基于高通量靶向測(cè)序的常見(jiàn)實(shí)體腫瘤基因突變圖譜研究
發(fā)布時(shí)間:2021-04-13 19:22
目的采用含有50個(gè)基因組合的高通量靶向測(cè)序技術(shù)檢測(cè)多種實(shí)體腫瘤的基因突變情況,分析實(shí)體腫瘤的基因突變情況,了解實(shí)體腫瘤的基因突變圖譜,為臨床診療提供理論依據(jù)。方法收集367例多種類型實(shí)體腫瘤樣本,采用BES 4000平臺(tái)檢測(cè)50個(gè)基因狀態(tài),分析各種腫瘤中的基因突變情況。結(jié)果 367例樣本中,64.03%的樣本至少存在1種基因的突變;共檢測(cè)到28種基因突變,突變率從高到低的前9個(gè)基因分別為EGFR(32.15%)、TP53(15.53%)、K-ras(8.17%)、c-kit(5.72%)、APC(3.00%)、PTEN(3.00%)、B-raf(2.72%)、ERBB2(2.72%)和PIKC3CA(2.72%)。在非小細(xì)胞肺癌中突變率最高的基因?yàn)镋GFR(40.10%),該基因突變?cè)诒狙芯科渌麗盒詫?shí)體腫瘤中未被發(fā)現(xiàn)。在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)、結(jié)直腸癌、胃癌和卵巢癌中均檢測(cè)到TP53的突變,突變率分別為13.61%、34.38%、33.30%和50.00%。在結(jié)直腸癌中突變率最高的基因?yàn)镵-ras(42.86%),胃腸間質(zhì)瘤中突變率最高的基因?yàn)閏-kit(53.13%)。在被檢測(cè)到...
【文章來(lái)源】:檢驗(yàn)醫(yī)學(xué). 2020,35(07)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
實(shí)體腫瘤基因突變例數(shù)
在G I S T中,基因突變率為6 8.7 5%(22/32),以c-kit基因的突變?yōu)橹,突變率?3.13%(17/32)。c-kit基因突變主要集中于外顯子11上(64.71%,11/17),以外顯子11的點(diǎn)突變和插入缺失為主,其次為PDGFRA的突變(9.38%,3/32),見(jiàn)圖2(b)。28例結(jié)直腸癌中,23例(82.14%)檢出了至少1種基因的突變:K-ras的突變率最高為42.86%(12/28),主要集中于密碼子12上,見(jiàn)圖2(c);TP53的突變次之為34.38%(11/32),同NSCLC,在結(jié)直腸癌中TP53基因以點(diǎn)突變?yōu)橹,但無(wú)某一位點(diǎn)偏好性;PIK3CA的突變主要以p.H1047R和p.E545X為主,而3例APC基因的突變均為exon14的移碼突變。在胃癌中檢測(cè)到2例TP53的點(diǎn)突變。4例卵巢癌樣本均檢測(cè)到基因突變:2例為TP53基因的點(diǎn)突變,1例為c-kit基因exon10上的點(diǎn)突變,1例為PTEN與TP53共突變。3例肝癌樣本中檢測(cè)到1例PTEN突變。2.4 多基因的共突變
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2015年中國(guó)惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),陳茹,顧秀瑛,魏文強(qiáng),赫捷. 中華腫瘤雜志. 2019 (01)
[2]靶向高通量測(cè)序在非小細(xì)胞肺癌中的臨床應(yīng)用[J]. 程亞楠,葉英楠,董莉,韓雷,劉芃芃,張蕊,于津浦. 中國(guó)腫瘤臨床. 2018(11)
[3]中國(guó)惡性腫瘤發(fā)病與死亡的國(guó)際比較分析[J]. 段紀(jì)俊,嚴(yán)亞瓊,楊念念,曾晶,鄭榮壽,張思維,陳萬(wàn)青. 中國(guó)醫(yī)學(xué)前沿雜志(電子版). 2016(07)
本文編號(hào):3135869
【文章來(lái)源】:檢驗(yàn)醫(yī)學(xué). 2020,35(07)
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【部分圖文】:
實(shí)體腫瘤基因突變例數(shù)
在G I S T中,基因突變率為6 8.7 5%(22/32),以c-kit基因的突變?yōu)橹,突變率?3.13%(17/32)。c-kit基因突變主要集中于外顯子11上(64.71%,11/17),以外顯子11的點(diǎn)突變和插入缺失為主,其次為PDGFRA的突變(9.38%,3/32),見(jiàn)圖2(b)。28例結(jié)直腸癌中,23例(82.14%)檢出了至少1種基因的突變:K-ras的突變率最高為42.86%(12/28),主要集中于密碼子12上,見(jiàn)圖2(c);TP53的突變次之為34.38%(11/32),同NSCLC,在結(jié)直腸癌中TP53基因以點(diǎn)突變?yōu)橹,但無(wú)某一位點(diǎn)偏好性;PIK3CA的突變主要以p.H1047R和p.E545X為主,而3例APC基因的突變均為exon14的移碼突變。在胃癌中檢測(cè)到2例TP53的點(diǎn)突變。4例卵巢癌樣本均檢測(cè)到基因突變:2例為TP53基因的點(diǎn)突變,1例為c-kit基因exon10上的點(diǎn)突變,1例為PTEN與TP53共突變。3例肝癌樣本中檢測(cè)到1例PTEN突變。2.4 多基因的共突變
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]2015年中國(guó)惡性腫瘤流行情況分析[J]. 鄭榮壽,孫可欣,張思維,曾紅梅,鄒小農(nóng),陳茹,顧秀瑛,魏文強(qiáng),赫捷. 中華腫瘤雜志. 2019 (01)
[2]靶向高通量測(cè)序在非小細(xì)胞肺癌中的臨床應(yīng)用[J]. 程亞楠,葉英楠,董莉,韓雷,劉芃芃,張蕊,于津浦. 中國(guó)腫瘤臨床. 2018(11)
[3]中國(guó)惡性腫瘤發(fā)病與死亡的國(guó)際比較分析[J]. 段紀(jì)俊,嚴(yán)亞瓊,楊念念,曾晶,鄭榮壽,張思維,陳萬(wàn)青. 中國(guó)醫(yī)學(xué)前沿雜志(電子版). 2016(07)
本文編號(hào):3135869
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