楊屬,作為具有重要經濟和生態(tài)價值的落葉喬木樹種,其分布覆蓋整個北半球樹木分布的臨界范圍。不同楊屬樹種基因組全序列的測定,為通過比較關鍵等位基因的變異來研究不同楊屬樹種對不同環(huán)境的適應機制提供了基礎。本研究以毛果楊基因組為參照序列共設計64對特異性引物,對楊屬29個樹種Na⁺/H⁺逆向轉運蛋白基因家族（10個基因）進行全長PCR擴增,運用CodonCode Aligner軟件對序列數據進行校對;通過PAML計算來檢測目的基因是否在不同樹種間發(fā)生了結構變異和適應性進化;用DnaSP、MEGA和ARLEQUIN等軟件進行DNA多態(tài)性分析,計算每個種的單倍型遺傳多樣性,并通過HKA和MKPRF等軟件對數據進行計算和中性檢驗,揭示Na⁺/H⁺逆向轉運蛋白基因家族在楊屬種間的分子進化機制。結果表明:白楊組的NHX5基因和胡楊組的NHX6、SOS1基因能夠檢測到正選擇信號;Na⁺/H⁺逆向轉運蛋白家族基因在胡楊和灰楊野生群體中普遍經歷了適應性進化。同時,研究發(fā)現胡楊組的... 

【文章來源】：蘭州大學甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數】：64 頁

【學位級別】：碩士

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中文摘要
Abstract
前言
    1.1 楊屬樹種的系統(tǒng)發(fā)育
    1.2 正選擇
    1.3 基因重復
+/H⁺ 逆向轉運蛋白基因家族">    1.4 Na⁺/H⁺ 逆向轉運蛋白基因家族
    1.5 本研究的意義
+/H⁺逆向轉運蛋白在楊屬種間的進化">第二章 Na⁺/H⁺逆向轉運蛋白在楊屬種間的進化
    2.1 材料與方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 引物設計
        2.1.3 楊屬基因組DNA提取及凝膠電泳
        2.1.4 基因片段的擴增
    2.2 數據整理與分析
        2.2.1 序列校對
        2.2.2 數據分析
    2.3 結果
        2.3.1 位點模型檢驗
        2.3.2 分枝模型檢驗
        2.3.3 分枝位點模型檢驗
    2.4 討論
+/H⁺逆向轉運蛋白在胡楊、灰楊中的自然選擇">第三章 Na⁺/H⁺逆向轉運蛋白在胡楊、灰楊中的自然選擇
    3.1 實驗材料與方法
        3.1.1 材料收集以及樣品數量的確定
        3.1.2 引物設計與篩選
    3.2 數據處理與分析
        3.2.1 數據處理
        3.2.2 數據分析
    3.3 結果
        3.3.1 核苷酸多態(tài)性
        3.3.2 多態(tài)性與差異性
    3.4 討論
        3.4.1 遺傳多樣性與種群分化
        3.4.2 自然選擇
第四章 胡楊SOS1基因重復與功能互補
    4.1 實驗材料及儀器
        4.1.1 實驗材料
        4.1.2 試劑
        4.1.3 酶與試劑盒
        4.1.4 質粒與菌株
        4.1.5 實驗儀器
    4.2 實驗方法
        4.2.1 胡楊RNA的提取
        4.2.2 反轉錄
        4.2.3 胡楊SOS1b的擴增及膠回收
        4.2.4 胡楊SOS1b的連接、轉化、測序及鑒定
        4.2.5 表達載體的構建
        4.2.6 胡楊SOS1b功能互補分析
    4.3 實驗結果
        4.3.1 胡楊總RNA的提取
        4.3.2 PeSOS1b基因克隆與篩選
        4.3.3 表達載體的構建與鑒定
        4.3.4 生長曲線的測定
    4.4 討論
第五章 結論
參考文獻
碩士期間發(fā)表論文
致謝


【參考文獻】：
期刊論文
[1]植物進化中的正選擇作用[J]. 高遠,田李,秦松.  植物學通報. 2008(04)
[2]用ITS序列研究楊屬各組之間的系統(tǒng)發(fā)育關系[J]. 史全良,諸葛強,黃敏仁,王明庥.  植物學報. 2001(03)
[3]大青楊及其近緣種的遺傳變異和系統(tǒng)關系研究[J]. 蘇曉華,張綺紋,張望東,卞祖嫻.  林業(yè)科學. 1996(02)
[4]世界楊柳科植物的起源、分化和地理分布[J]. 丁托婭.  云南植物研究. 1995(03)

博士論文
[1]川西青楊組（Section Tacamahaca Spach）不同種的親緣關系分析[D]. 陳珂.中國科學院研究生院（成都生物研究所） 2007
[2]楊屬AFLP遺傳多樣性研究和楊樹品種分子指紋圖譜構建[D]. 宋紅竹.中國林業(yè)科學研究院 2006



本文編號：3075687