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大白菜生長(zhǎng)素受體基因家族生物信息學(xué)鑒定與表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-02-22 08:44
  【目的】對(duì)大白菜生長(zhǎng)素受體BrTIR1/AFBs基因家族進(jìn)行系統(tǒng)分析,為大白菜BrTIR1/AFBs基因家族的功能挖掘和性狀遺傳改良提供理論依據(jù)!痉椒ā坷蒙镄畔W(xué)方法,分析大白菜生長(zhǎng)素受體基因家族的進(jìn)化關(guān)系、編碼蛋白、保守結(jié)構(gòu)域和順式作用元件;贜CBI轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RNA-sep)數(shù)據(jù),分析BrTIR1/AFBs基因家族在大白菜不同組織中的表達(dá)模式以及在根腫病入侵條件下的表達(dá)情況!窘Y(jié)果】從大白菜基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定得到10個(gè)BrTIR1/AFBs基因。擬南芥、莖瘤芥和大豆生長(zhǎng)素受體基因家族多序列比對(duì)以及系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示:BrTIR1/AFBs基因分為6個(gè)亞家族(TIR1、AFB1、AFB2、AFB3、AFB4和AFB5),處于同一亞族的基因具有相似的結(jié)構(gòu)。染色體定位結(jié)果顯示:BrTIR1/AFBs基因家族成員分布在除Chr5、Chr6和Chr10號(hào)染色體之外的7條染色體上,呈現(xiàn)出不均勻分布。順式作用元件分析結(jié)果顯示:所有的BrTIR1/AFBs基因家族成員都含有響應(yīng)生長(zhǎng)素、防御和逆境脅迫的作用元件,預(yù)示著這些基因可能參與相應(yīng)的生物學(xué)過(guò)程。組織表達(dá)模式分析發(fā)現(xiàn):10個(gè)BrT... 

【文章來(lái)源】:云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2020,35(06)北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】:12 頁(yè)

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大白菜LOG基因家族的鑒定與生物信息學(xué)分析[J]. 霍如雪,孫琳,劉振寧.  北方園藝. 2018(04)
[2]大豆生長(zhǎng)素受體基因家族及組織化學(xué)表達(dá)模式分析[J]. 程春紅,蔡兆明.  中國(guó)油料作物學(xué)報(bào). 2017(04)
[3]白菜SAUR基因家族的生物信息學(xué)分析[J]. 趙敬會(huì),王瑞雪,李榮沖,梁晶龍,張濤.  中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào). 2012(22)
[4]植物生長(zhǎng)素受體蛋白研究現(xiàn)狀[J]. 皮冬梅,劉悅萍.  生物技術(shù)通報(bào). 2011(06)



本文編號(hào):3045736

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