目的:頭頸部鱗狀細(xì)胞癌（Head and neck squamous cell cancer,HNSCC）是全球最常見(jiàn)的癌癥類型之一。有許多報(bào)道表明,通過(guò)數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘探索的生物標(biāo)志物在預(yù)測(cè)HNSCC預(yù)后中起著至關(guān)重要的作用。然而,用于預(yù)后分析的單一生物標(biāo)志物是不夠的。因此,越來(lái)越多的證據(jù)表明基因簽名可能是HNSCC預(yù)后的更好選擇。方法:1.下載人類腫瘤基因組數(shù)據(jù)庫(kù)（The Cancer Genome Atlas,TCGA）中頭頸鱗癌相關(guān)的mRNA數(shù)據(jù)及臨床病理參數(shù)。2.進(jìn)行基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis,GSEA）,我們發(fā)現(xiàn)參與上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化（Epithelial-Mesenchymal Transformation,EMT）的基因集HNSCC發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。以歸一化P值（P<0.05）為條件進(jìn)一步篩選所研究的基因集。3.篩選癌與癌旁組織中差異表達(dá)的基因。4.單因素以及多因素Cox回歸模型進(jìn)行mRNAs與預(yù)后相關(guān)的篩選,并構(gòu)建基于mRNAs表達(dá)的分子標(biāo)簽用于預(yù)測(cè)患者的預(yù)后。5.K-M曲線預(yù)測(cè)分子標(biāo)簽對(duì)頭頸鱗癌患者預(yù)后的預(yù)測(cè)能力。6.將患者隨... 

【文章來(lái)源】：中國(guó)醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：51 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語(yǔ)
1 前言
2 材料與方法
    2.1 患者臨床參數(shù)及基因組表達(dá)數(shù)據(jù)
    2.2 功能富集分析
    2.3 統(tǒng)計(jì)分析
3 結(jié)果
    3.1 上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化相關(guān)基因集在癌旁樣本和腫瘤樣本之間差異顯著
    3.2 Cox回歸分析上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化相關(guān)的預(yù)后基因
    3.3 構(gòu)建基于4個(gè)mRNAs的分子標(biāo)簽
    3.4 mRNAs分子標(biāo)簽獨(dú)立于其他臨床變量預(yù)測(cè)患者預(yù)后
    3.5 HNSCC中4-m RNA標(biāo)簽的功能富集分析
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
    1 前言
    2 分子技術(shù)和遺傳基因改變與頭頸癌
        2.1 細(xì)胞遺傳學(xué)與雜合性丟失
        2.2 微陣列
        2.3 抑癌基因
        2.4 癌基因
        2.5 線粒體突變
        2.6 其他基因改變
    3 結(jié)論
    參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介



本文編號(hào)：3199162