【摘要】：采用亞硫酸氫鹽測序技術(shù),檢測了Cu脅迫對海州香薷(Elsholtzia haichowensis Sun)Cu抗性和非抗性種群酸性轉(zhuǎn)化酶基因啟動子甲基化的影響。結(jié)果表明,海州香薷液泡轉(zhuǎn)化酶基因(v INV)和細胞壁轉(zhuǎn)化酶基因(cw INV)的啟動子在CG位點分別表現(xiàn)出超甲基化和低甲基化的現(xiàn)象。酸性轉(zhuǎn)化酶基因啟動子CHG和CHH位點的甲基化狀態(tài)受Cu脅迫影響較大。Cu脅迫下,v INV和cw INV啟動子分別有1個CHG和6個CHH位點的甲基化狀態(tài)在Cu抗性種群和非抗性種群之間表現(xiàn)出較大差異�？笴u種群中這些甲基化差異位點對Cu脅迫不敏感,但在非抗性種群中這些位點的甲基化水平在Cu脅迫后出現(xiàn)大幅上升或下降。有些甲基化差異位點位于或者臨近預(yù)測的啟動子順式作用元件區(qū)域,可能參與Cu脅迫下酸性轉(zhuǎn)化酶基因的表達調(diào)控。
【圖文】：

(a)NMP的甲基化模式。(b)MP的甲基化模式。彩色短線表示啟動子上所有的胞嘧啶位點相對于ATG的位置;加粗紅線表示預(yù)測的CG位點簇(－1315至－1019bp)。(c)vINV啟動子圖示。+1表示ATG起始密碼子，紅色矩形表示預(yù)測的順式作用元件;黑色豎直箭頭表示2個甲基化差異位點。(d)－1061bp處CHG位點的甲基化百分比;(e)－107bp處CHH位點的甲基化百分比。(a)MethylationpatternofNMP．(b)MethylationpatternofMP．Shortcolorbarsbeneaththe100%lineshowthepositionsofallcytosinesinthevINVpromoterrelativetotheATG(notdrawntoscale)．PredictedCGclusterisshownwithaboldredline(－1315to－1019bp)．(c)SchematicrepresentationofthevINVpromoter．+1indicatestheATGstartcodon．Ｒedsolidboxesrepresentputativecis-actingelements．Blackverticalarrowsindicatethetwodifferentiallymethylatedcytosines．(d)Methylationpercentageofthe－1061bpCHG．(e)Methylationpercentageofthe－107bpCHH．圖2海州香薷vINV啟動子胞嘧啶位點的甲基化狀態(tài)Fig.2CytosinemethylationatindividualsitesinthevINVpromoterofElsholtziahaichowensis圖3不同抗性種群海州香薷cwINV啟動子整體甲基化水平Fig.3CytosinemethylationlevelsofthecwINVpromoterinElsholtziahaichowensis在海州香薷cwINV啟動子上這些甲基化差異位點中，，有4個位于預(yù)測的順式作用元件上或處于附近位置(圖4:c)。－1478和－1265bp處的CHH位點分別在5'UTＲPy-richstretch和Skn-1_motif上，而－1447和－1068bp處的CHH位點則分別在GAＲE-motif和TATC-box上游和下游2bp的位置。使用和vINV啟動子相同的程序設(shè)置標準，并沒有在cwINV啟動子上找到預(yù)測的CpG島或者CG位點簇。578植物科學(xué)學(xué)報第35卷

(a)NMP的甲基化模式。(b)MP的甲基化模式。彩色短線表示啟動子上所有的胞嘧啶位點相對于ATG的位置;加粗紅線表示預(yù)測的CG位點簇(－1315至－1019bp)。(c)vINV啟動子圖示。+1表示ATG起始密碼子，紅色矩形表示預(yù)測的順式作用元件;黑色豎直箭頭表示2個甲基化差異位點。(d)－1061bp處CHG位點的甲基化百分比;(e)－107bp處CHH位點的甲基化百分比。(a)MethylationpatternofNMP．(b)MethylationpatternofMP．Shortcolorbarsbeneaththe100%lineshowthepositionsofallcytosinesinthevINVpromoterrelativetotheATG(notdrawntoscale)．PredictedCGclusterisshownwithaboldredline(－1315to－1019bp)．(c)SchematicrepresentationofthevINVpromoter．+1indicatestheATGstartcodon．Ｒedsolidboxesrepresentputativecis-actingelements．Blackverticalarrowsindicatethetwodifferentiallymethylatedcytosines．(d)Methylationpercentageofthe－1061bpCHG．(e)Methylationpercentageofthe－107bpCHH．圖2海州香薷vINV啟動子胞嘧啶位點的甲基化狀態(tài)Fig.2CytosinemethylationatindividualsitesinthevINVpromoterofElsholtziahaichowensis圖3不同抗性種群海州香薷cwINV啟動子整體甲基化水平Fig.3CytosinemethylationlevelsofthecwINVpromoterinElsholtziahaichowensis在海州香薷cwINV啟動子上這些甲基化差異位點中，有4個位于預(yù)測的順式作用元件上或處于附近位置(圖4:c)。－1478和－1265bp處的CHH位點分別在5'UTＲPy-richstretch和Skn-1_motif上，而－1447和－1068bp處的CHH位點則分別在GAＲE-motif和TATC-box上游和下游2bp的位置。使用和vINV啟動子相同的程序設(shè)置標準，并沒有在cwINV啟動子上找到預(yù)測的CpG島或者CG位點簇。578植物科學(xué)學(xué)報第35卷
【作者單位】： 武漢大學(xué)資源與環(huán)境科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項目(21477093)~~
【分類號】：Q943.2

【參考文獻】

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1 丁國華;郭丹蒂;關(guān)e

本文編號：2550590