脂肪細(xì)胞不僅是脂肪組織的主要構(gòu)成組分,而且在整個(gè)生命體的新陳代謝穩(wěn)態(tài)調(diào)控過(guò)程中發(fā)揮重要作用。脂肪生成是指由成纖維細(xì)胞狀的前脂肪細(xì)胞發(fā)育成為成熟脂肪細(xì)胞的過(guò)程,并且脂肪生成是一個(gè)需要大量轉(zhuǎn)錄因子按次序活化的多級(jí)精準(zhǔn)調(diào)控過(guò)程,如過(guò)氧化物增殖體激活受體γ（peroxisome proliferator activated receptor-γ,PPAR-γ）和CCAAT/增強(qiáng)子結(jié)合蛋白（CCAAT/enhancer-binding protein,C/EBP）基因家族。為了研究調(diào)控脂肪生成的轉(zhuǎn)錄組事件,對(duì)3T3-L1前脂肪細(xì)胞（D0）和其分化的成熟脂肪細(xì)胞（D13）進(jìn)行了RNA-Seq測(cè)序。與前脂肪細(xì)胞（D0）相比,成熟脂肪細(xì)胞（D13）共有4443個(gè)倍性變化≥2.0的差異表達(dá)基因。通過(guò)對(duì)RNA-Seq數(shù)據(jù)分析,發(fā)現(xiàn)在3T3-L1前脂肪細(xì)胞脂肪分化過(guò)程中甲基固醇單加氧酶1（Methylsterol monooxygenase1,MSMO1）的表達(dá)是顯著下調(diào)的。這表明MSMO1可能是脂肪細(xì)胞分化過(guò)程中一個(gè)新的調(diào)控因子,但它在脂肪生成中的作用尚未報(bào)道,因此重點(diǎn)對(duì)該基因在脂肪生成中的功能進(jìn)行研究。... 

【文章來(lái)源】：聊城大學(xué)山東省

【文章頁(yè)數(shù)】：48 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

脂肪細(xì)胞分化過(guò)程及關(guān)鍵調(diào)控因子的功能相互關(guān)系

2-1. 3T3-L1 前脂肪細(xì)胞在體外分化成為成熟脂肪細(xì)胞。色；（B）前脂肪細(xì)胞(D0)和脂肪細(xì)胞(D13)脂肪標(biāo)志基(**P<0.01. β-actin 作為內(nèi)參)檢測(cè)本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析，由表2-2可見(jiàn)，經(jīng)過(guò)質(zhì)量（D0-1、D0-2、D13-1和D13-2）RNA完整性指數(shù)RIN ≥ 9.0；OD 260/OD 280 ≥ 2.0；28 S/18 S的污染，同時(shí)也沒(méi)有降解，可以用于下一步的RN表 2-2. 樣本RNA質(zhì)量OD 260/OD 280 RIN 22.02 9.1 2.04 9.2 2.03 9.1

肪細(xì)胞（D0）和脂肪細(xì)胞（D13）中分別獲得了約120.5 million和122.8 million的cleeads；在四個(gè)樣品中，uniquely mapped reads 的范圍是43.1~53.9 million；定位到參因組中的比例的范圍是88.8 ~ 91.7%（圖2-2B）。大約有95.9%的mapped sequeneads定位到外顯子區(qū)（圖2-2C）�？傊�，這些數(shù)據(jù)顯示RNA-Seq的數(shù)據(jù)是高質(zhì)量的表 2-3. 測(cè)序數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)表ample Reads Q20 (%) GC (%)0-1 61216586 93.69 51.760-2 61793042 95.01 51.6713-1 56638666 93.67 53.6713-2 69187806 94.33 53.06注：Q20（%）表示 Phred 數(shù)值大于 20 的堿基占總體堿基的百分比，GC content（%）表示 G 和 C 的數(shù)量總和占總的堿基數(shù)量的百分比。

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號(hào)：3005642