利用隨機(jī)矩陣?yán)碚摲治鋈橄侔┗蛭㈥嚵袛?shù)據(jù),得到乳腺癌基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),找出乳腺癌基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)中重要的增殖模塊和免疫模塊,并預(yù)測(cè)基因PMSCL1與乳腺癌細(xì)胞的增殖、侵襲及遷移有關(guān),基因CCAN2與乳腺癌細(xì)胞的有絲分裂有關(guān),基因SCYA5與乳腺癌細(xì)胞的免疫應(yīng)答有關(guān),基因PRC1、RAB31、INHBA可作為乳腺癌的靶向基因. 

【文章來(lái)源】：江西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,44(05)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

Poisson分布曲線

設(shè)定去噪步長(zhǎng)Δq=0.01,將去噪因子q由0逐步增加到1,計(jì)算每個(gè)去噪因子q值對(duì)應(yīng)特征值的最近鄰間隔分布.發(fā)現(xiàn)隨著q值的增加,乳腺癌關(guān)聯(lián)矩陣特征值的最近鄰間隔分布函數(shù)P(s)的分布曲線發(fā)生尖銳轉(zhuǎn)變,由Wigner-Dyson分布銳變到Poisson分布,如圖3所示.這說(shuō)明通過(guò)增加q值,隨機(jī)噪聲引入的模塊間弱相互作用逐漸被去除掉,體系保留下來(lái)的是基因間真實(shí)的強(qiáng)相互作用,代表乳腺癌基因網(wǎng)絡(luò)從無(wú)規(guī)全局網(wǎng)絡(luò)過(guò)渡到真實(shí)信息的生物網(wǎng)絡(luò).通過(guò)計(jì)算乳腺癌關(guān)聯(lián)矩陣特征值NNSDs對(duì)高斯分布的標(biāo)準(zhǔn)誤差與對(duì)泊松分布的標(biāo)準(zhǔn)誤差來(lái)確定乳腺癌基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)模塊的分割閾值,標(biāo)準(zhǔn)誤差的計(jì)算公式為

通過(guò)作乳腺癌關(guān)聯(lián)矩陣特征值NNSDs對(duì)高斯分布的標(biāo)準(zhǔn)誤差與對(duì)泊松分布的標(biāo)準(zhǔn)誤差的比值曲線圖(見(jiàn)圖4)可見(jiàn),當(dāng)q=0.78時(shí)標(biāo)準(zhǔn)誤差的比值最大.此時(shí)系統(tǒng)完全過(guò)渡到泊松系統(tǒng),基因模塊間由噪聲引入的弱相互作用被充分去掉,乳腺癌基因網(wǎng)絡(luò)呈現(xiàn)基因間本質(zhì)網(wǎng)絡(luò)模塊.因此,選取q=0.78為3 044×77的乳腺癌基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)模塊的分割閾值.2.2 獲取乳腺癌共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)模塊

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]腦膠質(zhì)瘤治療相關(guān)時(shí)空演化機(jī)制及其在精準(zhǔn)治療中的應(yīng)用（英文）[J]. 呂明康,蔣彪彬,保肇實(shí),王吉光.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2019(11)
[2]基于隨機(jī)矩陣?yán)碚摷皩哟尉垲?lèi)方法在肝癌基因網(wǎng)絡(luò)中的研究[J]. 李蓉,鄭浪,任喜梅,鐘春曉,王錦麗.  湘潭大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2019(02)
[3]BUB1在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中高表達(dá)并促進(jìn)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的增殖[J]. 白曉斌,霍龍偉,謝萬(wàn)福,徐高峰,王茂德.  西安交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2019(02)
[4]乳腺癌中INHBA表達(dá)及與臨床預(yù)后的關(guān)系[J]. 茅育蕾,蔡宜玲.  臨床與實(shí)驗(yàn)病理學(xué)雜志. 2018(03)
[5]基于隨機(jī)矩陣?yán)碚摰墓墒芯W(wǎng)絡(luò)拓?fù)湫再|(zhì)研究[J]. 謝赤,胡玨,王鋼金.  運(yùn)籌與管理. 2018(01)
[6]TEAD4對(duì)結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖影響及機(jī)制探討[J]. 李臻,李樹(shù)安,羅華友,曾玉劍,王昆華.  中華腫瘤防治雜志. 2017(15)
[7]PRC1在細(xì)胞分裂及腫瘤發(fā)生中的作用[J]. 施曉婷,張斌,鄒曉平.  現(xiàn)代腫瘤醫(yī)學(xué). 2016(23)
[8]基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的城市綜合交通網(wǎng)絡(luò)特征分析與優(yōu)化研究[J]. 吳樣平,郭飛,曾明華.  江西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(03)
[9]STK15、MCM5在胃癌前病變及癌變組織中的表達(dá)及相關(guān)性分析[J]. 高峻,楊勇,陳霖,楊宏新.  實(shí)用醫(yī)學(xué)雜志. 2014(09)
[10]基于拓?fù)浜蜕锾卣鞯臋?quán)重網(wǎng)絡(luò)中絡(luò)合物抽取[J]. 于鳳英,楊志豪,林鴻飛.  江西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2013(03)



本文編號(hào)：3107257