玉米（Zea.mays.L）作為我國總產(chǎn)量最高的糧食作物,其產(chǎn)量和品質的提高是保障我國糧食安全的重大舉措。全基因組選擇（Genomic Selection,GS）首先利用訓練群體估計分子標記效應,然后利用覆蓋基因組的分子標記來計算預測群體的重要農藝性狀的基因組估計育種值,從而實現(xiàn)對育種材料的篩選,因而GS在玉米的商業(yè)化育種中具有廣闊的應用前景。本研究利用骨干自交系PH4CV為父本,鄭58為母本,構建481份BC₁F₃遺傳家系。通過2016和2017年北京順義和新疆昌吉的散粉期表型鑒定和玉米55 K芯片基因型鑒定,進行全基因組關聯(lián)分析和GS分析,主要研究結果如下:1.利用兩年兩點散粉期最佳線性無偏估計值（Best Linear Unbiased Estimation,BLUE）和基因型數(shù)據(jù)進行遺傳方差分解,發(fā)現(xiàn)在散粉期遺傳變異中,加性方差占據(jù)77.6%,加加互作方差占14.3%,顯顯互作方差占5.6%,不存在加顯互作方差,說明在該群體中散粉期性狀主要受到基因加性效應影響,非加性效應并不明顯。同時,利用GWAS方法對數(shù)量性狀位點（Quantita... 

【文章來源】：中國農業(yè)科學院北京市

【文章頁數(shù)】：53 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

全基因組選擇育種流程(Crossaetal.,2017)

士學位論文 第二章 花期性狀分析群體多環(huán)境表型分析結果境下的材料，計算 2 次重復的平均值，不同環(huán)境下散粉期性狀的果如表 1，可以發(fā)現(xiàn)，散粉期數(shù)據(jù)的變異系數(shù)均在 5%以內，遺傳高溫、積溫偏高，導致 17BJ 環(huán)境下散粉期提前。表 2.1 四個環(huán)境下，BC1F3:4群體 DA 表型基本統(tǒng)計量e 2.1 Basic statistical description of DA of the BC1F3:4population in four environN Mean SD Min Max CV/%480 73.09 2.13 68.5 79.5 2.91467 72.68 2.57 67.5 79.5 3.53410 63.55 2.43 57 71 3.83355 70.13 2.69 64.5 78 3.84D：標準差；CV：變異系數(shù)；Heritability: 遺傳力性的分析和數(shù)據(jù)分布如圖 2.1。在不同環(huán)境之間相關系數(shù)在 0.48環(huán)境的相關性較高。

學院碩士學位論文 第二章 花期性狀全基因表 2.2 SNP 標記在基因組的分布Tbale 2.2 Distribution of SNPs across the genome標記個數(shù) 起始物理位置(Mb) 終止物理距離(Mb) 區(qū)間大小(Mb) 標記平均距1885 5.633 301.204 295.570 0.151162 0.167 236.968 236.801 0.201310 0.163 232.075 231.912 0.171420 4.321 246.361 242.040 0.171128 0.947 217.628 216.681 0.191043 5.398 169.227 163.829 0.15959 0.033 175.286 175.253 0.18988 0.098 175.787 175.689 0.171045 0.068 155.980 155.912 0.14841 0.276 150.018 149.743 0.17Mb大小為窗口，計算區(qū)間內的標記個數(shù)，繪制標記密度在基因組上分布的熱圖


本文編號：2957528