越來(lái)越多的證據(jù)表明,在癌癥的發(fā)展和進(jìn)展中,BAP1起到了關(guān)鍵作用,但是目前對(duì)BAP1基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制尚不清楚。G-四鏈體是富含串聯(lián)重復(fù)鳥(niǎo)嘌呤的DNA或RNA組成的二級(jí)結(jié)構(gòu)。由氫鍵連接的四個(gè)鳥(niǎo)嘌呤形成環(huán)狀平面G-四分體,三個(gè)或更多G-四分體堆疊形成了 G-四鏈體。大量的研究表明,G-四鏈體結(jié)構(gòu)在腫瘤發(fā)生過(guò)程中起著重要的調(diào)節(jié)作用,因此,G-四鏈體結(jié)構(gòu)和相關(guān)的解旋酶在癌癥治療中是一個(gè)新的探索領(lǐng)域。在本論文中,我們發(fā)現(xiàn)BAP1啟動(dòng)子區(qū)域反義鏈上包含多個(gè)串聯(lián)的鳥(niǎo)嘌呤以及重復(fù)序列,這些序列具有很高的形成G-四鏈體結(jié)構(gòu)的可能性。我們根據(jù)BAP1啟動(dòng)子反義鏈的鳥(niǎo)嘌呤富集區(qū)域序列合成了寡核苷酸鏈,在圓二色性光譜分析研究中,這些序列顯示了 G-四鏈體結(jié)構(gòu)特征吸收峰,進(jìn)一步的分析也揭示了它們可以形成多種G-四鏈體結(jié)構(gòu)。在報(bào)告載體研究中,BAP1啟動(dòng)子中預(yù)測(cè)G-四鏈體結(jié)構(gòu)形成序列的突變或刪除會(huì)降低報(bào)告載體的表達(dá),顯示G-四鏈體的存在促進(jìn)了 BAP1基因表達(dá)。與此相符,具有DNA解旋酶活性的染色質(zhì)重塑蛋白CHD2和CHD7與BAP1啟動(dòng)子結(jié)合并可能消除G4-四鏈體結(jié)構(gòu)以抑制BAP1基因表達(dá)�？傊�,BAP1啟動(dòng)子反義鏈上包含了可以形成G-四鏈體結(jié)構(gòu)的序列,這些G-四鏈體結(jié)構(gòu)促進(jìn)BAP1基因的表達(dá),而DNA解旋酶CHD2和CHD7可能通過(guò)解開(kāi)這些G-四鏈體來(lái)抑制BAP1基因表達(dá)。
【學(xué)位單位】：東北林業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2018
【中圖分類(lèi)】：Q78
【部分圖文】：

Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎａｌ?Ｓｔａｒｔ?Ｓｉｔｅ，在圖?３－１?中標(biāo)注為＋１）上游?１０００?ｂｐ?減基序列中?Ｇ／Ｃ??百分含量達(dá)到６９．７％，而在轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游的２００?ｂｐ堿基序列胞嘧啶與鳥(niǎo)嘌呤的含量??中更是高達(dá)７９．０％?（見(jiàn)圖３－１）。??屬一－?———￣■—?Ｐｒｏｍｏｔｅｒ?———?．＿．－５’－ＵＴＲ?爹??ＴＳＳ??－１０００?－８００?－６００?－４００?－２００?－１，＋１?＋２２７??．；??６９．７％?７９．０％，??（Ｇ／Ｃ?ｃｏｎｔｅｎｔ）??圖３－１?ＢＡＰ１基因ＴＳＳ上游啟動(dòng)子區(qū)Ｇ／Ｃ含量分析，ＴＳＳ表示轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)??Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)在基因啟動(dòng)子區(qū)域的正義鏈或反義鏈中均能夠形成。當(dāng)我們觀(guān)察??ＢＡＰ１啟動(dòng)子區(qū)時(shí)，顯然可以發(fā)現(xiàn)序列中含有很多連續(xù)的胞嘧啶分布在其中，從而其反??義鏈相應(yīng)區(qū)域形成了保守的核苷酸序列模塊（Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３－Ｎ１－７－Ｇ２３?），該??序列模型即為形成Ｇ－四鏈體的保守序列。尤其是在該區(qū)域內(nèi)，在ＴＳＳ上游２００?ｂｐ序列??內(nèi)，僅僅胞嘧啶含量就占有６２．５％?（見(jiàn)圖３－２）。因此，僅僅通過(guò)ＤＮＡ序列的特征來(lái)??看

在預(yù)測(cè)Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)中有很多種算法，在這里，我們利用了一種稱(chēng)為ＱＧＲＳ??Ｍａｐｐｅｒ的在線(xiàn)預(yù)測(cè)算法來(lái)分析ＢＡＰ１基因的啟動(dòng)子序列［８６］。從分析結(jié)果中我們發(fā)現(xiàn)，??在其反義鏈上有數(shù)個(gè)連續(xù)的鳥(niǎo)嘌呤簇的得分超過(guò)４０?（見(jiàn)圖３－３），而己知能夠形成穩(wěn)定??Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)的ＭＹＣ啟動(dòng)子內(nèi)鳥(niǎo)嘌呤富集序列得分為４２分。而有趣的一點(diǎn)是，在??ＢＡＰ１啟動(dòng)子中，一些具有高分，即具有比較高潛能形成Ｇ－四鏈體的序列是重復(fù)出現(xiàn)??的

?？Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ??ＴＳＳ??圖３－２?ＢＡＰ１基因ＴＳＳ上游啟動(dòng)子區(qū)序列??３．１．２利用ＱＧＲＳ?Ｍａｐｐｅｒ預(yù)測(cè)Ｇ－四鏈體??在預(yù)測(cè)Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)中有很多種算法，在這里，我們利用了一種稱(chēng)為ＱＧＲＳ??Ｍａｐｐｅｒ的在線(xiàn)預(yù)測(cè)算法來(lái)分析ＢＡＰ１基因的啟動(dòng)子序列［８６］。從分析結(jié)果中我們發(fā)現(xiàn)，??在其反義鏈上有數(shù)個(gè)連續(xù)的鳥(niǎo)嘌呤簇的得分超過(guò)４０?（見(jiàn)圖３－３），而己知能夠形成穩(wěn)定??Ｇ－四鏈體結(jié)構(gòu)的ＭＹＣ啟動(dòng)子內(nèi)鳥(niǎo)嘌呤富集序列得分為４２分。而有趣的一點(diǎn)是，在??ＢＡＰ１啟動(dòng)子中，一些具有高分，即具有比較高潛能形成Ｇ－四鏈體的序列是重復(fù)出現(xiàn)??的
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本文編號(hào)：2844434