厚殼貽貝IRAKs基因克隆及相關(guān)免疫功能探究
發(fā)布時(shí)間:2021-05-31 17:30
隨著人類(lèi)對(duì)海產(chǎn)品需求量的增大,海水養(yǎng)殖發(fā)展不斷加速,而伴隨著經(jīng)濟(jì)的發(fā)展,沿海工業(yè)化也愈發(fā)迅速,導(dǎo)致海水養(yǎng)殖環(huán)境不斷惡化,而近海水域的生態(tài)環(huán)境對(duì)貝類(lèi)養(yǎng)殖業(yè)經(jīng)濟(jì)發(fā)展至關(guān)重要。因此,研究海洋貝類(lèi)的免疫生物學(xué)機(jī)制將為其健康養(yǎng)殖提供重要理論依據(jù)。厚殼貽貝(Mytilus coruscus)作為濾食性動(dòng)物,分布廣泛,生長(zhǎng)能力強(qiáng),但活動(dòng)能力差,在日常環(huán)境中廣泛接觸海洋環(huán)境中各種病原微生物,但由此引發(fā)的疾病感染并不多見(jiàn),說(shuō)明其體內(nèi)存在較強(qiáng)的抗菌感染機(jī)制,因此研究厚殼貽貝的天然免疫防御機(jī)制將為其健康養(yǎng)殖提供重要理論參考。白細(xì)胞介素1受體相關(guān)激酶(IRAKs)是Toll樣受體(TLR)介導(dǎo)的信號(hào)通路的重要接頭分子,在生物的天然免疫系統(tǒng)中起重要作用。因此,本論文對(duì)厚殼貽貝TLR信號(hào)通路中的免疫因子IRAK進(jìn)行了鑒定、系統(tǒng)進(jìn)化分析及相關(guān)表達(dá)機(jī)制和體外蛋白表達(dá)研究,主要取得的研究結(jié)果如下:1.本文基于厚殼貽貝轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),獲得了白細(xì)胞介素1受體相關(guān)激酶a(命名為McIRAK-a,GenBank登錄號(hào):MK592614)和b(命名為McIRAK-b,GenBank登錄號(hào):MK592615)的cDNA全長(zhǎng)序列,McI...
【文章來(lái)源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
厚殼貽貝鰓組織RNA凝膠電泳圖
第二章厚殼貽貝IRAK-a基因克隆與序列分析192.3結(jié)果與討論2.3.1RNA提取結(jié)果實(shí)驗(yàn)通過(guò)Trizol法成功提取厚殼貽貝的鰓組織得RNA,將獲得的RNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳用紫外凝膠成像系統(tǒng)分析條帶。如圖2-1,28SrRNA、18SrRNA和5SrRNA條帶都很明顯,微量核酸蛋白檢測(cè)儀對(duì)總RNA濃度和質(zhì)量的檢測(cè)顯示,OD260/280比值均處于1.8-2.1之間,OD260/230處在2.0-2.4之間,提示此法適用于厚殼貽貝總RNA的提取,并可以用于cDNA第一鏈合成。圖2-1厚殼貽貝鰓組織RNA凝膠電泳圖Fig2.1ResultsofelectrophoreticdetectionofRNAfromgillstissueofM.coruscus2.3.2McIRAK-a核心片段擴(kuò)增結(jié)果以McIRAK-a核心片段設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行溫度梯度PCR擴(kuò)增,所得目的片段約700bp,符合預(yù)期設(shè)計(jì)片段大小,割膠回收后,送公司測(cè)序,并將送測(cè)結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì),結(jié)果顯示為目標(biāo)序列(圖2-2)。圖2-2McIRAK-a核心片段PCR產(chǎn)物注:M表示DNAMarkerDL1000Fig2.2McIRAK-acorefragmentPCRproductNote:MmeansDNAMarkerDL1000
第二章厚殼貽貝IRAK-a基因克隆與序列分析21圖2-3A厚殼貽貝IRAK-a的全長(zhǎng)序列分析注:起始密碼子ATG用黑色線框表示,終止密碼子TAA用星號(hào)*表示。下劃線標(biāo)注的為IRAK-a結(jié)構(gòu)域。灰色區(qū)域表示蛋白激酶ATP結(jié)合位點(diǎn)和絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶的活性位點(diǎn)。綠色,藍(lán)色和黃色分別表示絲氨酸位點(diǎn),酪氨酸位點(diǎn)和蘇氨酸位點(diǎn)。Fig2.3AFull-lengthsequenceanalysisofIRAK-ainM.coruscusNote:ThestartcodonATGisindicatedbyablackwireframe,andthestopcodonTAAisindicatedbyanasterisk*.TheIRAK-adomainisunderlined.ThegrayareaindicatestheproteinkinaseATPbindingsiteandtheactivesiteofserine/threonineproteinkinase.Green,blueandyellowindicateserine,tyrosineandthreoninesites,respectively.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]厚殼貽貝人工育苗技術(shù)[J]. 孫景偉,代紅梅,孫吉東. 河北漁業(yè). 2018(06)
[2]厚殼貽貝人工苗種海上暫養(yǎng)試驗(yàn)[J]. 柯愛(ài)英,黃振華,蔡景波,王瑤華,陳星星. 科學(xué)養(yǎng)魚(yú). 2015(04)
[3]重金屬脅迫下厚殼貽貝谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)分析[J]. 劉慧慧,何建瑜,趙榮濤,薛超波. 海洋與湖沼. 2014(02)
[4]先天免疫模式識(shí)別受體與病毒感染的研究進(jìn)展[J]. 孫學(xué)華,金樹(shù)根,李曼,朱曉駿,商斌儀,高月求. 中華傳染病雜志. 2012 (05)
[5]IRAK家族在TLR介導(dǎo)的信號(hào)通路中的功能和意義[J]. 尹衛(wèi)國(guó),肖建華. 中南醫(yī)學(xué)科學(xué)雜志. 2012(02)
[6]Toll樣受體和樹(shù)突狀細(xì)胞:免疫激活傳感器——2011年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)簡(jiǎn)介[J]. 陳賽娟,王一煌. 自然雜志. 2011(06)
[7]溫州市海洋貝類(lèi)微生物污染狀況的調(diào)查[J]. 胡昕,諸葛青云,潘長(zhǎng)旺,梁韶暉,黃慧聰,譚峰. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(07)
[8]先天性免疫[J]. 鮑鎮(zhèn)美. 中華泌尿外科雜志. 2001(12)
[9]海洋貝類(lèi)病害及其研究進(jìn)展[J]. 周永燦. 海南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2000(02)
本文編號(hào):3208665
【文章來(lái)源】:浙江海洋大學(xué)浙江省
【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
厚殼貽貝鰓組織RNA凝膠電泳圖
第二章厚殼貽貝IRAK-a基因克隆與序列分析192.3結(jié)果與討論2.3.1RNA提取結(jié)果實(shí)驗(yàn)通過(guò)Trizol法成功提取厚殼貽貝的鰓組織得RNA,將獲得的RNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳用紫外凝膠成像系統(tǒng)分析條帶。如圖2-1,28SrRNA、18SrRNA和5SrRNA條帶都很明顯,微量核酸蛋白檢測(cè)儀對(duì)總RNA濃度和質(zhì)量的檢測(cè)顯示,OD260/280比值均處于1.8-2.1之間,OD260/230處在2.0-2.4之間,提示此法適用于厚殼貽貝總RNA的提取,并可以用于cDNA第一鏈合成。圖2-1厚殼貽貝鰓組織RNA凝膠電泳圖Fig2.1ResultsofelectrophoreticdetectionofRNAfromgillstissueofM.coruscus2.3.2McIRAK-a核心片段擴(kuò)增結(jié)果以McIRAK-a核心片段設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行溫度梯度PCR擴(kuò)增,所得目的片段約700bp,符合預(yù)期設(shè)計(jì)片段大小,割膠回收后,送公司測(cè)序,并將送測(cè)結(jié)果在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中比對(duì),結(jié)果顯示為目標(biāo)序列(圖2-2)。圖2-2McIRAK-a核心片段PCR產(chǎn)物注:M表示DNAMarkerDL1000Fig2.2McIRAK-acorefragmentPCRproductNote:MmeansDNAMarkerDL1000
第二章厚殼貽貝IRAK-a基因克隆與序列分析21圖2-3A厚殼貽貝IRAK-a的全長(zhǎng)序列分析注:起始密碼子ATG用黑色線框表示,終止密碼子TAA用星號(hào)*表示。下劃線標(biāo)注的為IRAK-a結(jié)構(gòu)域。灰色區(qū)域表示蛋白激酶ATP結(jié)合位點(diǎn)和絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶的活性位點(diǎn)。綠色,藍(lán)色和黃色分別表示絲氨酸位點(diǎn),酪氨酸位點(diǎn)和蘇氨酸位點(diǎn)。Fig2.3AFull-lengthsequenceanalysisofIRAK-ainM.coruscusNote:ThestartcodonATGisindicatedbyablackwireframe,andthestopcodonTAAisindicatedbyanasterisk*.TheIRAK-adomainisunderlined.ThegrayareaindicatestheproteinkinaseATPbindingsiteandtheactivesiteofserine/threonineproteinkinase.Green,blueandyellowindicateserine,tyrosineandthreoninesites,respectively.
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]厚殼貽貝人工育苗技術(shù)[J]. 孫景偉,代紅梅,孫吉東. 河北漁業(yè). 2018(06)
[2]厚殼貽貝人工苗種海上暫養(yǎng)試驗(yàn)[J]. 柯愛(ài)英,黃振華,蔡景波,王瑤華,陳星星. 科學(xué)養(yǎng)魚(yú). 2015(04)
[3]重金屬脅迫下厚殼貽貝谷胱甘肽S-轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá)分析[J]. 劉慧慧,何建瑜,趙榮濤,薛超波. 海洋與湖沼. 2014(02)
[4]先天免疫模式識(shí)別受體與病毒感染的研究進(jìn)展[J]. 孫學(xué)華,金樹(shù)根,李曼,朱曉駿,商斌儀,高月求. 中華傳染病雜志. 2012 (05)
[5]IRAK家族在TLR介導(dǎo)的信號(hào)通路中的功能和意義[J]. 尹衛(wèi)國(guó),肖建華. 中南醫(yī)學(xué)科學(xué)雜志. 2012(02)
[6]Toll樣受體和樹(shù)突狀細(xì)胞:免疫激活傳感器——2011年諾貝爾生理學(xué)或醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)簡(jiǎn)介[J]. 陳賽娟,王一煌. 自然雜志. 2011(06)
[7]溫州市海洋貝類(lèi)微生物污染狀況的調(diào)查[J]. 胡昕,諸葛青云,潘長(zhǎng)旺,梁韶暉,黃慧聰,譚峰. 南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(07)
[8]先天性免疫[J]. 鮑鎮(zhèn)美. 中華泌尿外科雜志. 2001(12)
[9]海洋貝類(lèi)病害及其研究進(jìn)展[J]. 周永燦. 海南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2000(02)
本文編號(hào):3208665
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