【摘要】：牙鲆是一種具有經(jīng)濟(jì)價(jià)值的海洋魚類,在亞洲許多國家的水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)中都具有重要的地位。然而,日益增加的工業(yè)化養(yǎng)殖使牙鲆對多種病原菌(細(xì)菌、病毒和寄生蟲)敏感,各種傳染病的頻發(fā)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失。這其中淋巴囊腫病的暴發(fā),已成為限制牙鲆養(yǎng)殖發(fā)展的瓶頸。為了減少淋巴囊腫病的影響,通過研究相關(guān)的免疫系統(tǒng)來探索淋巴囊腫病毒的防御機(jī)制,對建立抗病品種或開發(fā)有效的疫苗和抗微生物藥物都具有重要的意義。本文主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:(1)對患淋巴囊腫病(S)和抗淋巴囊腫病(R)的牙鲆頭腎進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組重測序,所得到的原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控后,我們在抗病組獲得了平均序列條數(shù)為50712071條,包含5056521585 bp的clean data;患病組獲得了平均序列條數(shù)為53221069條,包含5307450541 bp的clean data,堿基質(zhì)量值超過20的在96.91%以上。并且所得到的clean data與牙鲆參考轉(zhuǎn)錄組mapping比率超過了82.73%。(2)以p
【圖文】：

在日本和韓國先后發(fā)現(xiàn)了患淋巴囊腫病的牙鲆和石斑魚[6]。我國于 1992 年首次發(fā)現(xiàn)了此病[7]，并于 1997 年在威海地區(qū)的牙鲆養(yǎng)殖場大規(guī)模暴發(fā)，，涉病魚報(bào)道，淋巴囊腫病毒能引起 9 目、42 科，140 種以上海水魚、淡水魚感染此病0 科，呈世界性分布[9, 10]。病魚最主要的特征是口唇部、鰭條和體表等處形成單頭瘤狀贅生物（圖 1-1）。病魚因攝食困難或呼吸受阻及體內(nèi)組織的病變而影間接的死亡，其死亡率約為 30%。雖然該病死亡率不高，但因其能通過多種渠患病率可達(dá) 80%以上，并且病魚因外形異樣而失去商業(yè)價(jià)值，成為養(yǎng)殖中對魚性疾病之一[11]。目前我國養(yǎng)殖的牙鲆、大菱鲆、真鯛、鱸魚、紫紅笛鯛和軍曹此病[7, 12-14]。并且，淋巴囊腫病的暴發(fā)與溫度有關(guān)，當(dāng)水溫處于 10～20℃時(shí)，期。并且隨著水溫的升高出現(xiàn)自愈現(xiàn)象，當(dāng)水溫超過 24℃，囊腫物脫落，病毒此外，該病的發(fā)病率還與鹽度、養(yǎng)殖密度、水質(zhì)及魚體自身免疫等相關(guān)[17-19]

圖 1-2 雙脫氧鏈終至法（sanger 法）測序示意圖Figure 1-2 Sequencing of the dideoxy chain-finger method (sanger method) 90 年代，生物芯片技術(shù)成為了生物信息學(xué)研究的主流技術(shù)。生物品中所包含的各種生物信息解剖�；蛐酒�(Microarray)又稱 DN聚核苷酸芯片和 cDNA 芯片。該技術(shù)基于核酸分子原位雜交原理RNA 反轉(zhuǎn)錄得到 cDNA 進(jìn)行雜交進(jìn)而測定基因表達(dá)量[46, 47]。雖序技術(shù)相比，提高了測序通量,降低了測序成本，但是仍然存在著
【學(xué)位授予單位】：河北農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：S943

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2616679