本課題組前期的蛋白組學(xué)研究發(fā)現(xiàn)一個小麥赤霉病抗性相關(guān)基因,該基因編碼三型胚胎發(fā)育晚期豐富蛋白（G3LEA）,該蛋白只在抗病品種中富集。已有研究表明,該基因在高等植物中廣泛的參與了生長、發(fā)育及各種逆境抵御的調(diào)控過程。本研究利用美國國立生物技術(shù)信息中心數(shù)據(jù)庫（NCBI）獲取小麥TaG3LEA基因CDS序列并和測序小麥品種“中國春”參考序列進(jìn)行比對,該基因位于4B染色體上已知抗赤霉病QTL區(qū)間。根據(jù)前期關(guān)聯(lián)分析結(jié)果,日本小麥品種TOKAII66在4B染色體上已知抗赤霉病QTL上攜帶有利變異,而美國小麥品種Clark攜帶不利等位變異,然后設(shè)計了擴(kuò)增的引物并分別擴(kuò)增小麥品種TOKAII66和Clark的TaG3LEA基因,將擴(kuò)增的特異片段回收、克隆和測序,根據(jù)堿基差異開發(fā)了可區(qū)別抗、感等位變異的基因特異性標(biāo)記并利用開發(fā)的功能標(biāo)記對244個小麥品種構(gòu)成的自然群體進(jìn)行基因型分析,明確不同等位變異在自然群體中的分布。接著對接種赤霉菌和接種綠豆湯的小麥TOKAII66和蘇麥3號（在目標(biāo)位點(diǎn)上攜帶不利等位變異）做不同時期的表達(dá)模式分析;采用生物信息學(xué)方法解析了小麥TaG3LEA家族基因的進(jìn)化。主要結(jié)果如下... 

【文章來源】：揚(yáng)州大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１：在中國春預(yù)測的的基因結(jié)構(gòu)

PCR檢測DNAFigZAgarose酬electroPhoresls

３０?揚(yáng)州大學(xué)碩士學(xué)位論文測序結(jié)果表明ＴＯＫＡＩＩ６６和Ｃｌａｒｋ之間僅存在１個ＳＮＰ變異，該ＳＮＰ位于起始密碼上游約１?ｋｂ的位置，是順式作用元件ＥＢＯＸＢＮＮＡＰＡ?ＡＢＲＥ?（ＡＢＡ響應(yīng)元件）的核心基。隨后，我們將該ＳＮＰ轉(zhuǎn)化為ＣＡＰＳ標(biāo)記，標(biāo)記交由華大基因公司合成。??中國春參考序列??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：3131829