甜菜木葡聚糖內轉糖苷酶基因BvXTH1的克隆及功能分析
發(fā)布時間:2020-12-29 12:54
木葡聚糖內轉糖苷酶是植物細胞壁重構過程中的關鍵酶,通過增加細胞壁的延展性而促進細胞的伸長,進而影響植物的生長和發(fā)育。本研究在本課題組對甜菜塊根發(fā)育轉錄組分析基礎上,篩選出甜菜的一個XTH基因,對其進行結構特征分析、基因克隆,轉化擬南芥,功能鑒定,為揭示甜菜塊根發(fā)育分子機理提供理論依據。主要研究結果如下:1、BvXTH1基因編碼區(qū)全長876bp,BvXTH1蛋白質分子質量為31782.26Da,化學式為C1417H2113N381O436S10,等電點pI為5.04,弱酸性,疏水性平均系數為-0.357,預測可能為親水性蛋白質。BvXTH1蛋白存在XTH家族保守基序DEIDFEFLG,BvXTH1含有信號肽,在N端存在跨膜螺旋。系統(tǒng)進化樹分析推斷BvXTH1與藜麥(Chenopodium quinoa)及菠菜(Spinacia oleracea)親緣關系最近。2、BvXTH1基因在甜菜不同器官中表達量高低依次為葉﹥柄﹥根,豐產型品種表達量高于高糖型品種。3、克隆了BvXTH1基因...
【文章來源】:內蒙古農業(yè)大學內蒙古自治區(qū)
【文章頁數】:52 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
信號肽預測Fig.1Thepredictionofsignalpeptide
圖 2 跨膜結構分析Fig.2 The analysis of transmembrane3.1.3 BvXTH1 氨基酸比對及系統(tǒng)發(fā)育分析選擇菠菜(Spinacia oleracea)、擬南芥(Arabidopisthaliana )、黃瓜(Cucumis sativus甜瓜(Cucumis melo)、黃麻(Corchorus olitorius)、油棕(Elaeis guineensis)、陸地(Gossypium hirsutum)、蘆筍(Asparagus officinalis)和藜麥(Chenopodium quinoa)9 種物中的蛋白同源序列(蛋白序列號見表 4)與 BvXTH1 進行多重氨基酸序列比對,果發(fā)現這些同源序列和 BvXTH1 的同源性為 55%-87%。結果顯示 BvXTH1 蛋白含一個高度保守的結構域,為木葡聚糖內轉糖苷酶(XET)的催化結構域 DEIDFEFLG此外,BvXTH1 的 C 端有 4 個保守的半胱氨酸(Cys )(圖 2)。系統(tǒng)進化樹分析了單子葉、雙子葉、低等蕨類不同植物種類的 15 個同源蛋白親緣關系(蛋白序列號見表 4)。如圖 4 所示,BvXTH1 與菠菜(Spinacia oleracea)和麥(Chenopodium quinoa)親緣關系最近。表 4 多種植物 XTH 蛋白序列號
菠菜SpinaciaoleraceaSoXTH KNA20838黃瓜CucumissativusCsXTH NP_001267702甜瓜CucumismeloCmXTH NP_001284443木薯ManihotesculentaMeXTH OAY21801藜麥ChenopodiumquinoaCqXTH XP_021758129黃麻CorchorusolitoriusCoXTH OMO72769擬南芥ArabidopsisthalianaATXTH23 Q38910陸地棉GossypiumhirsutumGhXTH XP_016730459蘿卜RaphanussativusRsXTH XP_018457229油棕ElaeisguineensisEgXTH XP_010911439
【參考文獻】:
期刊論文
[1]過表達胡楊XTH基因能夠提高煙草抗旱性[J]. 韓彥莎,儀慧蘭. 中國生物化學與分子生物學報. 2016(08)
[2]細胞壁重構關鍵酶木葡聚糖內轉糖苷酶/水解酶(XTH)的研究進展[J]. 杜麗萍,沈昕,陳少良,胡贊民. 農業(yè)生物技術學報. 2010(03)
[3]ERF類轉錄因子OPBP1基因的超表達提高煙草的耐鹽能力[J]. 劉文奇,陳旭君,徐曉暉,凌建群,郭澤建. 植物生理與分子生物學學報. 2002(06)
碩士論文
[1]甘藍型油菜BnXTH1和BnEXPA4基因克隆及表達分析[D]. 劉慧娟.南京農業(yè)大學 2014
本文編號:2945674
【文章來源】:內蒙古農業(yè)大學內蒙古自治區(qū)
【文章頁數】:52 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
信號肽預測Fig.1Thepredictionofsignalpeptide
圖 2 跨膜結構分析Fig.2 The analysis of transmembrane3.1.3 BvXTH1 氨基酸比對及系統(tǒng)發(fā)育分析選擇菠菜(Spinacia oleracea)、擬南芥(Arabidopisthaliana )、黃瓜(Cucumis sativus甜瓜(Cucumis melo)、黃麻(Corchorus olitorius)、油棕(Elaeis guineensis)、陸地(Gossypium hirsutum)、蘆筍(Asparagus officinalis)和藜麥(Chenopodium quinoa)9 種物中的蛋白同源序列(蛋白序列號見表 4)與 BvXTH1 進行多重氨基酸序列比對,果發(fā)現這些同源序列和 BvXTH1 的同源性為 55%-87%。結果顯示 BvXTH1 蛋白含一個高度保守的結構域,為木葡聚糖內轉糖苷酶(XET)的催化結構域 DEIDFEFLG此外,BvXTH1 的 C 端有 4 個保守的半胱氨酸(Cys )(圖 2)。系統(tǒng)進化樹分析了單子葉、雙子葉、低等蕨類不同植物種類的 15 個同源蛋白親緣關系(蛋白序列號見表 4)。如圖 4 所示,BvXTH1 與菠菜(Spinacia oleracea)和麥(Chenopodium quinoa)親緣關系最近。表 4 多種植物 XTH 蛋白序列號
菠菜SpinaciaoleraceaSoXTH KNA20838黃瓜CucumissativusCsXTH NP_001267702甜瓜CucumismeloCmXTH NP_001284443木薯ManihotesculentaMeXTH OAY21801藜麥ChenopodiumquinoaCqXTH XP_021758129黃麻CorchorusolitoriusCoXTH OMO72769擬南芥ArabidopsisthalianaATXTH23 Q38910陸地棉GossypiumhirsutumGhXTH XP_016730459蘿卜RaphanussativusRsXTH XP_018457229油棕ElaeisguineensisEgXTH XP_010911439
【參考文獻】:
期刊論文
[1]過表達胡楊XTH基因能夠提高煙草抗旱性[J]. 韓彥莎,儀慧蘭. 中國生物化學與分子生物學報. 2016(08)
[2]細胞壁重構關鍵酶木葡聚糖內轉糖苷酶/水解酶(XTH)的研究進展[J]. 杜麗萍,沈昕,陳少良,胡贊民. 農業(yè)生物技術學報. 2010(03)
[3]ERF類轉錄因子OPBP1基因的超表達提高煙草的耐鹽能力[J]. 劉文奇,陳旭君,徐曉暉,凌建群,郭澤建. 植物生理與分子生物學學報. 2002(06)
碩士論文
[1]甘藍型油菜BnXTH1和BnEXPA4基因克隆及表達分析[D]. 劉慧娟.南京農業(yè)大學 2014
本文編號:2945674
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