本文運(yùn)用生物信息學(xué)方法分析肺腺癌潛在的診斷及預(yù)后基因,并從分子和蛋白水平上探究其潛在的發(fā)病機(jī)制。從基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)（GEO）下載GSE63459、GSE27262和GSE75037的表達(dá)數(shù)據(jù),將3個(gè)微陣列數(shù)據(jù)集整理取得差異表達(dá)基因,得出包括上調(diào)82個(gè)、下調(diào)273個(gè)的差異基因,并通過DAVID數(shù)據(jù)挖掘平臺(tái)對(duì)這些差異基因進(jìn)行功能及通路富集分析�；虮倔w（GO）富集分析顯示:基因產(chǎn)物與膠原蛋白分解代謝、血管生成以及細(xì)胞黏附等生物過程密切相關(guān),主要參與組成細(xì)胞外基質(zhì)、胞外區(qū)域、胞外體、膠原三聚體等細(xì)胞組分,且主要發(fā)揮調(diào)節(jié)金屬內(nèi)肽酶活性、肝素結(jié)合、調(diào)節(jié)受體活性等分子功能;京都基因基因組百科全書（KEGG）分析主要涉及胞外基質(zhì)-受體信號(hào)通路、黏著斑信號(hào)通路、轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β（TGF-β）信號(hào)通路、磷脂酰肌醇-3-激酶（PI3K-Akt）信號(hào)通路等相關(guān)通路。運(yùn)用STRING在線數(shù)據(jù)庫(kù)并結(jié)合Cytoscape軟件構(gòu)建蛋白-蛋白互助（PPI）網(wǎng)絡(luò),篩選出最重要的基因模塊及10個(gè)關(guān)鍵基因,利用Kaplan-Meier曲線分析預(yù)后,利用GEPIA和THPA在線數(shù)據(jù)庫(kù)從基因和蛋白水平來驗(yàn)證分析關(guān)鍵基因與患者的預(yù)... 

【文章來源】：激光生物學(xué)報(bào). 2020,29(05)

【文章頁數(shù)】：11 頁

【部分圖文】：

差異基因的韋恩圖、最重要的DEGs模塊和蛋白互助網(wǎng)絡(luò)圖

關(guān)鍵基因的差異表達(dá)熱圖和生物學(xué)過程分析

9個(gè)核心基因總生存率分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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