【摘要】：利用RNA-seq鑒定抗寒蘋果矮化砧木‘71-3-150’冷脅迫(4°C)響應(yīng)過程中的轉(zhuǎn)錄因子。結(jié)果表明:該砧木冷脅迫2、6、12和24 h時的樣品與未處理相比,差異表達的轉(zhuǎn)錄因子基因數(shù)分別為83、98、115和136,共計228個,表明大量轉(zhuǎn)錄因子參與該砧木的冷脅迫響應(yīng)。這些轉(zhuǎn)錄因子基因?qū)儆?2個家族,占蘋果轉(zhuǎn)錄因子總數(shù)的7.25%,包括32個WRKY、30個AP2/ERF、28個b HLH、21個MYB、13個NAC、12個HSF、10個CO-like、9個MYB_related、8個TCP、6個b ZIP、6個C2H2、6個C3H、6個GATA、5個G2-like、4個GRAS、4個HD-ZIP、4個NF-YC、4個ARF、3個Dof、3個Trihelix、2個GRF和2個NF-YB,以及B3、DBB、E2F/DP、EIL、MIKC、M-type、SBP、TALE、YABBY和ZF-HD家族的各1個成員,其中有8個在蘋果參考基因組沒有注釋。這些基因總體上分為10類表達模式,同一類表達模式中的基因均涉及到多個轉(zhuǎn)錄因子家族,表明轉(zhuǎn)錄調(diào)控在該砧木應(yīng)答冷脅迫中存在復(fù)雜機制。根據(jù)對鑒定到轉(zhuǎn)錄因子基因的功能分析,它們參與了冷適應(yīng)相關(guān)功能基因和生長發(fā)育相關(guān)功能基因的表達調(diào)控,使該砧木在冷脅迫下重建體內(nèi)物質(zhì)代謝和氧化還原平衡,獲得抗寒性,并且重建適應(yīng)冷脅迫的新的生長與發(fā)育平衡。
【圖文】：

PKM+1)小于-4)],至冷脅迫12h時其log2(F-PKM+1)值接近1,隨冷脅迫持續(xù)表現(xiàn)出劇烈上調(diào)表達(圖2-F)。I類基因在冷脅迫0~2h或0~6h不同程度上調(diào),在2h或6h后出現(xiàn)顯著下調(diào)表達(圖2-I)。J類基因呈現(xiàn)先降后升的表達模式,出現(xiàn)顯著變化的時間點分別為冷脅迫2和12h(圖2-J)。從不同表達模式的基因數(shù)量上看,I類基因最多(67個),表明大量轉(zhuǎn)錄因子基因隨冷脅迫持續(xù),表達受到抑制;其次為A、B、J類,均含有22個基因;F、C、D類分別含有21、20、19個基因;E、G、H類基因較少,分別為13、11、11個。根據(jù)蘋果中各類基因表達模式的變化趨勢圖1鑒定到的蘋果冷脅迫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子基因家族及其成員數(shù)量Fig.1TFgenefamiliesandthenumberoftheirmembersinapplerespondingtocoldstress

PKM+1)小于-4)],至冷脅迫12h時其log2(F-PKM+1)值接近1,隨冷脅迫持續(xù)表現(xiàn)出劇烈上調(diào)表達(圖2-F)。I類基因在冷脅迫0~2h或0~6h不同程度上調(diào),在2h或6h后出現(xiàn)顯著下調(diào)表達(圖2-I)。J類基因呈現(xiàn)先降后升的表達模式,出現(xiàn)顯著變化的時間點分別為冷脅迫2和12h(圖2-J)。從不同表達模式的基因數(shù)量上看,I類基因最多(67個),表明大量轉(zhuǎn)錄因子基因隨冷脅迫持續(xù),表達受到抑制;其次為A、B、J類,均含有22個基因;F、C、D類分別含有21、20、19個基因;E、G、H類基因較少,分別為13、11、11個。根據(jù)蘋果中各類基因表達模式的變化趨勢圖1鑒定到的蘋果冷脅迫響應(yīng)轉(zhuǎn)錄因子基因家族及其成員數(shù)量Fig.1TFgenefamiliesandthenumberoftheirmembersinapplerespondingtocoldstress
【作者單位】： 山東省果樹研究所;
【基金】：山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院青年科研基金項目(2014QNZ04);山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程(CXGC2016B07) 泰山學(xué)者建設(shè)工程專項經(jīng)費(魯政辦字[2013]123號) 山東省發(fā)展計劃(2014GNC113004和2017GNC13113) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項資金項目(CARS-28)~~
【分類號】：S661.1

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本文編號：2551021