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大彈涂魚(yú)抗菌肽hepcidin基因的分子克隆與表達(dá)研究

發(fā)布時(shí)間:2019-11-07 18:44
【摘要】:哺乳動(dòng)物的研究顯示,hepcidin兼具機(jī)體鐵平衡調(diào)節(jié)與抗菌功能。Hepcidin基因在進(jìn)化上較為保守,從魚(yú)類(lèi)到哺乳類(lèi)均有存在,研究者在多種魚(yú)類(lèi)發(fā)現(xiàn)hepcidin有多亞型現(xiàn)象。至今對(duì)魚(yú)類(lèi)有關(guān)hepcidin的研究尚不夠系統(tǒng)、深入,尤其是不同亞型hepcidin的生物學(xué)功能及基因表達(dá)調(diào)控是否存在差異或生物學(xué)互補(bǔ)效應(yīng)等有待闡明。彈涂魚(yú)生態(tài)習(xí)性特別,具有兩棲性,能夠較好適應(yīng)水生與陸生條件下不同氧供給狀態(tài),該種魚(yú)生活于泥灘,接觸各種病原體的機(jī)會(huì)多,推測(cè)其免疫機(jī)能較強(qiáng)。本文以大彈涂魚(yú)(Boleophthalmus pectinirostris)為對(duì)象,研究其hepcidin的基因結(jié)構(gòu)、5'側(cè)翼序列,分析其特異性轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,并初步研究hepcidin的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)與抑菌活性,為闡明魚(yú)類(lèi)hepcidin的生物學(xué)活性及基因表達(dá)調(diào)控提供資料。本研究克隆了大彈涂魚(yú)Hepcidin基因家族的兩個(gè)亞型,即bpHep-1和bpHep-2的cDNA全長(zhǎng)及基因序列。推導(dǎo)bp Hep-1前多肽原有88aa,包含信號(hào)肽22aa,前肽40aa,成熟肽26aa;bpHep-2前多肽原也由88aa組成,包含信號(hào)肽24aa,前肽42aa,成熟肽22aa。兩個(gè)亞型的成熟肽中都含有8個(gè)Cys可形成4對(duì)二硫鍵。分子系統(tǒng)學(xué)分析顯示,基于魚(yú)類(lèi)Hepcidin的進(jìn)化樹(shù)(neighbor joining tree,NJ tree)拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)與基于多個(gè)核基因?qū)︳~(yú)類(lèi)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)吻合,骨鰾魚(yú)亞部魚(yú)類(lèi)Hepcidin以88%高支持率獨(dú)立聚支,為真真骨魚(yú)亞部(Euteleostei)的姐妹群。真真骨魚(yú)亞部中,進(jìn)化地位相對(duì)較低的原棘鰭總目(Protacanthopterygii)以72%的支持率獨(dú)立聚支,為新真骨魚(yú)類(lèi)(Neoteleostei)的姐妹群。在新真骨魚(yú)類(lèi)中,多種魚(yú)類(lèi)中具有多個(gè)hepcidin亞型,總體上以低支持率聚為2支,命名為Neo1和Neo2。大彈涂魚(yú)bpHep-1歸于Neo1,在成熟肽的N端均含有較為保守推測(cè)與鐵代謝調(diào)節(jié)有關(guān)的基序[Q-S/I-H-L/I-S/A],bp Hep-2歸入所有hepcidin序列均無(wú)該基序的Neo2。bpHep-1及bpHep-2的基因均含3個(gè)外顯子和2個(gè)內(nèi)含子,Exon 1包含5’UTR、信號(hào)肽和部分前肽序列,前肽從Exon 1跨越Exon 2一直延伸到Exon 3,Exon 3包含部分的前肽編碼序列及3’UTR。bp Hep-1 cDNA的全長(zhǎng)序列為573bp,包含267bp的開(kāi)放閱讀框,位于一側(cè)的152bp的5’UTR和另一側(cè)的154bp的3’UTR。bp Hep-2 cDNA的全長(zhǎng)序列為598bp,包含267bp的開(kāi)放閱讀框,位于一側(cè)的76bp的5’UTR和另一側(cè)的74bp的3’UTR。bp Hep-1和bpHep-2轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游-25~-30bp都存在TATA框(TATA box)。通過(guò)在線生物信息學(xué)軟件分析,bpHep-1在-1341bp/+152 bp啟動(dòng)子區(qū)域存在23個(gè)轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件,bpHep-2啟動(dòng)子在-1870bp/+75區(qū)域存在37個(gè)轉(zhuǎn)錄調(diào)控元件。bpHep-1和bpHep-2都含有C/EBPalp、SP1、Oct-1、HNF-3、TBP、GR、W T1 I-K等轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),其中C/EBPalp已被證明是哺乳動(dòng)物hepcidin的有效轉(zhuǎn)錄激活因子,HNF-3是肝和內(nèi)臟基因表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子,推測(cè)這幾個(gè)轉(zhuǎn)錄因子在hepcidin表達(dá)調(diào)控中起著重要的作用。bpHep-2啟動(dòng)子區(qū)域含有NF-κB結(jié)合位點(diǎn),而bpHep-1無(wú)該位點(diǎn),NF-κB是固有免疫因子的表達(dá)的信號(hào)通路,推測(cè)bpHep-2在固有免疫中發(fā)揮著的作用較bpHep-1更重要。利用半定量PCR和熒光定量PCR技術(shù),檢測(cè)bpHep-1和bpHep-2在大彈涂魚(yú)肝、腸、鰓、頭腎和小腸等組織中均有表達(dá),特別是在肝組織中,其表達(dá)量遠(yuǎn)高于其他組織,并且肝組織bpHep-2的相對(duì)表達(dá)量顯著高于bpHep-1。注射LPS、poly(I:C)、0.1mg/g右旋糖酐鐵對(duì)bpHep-1和bpHep-2在各組織的表達(dá)沒(méi)有顯著影響,而0.5mg/g右旋糖酐鐵刺激24h后,bp Hep-1基因在腸、頭腎和脾組織中的表達(dá)量顯著性上調(diào),bpHep-2在鰓、腸、頭腎和脾的組織中顯著性上調(diào)。這提示兩種亞型都可能參與了鐵代謝的調(diào)節(jié)。應(yīng)用pET-SUMO大腸桿菌表達(dá)載體,成功的將bp Hep-1和bpHep-2成熟肽基因片段連接至pET-SUMO載體,通過(guò)原核大腸桿菌BL21(DE3)表達(dá)出來(lái)的兩個(gè)抗菌肽再通過(guò)抑菌實(shí)驗(yàn)對(duì)其生物活性驗(yàn)證,濃度為12.5μM的bp Hep-1和bpHep-2即對(duì)大腸桿菌與金黃色葡萄球菌的生長(zhǎng)顯示出抑制效應(yīng)。綜上所述,本研究在克隆彈涂魚(yú)hepcidin兩個(gè)基因亞型的的基礎(chǔ)上,對(duì)推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行了分子系統(tǒng)學(xué)分析,對(duì)基因側(cè)翼序列進(jìn)行了啟動(dòng)子及轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分析,為深入研究魚(yú)類(lèi)hepcidin的功能奠定了重要基礎(chǔ)。研究了bp Hep-1和bpHep-2在彈涂魚(yú)不同組織中的基礎(chǔ)轉(zhuǎn)錄水平,并探究了在體內(nèi)注射免疫刺激物L(fēng)PS、PolyI:C以及不同劑量的Fe2+對(duì)bpHep-1和bpHep-2基因轉(zhuǎn)錄水平的影響,發(fā)現(xiàn)高劑量的Fe2+對(duì)兩個(gè)亞型都具有上調(diào)作用,但呈組織特異性。此外,構(gòu)建了pET-SUMO-bpHep-1和pET-SUMO-bpHep-2原核表達(dá)載體,并成功表達(dá)了bpHep-1和bpHep-2。
【圖文】:

示意圖,示意圖,低氧,鐵過(guò)載


圖1-1 Hepcidin參與調(diào)控鐵穩(wěn)態(tài)示意圖(引自牛詩(shī)雯等[46])注: A:鐵過(guò)載時(shí) B:鐵不足時(shí)1.3.4 低氧對(duì) Hepcidin 的表達(dá)研究表明,缺氧會(huì)影響機(jī)體對(duì)鐵的吸收,當(dāng)體內(nèi)鐵含量比較低時(shí),Hepcidin的表達(dá)量將會(huì)減少。Nicolas 等在 2002 年首次報(bào)道了低氧條件下培養(yǎng)的 HepG2 細(xì)胞與在正常氧含量的情況下相比,其Hepcidin mRNA 表達(dá)水平明顯降低[47]。但是關(guān)于低氧與Hepcidin表達(dá)降低的分子機(jī)制目前還不是很清楚。其中一種說(shuō)法是,低氧主要是依靠缺氧誘導(dǎo)因子(HIFs)來(lái)抑制 hepcidin 的表達(dá),HIFs與Hepcidin基因的上游調(diào)控區(qū)域結(jié)合從而使hepcidin表達(dá)降低[48]。在低氧的環(huán)境中,HIFs也會(huì)間接的影響促紅細(xì)胞生成素(Erythropoietin,EPO)、血管內(nèi)皮生長(zhǎng)因子(vascular endothelial growthfactor,VEGF)等基因的表達(dá),從而間接的使 Hepcidin 的表達(dá)受到抑制[49]。1.4 大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng)

序列,大彈涂魚(yú),肝臟,基因組DNA


bpHep-1 基因前部分序列約為 1542bp 和后部分序列約為 1416bp 的片段,bpHep-2 前部分序列約為 1793bp 和基因序列約為 796bp 的片段,,這與預(yù)期的結(jié)果一致。圖2-1 大彈涂魚(yú)肝臟基因組注:M.500-1,5000bpDNAladderMarker;1,2: 大彈涂魚(yú)肝臟基因組DNA
【學(xué)位授予單位】:深圳大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:Q78

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本文編號(hào):2557409

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