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馬鈴薯CDPKs家族基因的全基因組鑒定和分析

發(fā)布時間:2020-01-30 14:04
【摘要】:鈣離子是真核生物信號轉導中重要的第二信使。在植物中,細胞內(nèi)Ca2+的水平受到多種因素的影響,包括激素水平、光信號、物理損傷、非生物脅迫和病原菌侵染。在植物中,CDPKs代表具有蛋白激酶和鈣調(diào)蛋白兩種結構域的一類新型的Ca2+傳感器。CDPKs可以直接與鈣離子結合,它們的激酶活性不依賴于鈣調(diào)素蛋白。對馬鈴薯CDPKs家族進行全基因組分析,發(fā)現(xiàn)馬鈴薯基因組中共有21個CDPKs基因,這些基因都有CDPKs關鍵的結構域。馬鈴薯CDPKs基因不均等地分布在各個染色體上,其中一號和十號染色體最多。而且一號和十號染色體上的基因親緣關系非常近,可能來源于基因擴增。我們的研究有助于積累馬鈴薯的基因資源,推動馬鈴薯育種進程。
【圖文】:

馬鈴薯,結構域,等電點,分子量


78535509分子量Molecularmass64626.4167601.1660004.6157665.8763596.5264172.5860960.6656374.2556453.5561050.8657847.7163366.6960369.4759424.7068348.0370172.7356997.0558971.0264801.7159662.6656625.80等電點Isoelectricpoint5.715.426.445.239.349.015.405.025.695.975.795.565.315.955.585.175.495.775.355.446.07EFh結構域數(shù)目EFhdomainnumber444344444444444444444圖1馬鈴薯CDPKs基因的結構分析Figure1GenestructureofSolanumtuberosumCDPKsgenes4345

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