目的通過對(duì)炎癥性腸病差異基因的篩選以及結(jié)直腸癌隊(duì)列生存特征和表達(dá)模式的探究,為炎癥相關(guān)結(jié)直腸癌的發(fā)生與發(fā)展的后續(xù)研究提供候選基因。方法從GEO數(shù)據(jù)庫中選擇RNA測序表達(dá)譜數(shù)據(jù)集GSE95473和GSE107597,通過常規(guī)轉(zhuǎn)錄組表達(dá)譜差異分析,篩選出炎癥性腸病差異表達(dá)基因（DEG）,利用GO數(shù)據(jù)庫獲取DEG的功能注釋,并利用KEGG數(shù)據(jù)庫進(jìn)行通路富集分析。同時(shí)基于TCGA數(shù)據(jù)庫進(jìn)一步在結(jié)直腸癌數(shù)據(jù)集中篩選具有預(yù)后意義的基因,并評(píng)價(jià)其在結(jié)直腸腫瘤中的表達(dá)特征。結(jié)果兩個(gè)數(shù)據(jù)集篩選到了共有DEGs 100個(gè),通過主成分分析證實(shí)這些基因能夠?qū)Y(jié)直腸癌腫瘤和黏膜區(qū)分良好。進(jìn)一步篩選,獲得ALDOB,SPINK4,REG4,IL1B,C2CD4A,CXCL8,NOS2,CXCL3等候選基因。這些基因在結(jié)直腸腫瘤中高表達(dá),并且這些基因的高表達(dá)往往提示患者預(yù)后較好。結(jié)論 ALDOB,SPINK4,REG4,IL1B,C2CD4A,CXCL8,NOS2,CXCL3可能在炎癥相關(guān)結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮重要作用,有待于后續(xù)炎癌轉(zhuǎn)化相關(guān)功能驗(yàn)證和機(jī)制探究。 

【文章來源】：中華結(jié)直腸疾病電子雜志. 2020,9(03)

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
資料與方法
    一、在GEO數(shù)據(jù)庫中篩選炎癥性腸病相關(guān)基因
    二、功能富集分析
    三、通過TCGA進(jìn)一步篩選結(jié)直腸癌預(yù)后相關(guān)基因及數(shù)據(jù)庫內(nèi)驗(yàn)證
    四、統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
結(jié) 果
    一、GEO數(shù)據(jù)庫中炎癥性腸病相關(guān)基因篩選結(jié)果
    二、炎癥性腸病相關(guān)差異表達(dá)基因的功能富集分析
    三、通過TCGA篩選出提示結(jié)直腸癌預(yù)后不良的基因
    四、在TCGA數(shù)據(jù)庫中探索候選基因在結(jié)直腸癌中的表達(dá)模式
討 論



本文編號(hào)：3028180