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荔枝SUMO結(jié)合酶基因LcSCE1的克隆與表達分析

發(fā)布時間:2019-09-27 10:36
【摘要】:通過RT-PCR和RACE技術(shù),從荔枝胚性愈傷組織中克隆得到了SUMO結(jié)合酶1基因的全長cDNA序列,命名為LcSCE1。LcSCE1 cDNA全長為840 bp,CDS全長483 bp,預(yù)測可編碼160個氨基酸。生物信息學分析發(fā)現(xiàn):LcSCE1為帶負電的親水不穩(wěn)定蛋白,沒有信號肽和跨膜結(jié)構(gòu)域,進化上,LcSCE1與麻風樹SCE1蛋白親緣關(guān)系最近。利用Real-time PCR技術(shù)研究了LcSCE1在不同組織部位的表達情況,發(fā)現(xiàn)該基因在"元紅"荔枝各組織器官中均有表達,在新葉與芽中表達量最高,膨大期果核中該基因的表達量也顯著高于成熟果核(p0.01)。此外,本研究還比較了該基因在醮核和正常核中LcSCE1的表達情況,發(fā)現(xiàn)它在醮核中的表達量顯著高于正常核(p0.01)。本研究結(jié)果表明LcSCE1可能在荔枝生長發(fā)育及醮核產(chǎn)生過程中發(fā)揮著重要作用。
【圖文】:

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,切除幾個在羧基端的氨基酸,從而使得未成熟的SUMO修飾蛋白前體轉(zhuǎn)化為成熟的SUMO修飾蛋白;之后通過與SUMO活化酶(SUMO-activat-ingenzyme,SAE)的作用,成熟的SUMO修飾蛋白會經(jīng)過SUMO活化酶轉(zhuǎn)移到SUMO結(jié)合酶(SUMO-conjugatingEnzyme,SCE,又名Ubiquitin-conjugatingenzyme,UBC9)上;通過一個或多個的SUMOE3連接酶來識別目標蛋白,并將成熟的SUMO修飾蛋白連接到目標蛋白上;最后,在SUMO特異蛋白酶(SENPs)的作用下使SUMO修飾蛋白與目標蛋白解離,恢復到單獨的游離狀態(tài)(韋瑋等,2008),接著進行下一個SUMO化修飾的循環(huán)(圖1)。植物SUMO化修飾過程與動物類似,也主要包括活化、結(jié)合、連接和去SUMO化4個環(huán)節(jié)(Novatchkovaetal.,2004;初冰和陳禹先,2013)。蛋白SUMO化修飾會影響目標蛋白的亞細胞定位(廖書勝,2008;Yangetal.,2012;李玲等,2013)、活性(Lietal.,2007;Kangetal.,2001)、信號傳遞功能(Lalioti,2002;過倩萍,2010;黃海等,2011)等,在生物生命活動中發(fā)揮著調(diào)節(jié)作用。SCE1基因是SUMO化修飾過程中的重要酶基因,它在動植物中的作用已有了大量報道。荔枝SCE1基因的相關(guān)研究圖1植物SUMO化修飾過程(Geiss-FriedlanderandMatunis.,2007)Figure1ProcessofSUMOmodificationinplant(Geiss-Friedlan-derandMatunis.,2007)還未見報道,因此,本研究擬根據(jù)亞麻,大豆,甜橙和麻風樹等SUMO結(jié)合酶基因的序列信息,利用RT-PCR與RACE技術(shù)獲得荔枝SCE1基因并研究其在荔枝不同組織器官中的表達模式,以期為揭示LcSCE1在荔枝的作用機制奠定基矗1結(jié)果與分析1.1荔枝LcSCE1基因的全長cDNA的獲得通過同源比對設(shè)計SCE1保守區(qū)域擴增引物,,擴增獲得長度為315bp的保守序列,并通過所得到的保守序列設(shè)計3'RACE和5'RACE巢?

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本文編號:2542665

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