毛果楊HDT901基因的表達(dá)與功能分析
發(fā)布時(shí)間:2020-11-05 16:03
組蛋白翻譯后修飾有很多種,包括乙;,甲基化,磷酸化,泛素化和ADP核糖基化。其中,組蛋白乙;且环N十分重要的表觀遺傳修飾,對(duì)于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)改變和重塑、基因表達(dá)以及環(huán)境脅迫應(yīng)答反應(yīng)具有非常重要的調(diào)控作用。組蛋白乙酰化水平由組蛋白乙;D(zhuǎn)移酶(HAT)和組蛋白去乙酰化酶(HDAC)共同調(diào)節(jié)。HDAC在植物生長(zhǎng)、發(fā)育和脅迫應(yīng)答反應(yīng)中具有十分重要的作用。目前,有關(guān)木本植物HDAC的功能研究鮮有報(bào)道。本論文從毛果楊中克隆了組蛋白去乙酰化酶HD2亞家族基因HDT901,并對(duì)其序列、表達(dá)和功能進(jìn)行了研究。毛果楊HDT901基因的編碼區(qū)長(zhǎng)度為828 bp,編碼一個(gè)由275個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì)。本論文對(duì)HDT901蛋白質(zhì)序列進(jìn)行了全面的生物信息學(xué)分析。HDT901蛋白質(zhì)具有一個(gè)典型的鋅指蛋白結(jié)構(gòu)域,其氨基酸序列與木薯HDT1 一致性最高,親緣關(guān)系最近。HDT901基因啟動(dòng)子區(qū)包含多個(gè)光反應(yīng)相關(guān)元件、赤霉素應(yīng)答元件、生長(zhǎng)素響應(yīng)元件、水楊酸響應(yīng)元件和低溫應(yīng)答元件。亞細(xì)胞定位分析表明,HDT901定位于細(xì)胞核中。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果表明,HDT901基因在毛果楊葉、莖和根中的表達(dá)受到鹽脅迫抑制。為了研究HDT901基因在鹽脅迫應(yīng)答反應(yīng)中的功能,構(gòu)建了植物過(guò)量表達(dá)載體,并遺傳轉(zhuǎn)化到擬南芥和84K楊中。HDT901基因在擬南芥中的表達(dá)促進(jìn)了擬南芥根的生長(zhǎng),降低了轉(zhuǎn)基因擬南芥對(duì)鹽和干旱脅迫的耐受性。HDT901在84K楊中的表達(dá),降低了轉(zhuǎn)基因楊樹(shù)對(duì)鹽和干旱脅迫的耐受性。這些研究結(jié)果表明,HDT901在楊樹(shù)鹽脅迫和干旱脅迫應(yīng)答反應(yīng)中發(fā)揮重要的調(diào)控作用。
【學(xué)位單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S792.11
【部分圖文】:
//D7PW基因編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增結(jié)果;1毛果楊/ffiWW編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增??分析??質(zhì)分析??tein?Analysis?Software)中的?ProtPa性質(zhì)進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,毛果29660.54,理論等電點(diǎn)為4.71,負(fù))為39,不穩(wěn)定系數(shù)是40.92?(大蛋白為不穩(wěn)定親水性蛋白。??1?T?’?!????????i????e.?J???'?I?if?:?J?:?.,?..:?-??丨4”..?i,,丨-??'?.■ini?H'i/ifia?■??■'-1?■?!?^?'f?;*?r?f;?j?i:?\i?i.??-?j??m:?n?nl-?f?-?-f?-:-??"
M?1?2??lDOObp—??750bp—??1.毛果楊//D7PW基因編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增結(jié)果;2.水(圖1毛果楊/ffiWW編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增??序列分析??理化性質(zhì)分析??pert?Protein?Analysis?Software)中的?ProtParam?在構(gòu)與理化性質(zhì)進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,毛果楊HDT9子量為29660.54,理論等電點(diǎn)為4.71,負(fù)電荷殘基Arg+Lys)為39,不穩(wěn)定系數(shù)是40.92?(大于40)可預(yù)測(cè)該蛋白為不穩(wěn)定親水性蛋白。??1?T?’?!
(Arg+Lys)39,40.92400?深A(yù)測(cè)該蛋白為不穩(wěn)定親水性蛋白。??1?T?’?!????????i????e.?J???'?I?if?:?J?:?.,?..:?-??丨4”..?i,,丨-??'?.■ini?H'i/ifia?■??■'-1?■?!?^?'f?;*?r?f;?j?i:?\i?i.??-?j??m:?n?nl-?f?-?-f?-:-??::?。?"?:;??-3.9?-1???1?>—?.?1???1???s??t?e?is??zee??圖2毛果楊HDT901蛋白的疏水性/親水性預(yù)測(cè)??■基因信號(hào)肽及碟酸化位點(diǎn)分析???Server?v.?2.0在線軟件分析該蛋白沒(méi)有形成典能不含有信號(hào)肽。利用在線工具KinasePhos對(duì)蛋白蛋白質(zhì)共有43個(gè)磷酸化位點(diǎn),其中色氨酸29個(gè),TUHMU?postoid?pr〇bst"Hiesf〇i?PtHDTSOI??1.?.??????1?■?.???
【參考文獻(xiàn)】
本文編號(hào):2871864
【學(xué)位單位】:東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位年份】:2018
【中圖分類】:S792.11
【部分圖文】:
//D7PW基因編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增結(jié)果;1毛果楊/ffiWW編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增??分析??質(zhì)分析??tein?Analysis?Software)中的?ProtPa性質(zhì)進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,毛果29660.54,理論等電點(diǎn)為4.71,負(fù))為39,不穩(wěn)定系數(shù)是40.92?(大蛋白為不穩(wěn)定親水性蛋白。??1?T?’?!????????i????e.?J???'?I?if?:?J?:?.,?..:?-??丨4”..?i,,丨-??'?.■ini?H'i/ifia?■??■'-1?■?!?^?'f?;*?r?f;?j?i:?\i?i.??-?j??m:?n?nl-?f?-?-f?-:-??"
M?1?2??lDOObp—??750bp—??1.毛果楊//D7PW基因編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增結(jié)果;2.水(圖1毛果楊/ffiWW編碼區(qū)片段的PCR擴(kuò)增??序列分析??理化性質(zhì)分析??pert?Protein?Analysis?Software)中的?ProtParam?在構(gòu)與理化性質(zhì)進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,毛果楊HDT9子量為29660.54,理論等電點(diǎn)為4.71,負(fù)電荷殘基Arg+Lys)為39,不穩(wěn)定系數(shù)是40.92?(大于40)可預(yù)測(cè)該蛋白為不穩(wěn)定親水性蛋白。??1?T?’?!
(Arg+Lys)39,40.92400?深A(yù)測(cè)該蛋白為不穩(wěn)定親水性蛋白。??1?T?’?!????????i????e.?J???'?I?if?:?J?:?.,?..:?-??丨4”..?i,,丨-??'?.■ini?H'i/ifia?■??■'-1?■?!?^?'f?;*?r?f;?j?i:?\i?i.??-?j??m:?n?nl-?f?-?-f?-:-??::?。?"?:;??-3.9?-1???1?>—?.?1???1???s??t?e?is??zee??圖2毛果楊HDT901蛋白的疏水性/親水性預(yù)測(cè)??■基因信號(hào)肽及碟酸化位點(diǎn)分析???Server?v.?2.0在線軟件分析該蛋白沒(méi)有形成典能不含有信號(hào)肽。利用在線工具KinasePhos對(duì)蛋白蛋白質(zhì)共有43個(gè)磷酸化位點(diǎn),其中色氨酸29個(gè),TUHMU?postoid?pr〇bst"Hiesf〇i?PtHDTSOI??1.?.??????1?■?.???
【參考文獻(xiàn)】
相關(guān)期刊論文 前3條
1 夏德安;劉春娟;呂世博;張彥妮;劉奕佳;馬旭俊;;植物組蛋白乙;D(zhuǎn)移酶的研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報(bào);2015年07期
2 蔣雪;臧藝玫;;表觀遺傳概述[J];生物學(xué)教學(xué);2015年04期
3 姜楠;潘學(xué)峰;;表觀遺傳學(xué)及現(xiàn)代表觀遺傳生物醫(yī)藥技術(shù)的發(fā)展[J];生物技術(shù)通報(bào);2015年04期
本文編號(hào):2871864
本文鏈接:http://www.sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/2871864.html
最近更新
教材專著