第一部分:胰腺疾病的生物信息學分析目的:本課題組前期的蛋白質組學研究篩選胰腺癌患者與胰腺良性腫瘤,慢性胰腺炎與正常胰腺組織之間的差異表達蛋白,探究胰腺癌的發(fā)病機制,為胰腺疾病的基因診斷和治療提供導向。方法:通過本課題組前期的蛋白質組學分析得出的數(shù)據(jù),結合Uni Prot數(shù)據(jù)庫篩除反庫、污染庫、無定量值蛋白。使用R軟件對上述每組的差異蛋白分別進行GO和Pathway的分析,通過交互基因檢索工具的數(shù)據(jù)庫構建PPI網(wǎng)絡,結合Cytoscape處理模塊,統(tǒng)計蛋白Z-score。結果:篩出匹配蛋白3927個,胰腺癌組差異蛋白有258個,上調203個,下調55個,功能基因涉及106個相關term;良性胰腺腫瘤組差異蛋白有72個,上調60個,下調12個,功能基因涉及涉及70個相關term;慢性胰腺炎組差異蛋白有205個,上調161個,下調44個,功能基因涉及涉及106個相關term。結論:本文從生物信息學方向尋找胰腺癌、良性胰腺腫瘤、慢性胰腺炎的相干蛋白,鑒定了這些胰腺疾病在分子水平的差異表達和功能特征,為胰腺疾病的治療提供潛在的治療靶點。第二部分:胰腺導管腺癌中BCLAF1蛋白的表達及臨床意義目的... 

【文章來源】：安徽醫(yī)科大學安徽省

【文章頁數(shù)】：59 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

差異蛋白火山圖：X軸為差異蛋白質的倍數(shù)（log2），Y軸為Pvalue（-log10值），深色點是不顯著蛋白質，紅點為上調的蛋白質，綠點為下調的蛋白質

安徽醫(yī)科大學碩士學位論文12圖2差異蛋白的GO富集分析：選取每個功能注釋本體前5個作圖，功能注釋本體代表富集的P值從小到大排列。左側為上調差異基因富集圖，右側為下調差異基因圖。三個圖從上至下依次對應的為：PC，BPT，CP。紅色、綠色、藍色分別為生物學過程、細胞學組分、分子生物學功能。

安徽醫(yī)科大學碩士學位論文13圖3差異蛋白參與的信號通路：圓圈的直徑為參與該通路的蛋白數(shù)；點的顏色代表則富集蛋白的顯著程度。圖ABC依次對應為PC、BPT、CP上調的差異蛋白富集通路；圖DEF依次對應為PC、BPT、CP下調的差異蛋白富集通路。結果顯示：胰腺癌高表達基因與41個BP、31個CC以及24個MF有關。其主要涉及蛋白靶向內質網(wǎng)、共翻譯轉運、翻譯起始、內質網(wǎng)應激等過程；主要作用于核糖體，胞質、細胞-基質粘附連接、細胞-底物連接、細胞外基質；分子功能主要包括與rRNA、嘌呤核苷、細胞外基質等結合，影響轉氨酶、絲氨酸水解酶、谷胱甘肽過氧化物酶、金屬內肽酶抑制劑活性。低表達基因與8個CC以及2個MF有關。通路分析發(fā)現(xiàn)，癌差異基因主要與SRP依賴的共翻譯蛋白靶向膜、真核翻譯延伸、肽鏈延伸等、補體級聯(lián)等調節(jié)有關。胰腺良性腫瘤高表達基因與27個BP、13個CC以及21個MF。其中包括血小板脫粒、一氧化氮調節(jié)的信號轉導、血管生成的調節(jié)過程等。低表達基因涉及9個BP。通路分析發(fā)現(xiàn)，高表達基因主要細胞外基質、膠原鏈三聚化、整合素細胞表面相互作用有關。而低表達基因則與金屬硫蛋白、金屬離子的反應有關慢性胰腺炎高表達基因與179個BP、63個CC以及40個MF有關。低表達基因與10個BP、2個CC以及4個MF有關。其中參與中性脂質、甘油酸酯分


本文編號：3053050