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星天牛嗅覺相關(guān)基因的鑒定與表達(dá)分析

發(fā)布時間:2021-01-14 19:35
  星天牛Anoplophora chinensis(Forster)是一種危害巨大的蛀干害蟲,其原產(chǎn)于中國、日本和韓國,現(xiàn)已蔓延至歐洲。星天牛危害的寄主范圍廣泛,取食超過百種植物。昆蟲具有高度靈敏、復(fù)雜的嗅覺系統(tǒng),能夠特異性感受、識別外界的氣味物質(zhì),從而引導(dǎo)昆蟲做出定位寄主植物、選擇產(chǎn)卵場所、躲避天敵、尋找配偶、取食等生理行為。昆蟲識別氣味分子的過程有多種嗅覺相關(guān)基因參與,包括氣味結(jié)合蛋白、化學(xué)感受蛋白、氣味受體、味覺受體、離子型受體、感覺神經(jīng)元膜蛋白、氣味降解酶等。深入研究這些基因在星天;瘜W(xué)通訊中的作用機(jī)制,有利于開發(fā)更為高效的害蟲防治技術(shù)。本實驗利用高通量測序技術(shù)對星天牛雌、雄觸角進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,用生物信息學(xué)方法從轉(zhuǎn)錄組中鑒定和發(fā)掘嗅覺相關(guān)基因。選取其中的化學(xué)感受受體基因(氣味受體、味覺受體、離子型受體)采用熒光定量PCR技術(shù),研究并分析其在雌、雄個體不同組織間的表達(dá)水平。主要結(jié)果如下:1)星天牛觸角轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析通過對星天牛觸角進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,共獲得44,938條Unigenes,平均長度為902bp,其中有26,701(59.41%)個Unigenes可以同源比對到Nr數(shù)據(jù)庫其... 

【文章來源】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)安徽省

【文章頁數(shù)】:90 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

星天牛嗅覺相關(guān)基因的鑒定與表達(dá)分析


昆蟲嗅覺感受器的結(jié)構(gòu)

技術(shù)路線圖,星天牛,轉(zhuǎn)錄組,測序技術(shù)


容與方法星天牛為研究對象,通過二代高通量測序技術(shù)對星天牛的雌雄利用生物信息學(xué)方法分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從中篩選、鑒定嗅覺相 PCR(Quantitative Real-time PCR,RT-qPCR)技術(shù)對 3 種化GR、IR)進(jìn)行表達(dá)研究,以發(fā)掘這三種基因在星天牛不同組差異。線

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圖 4-1 星天牛轉(zhuǎn)錄組組裝 Unigenes 和 Transcripts 長度分布Fig. 4-1 Distribution of Unigenes and Transcripts length interval in the A. chinensis transcriptome assembl 星天牛轉(zhuǎn)錄組 Unigenes 同源性分析在星天牛觸角轉(zhuǎn)錄組獲得的 44,938 個 Unigenes 中,有 26,701 個 Unigen源比對到(e-value<10-5)Nr(non-redundant)蛋白數(shù)據(jù)庫。其中有 55.6%ene 比對到了赤擬谷盜,其次是中歐山松大小蠹(14.4%)和黑褐毛蟻(Lasiu)(圖4-2)。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:2977415

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