以十五年生‘綠嶺’核桃樹為試材,采用高通量轉錄組測序的方法,研究了不同地溫（地溫16.4℃,W0;地溫21.7℃,W1;地溫27.1℃,W2）對核桃根系基因表達量的影響,以期挖掘與溫度調控相關的功能基因,探明自然溫度調控下核桃根系的應答反應的分子機制。結果表明:W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1顯著上調基因分別為430、2 110、2 385個,顯著下調基因分別為247、2 494、3 015個。GO富集分析表明,W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差異表達基因均主要富集在生物學過程和分子功能兩大類別,共同顯著富集的GO類別有氨基糖分解代謝過程、單體生物合成過程、幾丁質分解過程、含氨基葡萄糖化合物分解代謝過程、氧化還原過程和氧化還原酶活性;但W1vsW0的差異基因顯著富集的分子功能多與物質的合成代謝相關,而W2vsW1的差異基因顯著富集的分子功能多與轉錄因子相關。KEGG富集分析表明,W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差異表達基因分別被注釋到74、118、117條KEGG代謝通路,共同被注釋到的有71條,其中顯著富集的通路有次生代謝產物的生物合成和苯丙烷生物合成等;... 

【文章來源】：北方園藝. 2020,(17)北大核心

【文章頁數】：9 頁

【部分圖文】：

差異表達基因分析火山圖

根系是植物從環(huán)境中攝取水分的主要途徑,植物根系水分傳導(LR)是根-土系統(tǒng)水分傳輸模擬和評價植物根系吸水功能的一個重要參數,它受土壤水分條件和溫度等因素的綜合影響[19]。根系吸水能力隨土壤溫度的變化會發(fā)生相應變化。根系中水分利用相關的基因表達量隨溫度升高的變化趨勢并不一致(圖5)。水通道蛋白TIP1-1和蛋白質脫水誘導的19同源物6的表達量隨溫度的升高表現為先升高后降低的趨勢,而且二者在高溫時的表達量要遠低于其它2個溫度。脫水素-HIRD11的表達量與水通道蛋白TIP1-1和蛋白質脫水誘導的19同源物6相比表現出相反的趨勢,該基因在高溫時的表達量是其它2個溫度下表達量的10倍左右。結果表明,適當的增溫可以提高水分的運輸效率,但過高的溫度會使水分運輸的效率驟然下降。圖5 水分利用相關基因的表達量

各樣品組合間差異表達基因繪制維恩圖(圖2)。其中圓圈代表比較組合,每個圓圈中的數字之和代表相互比較樣品的差異基因總個數,圓圈重疊的部分表示其共有的差異基因。W1vsW0的差異表達基因和W2vsW0有303個是相同的;W1vsW0和W2vsW1有489個是相同的,W2vsW0的差異表達基因和W2vsW1有 3 783個是相同的;W1vsW0、W2vsW0和W2vsW1的差異表達基因有196個是相同的,其中顯著上調的基因有30個,顯著下調的基因13個,這43個顯著表達基因很可能在溫度調控中起著直接或間接的作用。2.4.2 差異基因GO富集分析

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]高溫和干旱脅迫下茶樹轉錄組分析及Histone H1基因的功能鑒定[D]. 王偉東.南京農業(yè)大學 2016

碩士論文
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本文編號：3208211