建和品質(zhì)相關(guān)性狀的QTL分析[D]. 付福友.西南大學 2007
碩士論文
[1]利用OsPHR3培育磷高效轉(zhuǎn)基因水稻的研究[D]. 李長英.浙江大學 2014
[2]鯉遺傳—物理整合圖譜的構(gòu)建及鯉與斑馬魚的比較作圖[D]. 趙蘭.大連海洋大學 2013
[3]基于EMA-PCR/qPCR的檢疫性有害生物傳病風險評估新技術(shù)的建立[D]. 熊書.重慶大學 2013
[4]利用黑殼子粳/蘇御糯重組自交系群體分析部分農(nóng)藝性狀的QTL[D]. 賈豐羽.南京農(nóng)業(yè)大學 2012
[5]水稻光溫敏不育系DS的遺傳分析與基因定位[D]. 王嫘.天津科技大學 2012
[6]黃瓜無側(cè)枝基因nlb的定位及矮牽牛種質(zhì)資源多樣性分析[D]. 吳志祥.上海交通大學 2012
[7]山西省華北落葉松天然種群遺傳多樣性的AFLP分析[D]. 李曉楠.山西大學 2011
[8]球毛殼ND35菌株在植物上的侵染、定殖檢測和對植物生長的影響[D]. 戴楊.山東農(nóng)業(yè)大學 2011
[9]水稻Ds插入具芒突變體的鑒定與相關(guān)基因的克隆[D]. 張楠.蘇州大學 2011
[10]28個小麥微核心種質(zhì)的抗葉銹性分析[D]. 丁艷紅.河北農(nóng)業(yè)大學 2010
本文編號:3238013
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