EphB6基因甲基化在胃癌中的調(diào)控作用的研究
發(fā)布時間:2021-03-29 04:55
研究背景和目的胃癌(Gastric Cancer,GC)是我國常見惡性腫瘤,盡管近年來在胃癌的診斷和治療上取得一定進步,但我國GC的發(fā)病率與死亡率仍位居前列。從分子層面上探究胃癌發(fā)生、發(fā)展將有助于尋找到新的治療突破點。EphB6是酪氨酸激酶(receptor tyrosine kinases,RTKs)家族中一種缺乏酪氨酸激酶活性的特殊型受體。目前國內(nèi)外大量研究提示EphB6在大部分腫瘤中呈現(xiàn)低表達,可能發(fā)揮著抑癌基因功能。但是EphB6在胃癌中的研究尚少,本課題前期通過對胃癌患者外周血樣本ctDNA高通量測序,發(fā)現(xiàn)多例EphB6基因高頻突變;谇捌谘芯,我們以胃癌為研究對象,將EphB6作為目的基因,明確EphB6在胃癌組織和胃癌細胞株中的表達,探究可能影響EphB6基因表達的機制;構(gòu)建EphB6穩(wěn)定過表達的胃癌細胞株,觀察其對胃癌細胞增殖、侵襲轉(zhuǎn)移的影響,并初步探索相關(guān)分子機制。研究方法1.運用公共數(shù)據(jù)庫生物信息網(wǎng)站及免疫組化技術(shù)研究胃癌組織及對應(yīng)的癌旁正常組織EphB6表達情況并進一步分析EphB6蛋白表達水平與患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系。2.應(yīng)用RT-PCR、Westernblo...
【文章來源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【圖文】:
GEPIA網(wǎng)站分析在人胃癌細胞組織中EphB6mRNA水平
20圖1.2EphB6蛋白在胃癌組織中的免疫組化染色情況(A)EphB6蛋白在癌旁組織高表達;(B)EphB6蛋白在癌組織低表達;(C)EphB6蛋白在癌組織中等表達;(D)EphB6蛋白在癌組織高表達。(×100)表1.1胃癌組織EphB6蛋白染色評分情況(x±s)組織類型綜合評分t值P值癌組織2.2895±1.575284.717<0.001癌旁組織3.9474±1.558713.3EphB6蛋白的表達與患者臨床數(shù)據(jù)的關(guān)系將38例胃癌組織及對應(yīng)的癌旁正常組織的EphB6染色綜合評分進行比較,25例(65.8%)出現(xiàn)了EphB6蛋白表達下調(diào),未下調(diào)的僅13例(34.2%,其中11例無變化,2例表達上調(diào))。將EphB6蛋白表達的下調(diào)與患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系進行統(tǒng)計學(xué)分析。結(jié)果如表1.2所示,EphB6蛋白表達下調(diào)與胃癌分化程度(P=0.042<0.05)、有無脈管癌栓(P=0.013<0.05)有相關(guān)性,但與患者性別(P=0.486)、年齡(P=0.323)、腫瘤
29(9)取1μgRNA于1﹪瓊脂糖凝膠電泳鑒定RNA的完整性。當顯示18s、28s和5s三條擴增帶,亦說明提取的RNA完整性好,結(jié)果見下圖圖2.1RNA電泳圖2.2.2cDNA第一鏈的合成(1)按北京天根逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書操作,配制gDNA去除反應(yīng)體系,徹底混勻。簡短離心,并置于42℃,孵育3min。然后置于冰上放置;組分使用量TotalRNA1μg5×gDNABuffer2μlRNaseFreedH2OUpto10μl(2)配制反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系;組分使用量10×FastRTBuffer2μlRTEnzymeMix1μlFQ-RTPrimerMix2μlRNaseFreedH2OUpto10μl(3)將反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中的Mix,加到gDNA去除步驟的反應(yīng)液中,充分混勻;(4)反應(yīng)條件:42℃孵育15min,95℃孵育3min之后放于冰上,得到cDNA可用于后續(xù)實驗。2.2.3qPCR引物設(shè)計與合成
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Eph-Ephrin信號通路雙向調(diào)節(jié)功能與胃癌的研究進展[J]. 王海洋,夏化文,王葆春. 海南醫(yī)學(xué). 2017(17)
[2]表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2017(01)
[3]表觀遺傳學(xué)與疾病發(fā)生發(fā)展的研究進展[J]. 王琳. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2016(53)
[4]Methylation-mediated gene silencing as biomarkers of gastric cancer:a review[J]. Jun Nakamura,Tomokazu Tanaka,Yoshihiko Kitajima,Hirokazu Noshiro,Kohji Miyazaki. World Journal of Gastroenterology. 2014(34)
[5]Eph受體家族與腫瘤及腫瘤血管的相關(guān)性研究進展[J]. 傅明杰,邢雪. 臨床普外科電子雜志. 2014(02)
[6]DNA甲基化及其調(diào)控與腫瘤[J]. 汪炎,牛朝詩. 國際病理科學(xué)與臨床雜志. 2013(05)
[7]CpG島甲基化和人類腫瘤[J]. 徐國茂. 中國藥業(yè). 2008(09)
本文編號:3106940
【文章來源】:福建醫(yī)科大學(xué)福建省
【文章頁數(shù)】:82 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【圖文】:
GEPIA網(wǎng)站分析在人胃癌細胞組織中EphB6mRNA水平
20圖1.2EphB6蛋白在胃癌組織中的免疫組化染色情況(A)EphB6蛋白在癌旁組織高表達;(B)EphB6蛋白在癌組織低表達;(C)EphB6蛋白在癌組織中等表達;(D)EphB6蛋白在癌組織高表達。(×100)表1.1胃癌組織EphB6蛋白染色評分情況(x±s)組織類型綜合評分t值P值癌組織2.2895±1.575284.717<0.001癌旁組織3.9474±1.558713.3EphB6蛋白的表達與患者臨床數(shù)據(jù)的關(guān)系將38例胃癌組織及對應(yīng)的癌旁正常組織的EphB6染色綜合評分進行比較,25例(65.8%)出現(xiàn)了EphB6蛋白表達下調(diào),未下調(diào)的僅13例(34.2%,其中11例無變化,2例表達上調(diào))。將EphB6蛋白表達的下調(diào)與患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系進行統(tǒng)計學(xué)分析。結(jié)果如表1.2所示,EphB6蛋白表達下調(diào)與胃癌分化程度(P=0.042<0.05)、有無脈管癌栓(P=0.013<0.05)有相關(guān)性,但與患者性別(P=0.486)、年齡(P=0.323)、腫瘤
29(9)取1μgRNA于1﹪瓊脂糖凝膠電泳鑒定RNA的完整性。當顯示18s、28s和5s三條擴增帶,亦說明提取的RNA完整性好,結(jié)果見下圖圖2.1RNA電泳圖2.2.2cDNA第一鏈的合成(1)按北京天根逆轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書操作,配制gDNA去除反應(yīng)體系,徹底混勻。簡短離心,并置于42℃,孵育3min。然后置于冰上放置;組分使用量TotalRNA1μg5×gDNABuffer2μlRNaseFreedH2OUpto10μl(2)配制反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系;組分使用量10×FastRTBuffer2μlRTEnzymeMix1μlFQ-RTPrimerMix2μlRNaseFreedH2OUpto10μl(3)將反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中的Mix,加到gDNA去除步驟的反應(yīng)液中,充分混勻;(4)反應(yīng)條件:42℃孵育15min,95℃孵育3min之后放于冰上,得到cDNA可用于后續(xù)實驗。2.2.3qPCR引物設(shè)計與合成
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Eph-Ephrin信號通路雙向調(diào)節(jié)功能與胃癌的研究進展[J]. 王海洋,夏化文,王葆春. 海南醫(yī)學(xué). 2017(17)
[2]表觀遺傳學(xué)研究進展[J]. 丁勇,許超,吳季輝,施蘊渝,臧建業(yè),蔡剛. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2017(01)
[3]表觀遺傳學(xué)與疾病發(fā)生發(fā)展的研究進展[J]. 王琳. 世界最新醫(yī)學(xué)信息文摘. 2016(53)
[4]Methylation-mediated gene silencing as biomarkers of gastric cancer:a review[J]. Jun Nakamura,Tomokazu Tanaka,Yoshihiko Kitajima,Hirokazu Noshiro,Kohji Miyazaki. World Journal of Gastroenterology. 2014(34)
[5]Eph受體家族與腫瘤及腫瘤血管的相關(guān)性研究進展[J]. 傅明杰,邢雪. 臨床普外科電子雜志. 2014(02)
[6]DNA甲基化及其調(diào)控與腫瘤[J]. 汪炎,牛朝詩. 國際病理科學(xué)與臨床雜志. 2013(05)
[7]CpG島甲基化和人類腫瘤[J]. 徐國茂. 中國藥業(yè). 2008(09)
本文編號:3106940
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