RNF4基因調(diào)節(jié)精細(xì)胞分化和增殖過(guò)程,文章以Gen Bank下載的豬及近緣物種RNF4 mRNA序列為參考序列,設(shè)計(jì)特異引物擴(kuò)增版納微型豬近交系(BMI)RNF4基因。應(yīng)用qPCR分析15個(gè)重要組織mRNA表達(dá)譜,并對(duì)蛋白質(zhì)序列作功能生物信息學(xué)分析,構(gòu)建多物種系統(tǒng)進(jìn)化樹。研究獲得BMI RNF4 573 bp編碼區(qū)序列(Gen Bank登錄號(hào):KU705638,對(duì)應(yīng)氨基酸登錄號(hào):AOC89056),編碼190個(gè)氨基酸,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量(Mw)為21.43 ku,等電點(diǎn)(pI)為6.95。多組織熒光定量表達(dá)分析表明RNF4基因在尿道球腺、睪丸、肝、肺中高水平表達(dá);在其他11個(gè)組織中呈中低水平表達(dá)。功能生物信息學(xué)分析表明RNF4蛋白質(zhì)存在1個(gè)保守結(jié)構(gòu)域,無(wú)跨膜結(jié)構(gòu),無(wú)信號(hào)肽序列;N末端疏水,C末端疏水;有4類功能活性位點(diǎn),位于細(xì)胞核概率為94.1%。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,BMI與狗親緣關(guān)系最近。結(jié)果為研究RNF4基因在豬精細(xì)胞分化和增殖方面作用奠定基礎(chǔ)。 

【文章來(lái)源】：東北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2017年03期 第24-30頁(yè) 北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：7 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品與試劑
        1.1.1 樣品
        1.1.2 試劑
    1.2 方法
        1.2.1 RNA提取和c DNA合成
        1.2.2 引物設(shè)計(jì)及合成
        1.2.3 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系及程序
        1.2.4 多組織熒光定量表達(dá)分析
        1.2.5 序列確定和數(shù)據(jù)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 RNF4基因PCR擴(kuò)增結(jié)果
    2.2 RNF4基因序列及其編碼氨基酸序列
    2.3 多組織熒光定量表達(dá)分析
    2.4 RNF4蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)信息
    2.5 RNF4蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)
    2.6 RNF4蛋白質(zhì)功能域
    2.7 RNF4蛋白質(zhì)疏水性
    2.8 RNF4蛋白質(zhì)功能位點(diǎn)分析
    2.9 RNF4蛋白質(zhì)跨膜結(jié)構(gòu)、信號(hào)肽及在細(xì)胞中定位位置分析
    2.10 RNF4蛋白質(zhì)序列多物種系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 討論
4 結(jié)論



本文編號(hào)：2905305