高通量技術(shù)檢測抑癌基因Pitx2靜默后PanIN細胞中下游基因改變
發(fā)布時間:2021-01-08 01:27
目的:運用小鼠基因轉(zhuǎn)錄本的全基因表達譜芯片,研究Pitx2基因靜默前后胰腺上皮內(nèi)瘤變(pancreatic intraepithelial neoplasia, PanIN)細胞下游基因表達譜的變化。方法 :應(yīng)用小鼠全基因芯片檢測Pitx2基因靜默前后PanIN細胞基因表達譜的變化,并運用實時熒光定量多聚酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)對部分芯片結(jié)果進行驗證。結(jié)果:根據(jù)基因芯片篩選出差異倍數(shù)3倍以上的差異表達基因共97條。其中上調(diào)58條,涉及細胞增殖的基因包括Rac1、Ccr1、Fut9、PPP3CA、Sox5、Bmp7、Chtf18、Btg4、Flt4、Dscaml1和Pftk1;涉及細胞轉(zhuǎn)移的基因包括Sesn1、Rpl7a、PPP3CA、Sox5、Bmp7、PIK3C2G、Cxcl12、Btg4和Kcnj14。下調(diào)39條,涉及細胞增殖的基因包括PPP2R2A、Nav1、PPP2R3C、Katnb1、Gpbp1、Nat3、Tgm5和PRKRA;涉及細胞轉(zhuǎn)移的基因包括PPP2R2A、Lce1c、Hcn1、PPP2R3C、Tbxas1、Chrna1、...
【文章來源】:內(nèi)科理論與實踐. 2020,15(04)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
材料與方法
一、細胞株
二、基因芯片
三、細胞復(fù)蘇與培養(yǎng)
四、RNA提取
五、單標記芯片實驗
六、實時定量PCR
七、統(tǒng)計學(xué)方法
結(jié)果
一、基因芯片結(jié)果
二、Pan IN-P細胞與Pan IN-C細胞差異基因功能匯總
三、實時定量PCR對部分芯片結(jié)果進行驗證
討論
本文編號:2963632
【文章來源】:內(nèi)科理論與實踐. 2020,15(04)
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
材料與方法
一、細胞株
二、基因芯片
三、細胞復(fù)蘇與培養(yǎng)
四、RNA提取
五、單標記芯片實驗
六、實時定量PCR
七、統(tǒng)計學(xué)方法
結(jié)果
一、基因芯片結(jié)果
二、Pan IN-P細胞與Pan IN-C細胞差異基因功能匯總
三、實時定量PCR對部分芯片結(jié)果進行驗證
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