高溫脅迫下黃瓜基因的表達(dá)變化
發(fā)布時(shí)間:2020-06-14 13:12
【摘要】:黃瓜(CucumissativusL.,2n=2x=14)是葫蘆科甜瓜屬一年生攀緣性草本植物,是世界上普遍栽培的一種瓜類作物,也是我國種植范圍最廣的主要蔬菜作物之一。隨著全球氣候的日趨變暖,高溫?zé)岷o黃瓜的生產(chǎn)帶來的影響日益嚴(yán)重,已經(jīng)成為我國黃瓜生產(chǎn)中急需解決的難題之一。有關(guān)黃瓜熱害分子機(jī)理尚缺乏系統(tǒng)、深入的研究。本研究在對(duì)八十份黃瓜種質(zhì)資源進(jìn)行耐熱性鑒定與篩選的基礎(chǔ)上,以黃瓜耐高溫品系'GY2'為試材,運(yùn)用RNA-seq技術(shù),分析了 43(±1)℃高溫脅迫6h(T1)和12h(T2)全基因組轉(zhuǎn)錄組水平上的差異,對(duì)候選基因在耐高溫品系'GY2'和高溫敏感品系'平望乳瓜'中進(jìn)行表達(dá)驗(yàn)證。主要研究結(jié)果如下:1.高溫脅迫處理后對(duì)兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行差異表達(dá)基因進(jìn)行分析,一共得到6063個(gè)差異表達(dá)基因。其中,43℃條件下處理6 h有3196個(gè)基因差異表達(dá),1702個(gè)基因上調(diào)表達(dá),1494個(gè)下調(diào)表達(dá);處理12 h有4711個(gè)基因差異表達(dá),2038個(gè)上調(diào)表達(dá),2673個(gè)下調(diào)表達(dá)。2.通過對(duì)差異基因GO富集、KEGG通路分析,并結(jié)合黃瓜基因組數(shù)據(jù)庫的功能注釋,我們發(fā)現(xiàn)黃瓜響應(yīng)高溫脅迫的基因主要集中在光合作用、熱激轉(zhuǎn)錄因子和熱激蛋白等3大類,結(jié)合功能注釋共確定耐高溫候選基因18個(gè)用于qRT-PCR分析。3.18個(gè)候選基因在耐高溫品系'GY2'與高溫敏感型品系'平望乳瓜'中表達(dá)驗(yàn)證結(jié)果表明,其中的6個(gè)基因可能與黃瓜應(yīng)答耐熱脅迫相關(guān),包括2個(gè)熱激轉(zhuǎn)錄因子基因和4個(gè)熱激蛋白相關(guān)基因。6個(gè)候選基因在'GY2'中隨著高溫脅迫的時(shí)間延長表達(dá)量明顯逐漸增加,而在'平望乳瓜'中,表達(dá)量無明顯變化;CsalG467710在耐/敏高溫品系中均上調(diào)表達(dá),不同溫度下在'GY2'中該基因的表達(dá)量均顯著高于平望乳瓜。初步認(rèn)為,CsalG467710在黃瓜應(yīng)答高溫脅迫中具有重要作用。
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S642.2
【圖文】:
“rRNAprocessing”和“responseto邋heat”富集顯著(圖邋2-3);邋T2邋中的差異基因“photosynthesis,逡逑light邋harvesting”、“response邋to邋heat”富集顯著(圖2-4)。由此可見,高溫脅迫過程中,光合逡逑作用、抵抗熱害與蛋白質(zhì)折疊相關(guān)的功能基因與高溫?zé)岷β?lián)系更緊密。逡逑對(duì)差異基因進(jìn)行KEGG分析顯示高溫脅迫處理共涉及到110個(gè)通路,通過富集顯著性逡逑分析在表2-3給出了富集最顯著的10個(gè)通路,主要涉及光合作用、碳固定與植物激素信號(hào)逡逑
邐Molecular邋function邐Biological邋process逡逑圖2-2差異表達(dá)基因GO注釋分類統(tǒng)計(jì)圖逡逑Figure邋2-2邋Classification邋of邋differentially邋expressed邋genes邋GO邋annotations逡逑注:橫坐標(biāo)為GO分類,縱坐標(biāo)左邊為基因數(shù)目所占百分比,右邊為基因數(shù)Q。辶x希牽埃海埃埃埃福保擔(dān)埃義希攏椋錚歟錚紓椋悖幔戾澹穡潁錚悖澹螅簀義希牽埃海埃埃埃福保擔(dān)插危危牽埃海埃埃埃梗梗福峰危牽埃海埃埃擔(dān)埃福梗跺義希恚澹簦幔猓錚歟椋沐澹穡潁錚悖澹螅簀澹危悖澹歟歟酰歟幔蟈澹穡潁錚悖澹螅簀危潁澹螅穡錚睿螅邋澹簦镥澹螅簦椋恚酰歟酰簀義,逦_弪q、''辶x希懾危保危
本文編號(hào):2712833
【學(xué)位授予單位】:揚(yáng)州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S642.2
【圖文】:
“rRNAprocessing”和“responseto邋heat”富集顯著(圖邋2-3);邋T2邋中的差異基因“photosynthesis,逡逑light邋harvesting”、“response邋to邋heat”富集顯著(圖2-4)。由此可見,高溫脅迫過程中,光合逡逑作用、抵抗熱害與蛋白質(zhì)折疊相關(guān)的功能基因與高溫?zé)岷β?lián)系更緊密。逡逑對(duì)差異基因進(jìn)行KEGG分析顯示高溫脅迫處理共涉及到110個(gè)通路,通過富集顯著性逡逑分析在表2-3給出了富集最顯著的10個(gè)通路,主要涉及光合作用、碳固定與植物激素信號(hào)逡逑
邐Molecular邋function邐Biological邋process逡逑圖2-2差異表達(dá)基因GO注釋分類統(tǒng)計(jì)圖逡逑Figure邋2-2邋Classification邋of邋differentially邋expressed邋genes邋GO邋annotations逡逑注:橫坐標(biāo)為GO分類,縱坐標(biāo)左邊為基因數(shù)目所占百分比,右邊為基因數(shù)Q。辶x希牽埃海埃埃埃福保擔(dān)埃義希攏椋錚歟錚紓椋悖幔戾澹穡潁錚悖澹螅簀義希牽埃海埃埃埃福保擔(dān)插危危牽埃海埃埃埃梗梗福峰危牽埃海埃埃擔(dān)埃福梗跺義希恚澹簦幔猓錚歟椋沐澹穡潁錚悖澹螅簀澹危悖澹歟歟酰歟幔蟈澹穡潁錚悖澹螅簀危潁澹螅穡錚睿螅邋澹簦镥澹螅簦椋恚酰歟酰簀義,逦_弪q、''辶x希懾危保危
本文編號(hào):2712833
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