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基于轉錄組的荔枝ARF基因家族的鑒定及表達分析

發(fā)布時間:2019-09-24 01:44
【摘要】:生長素反應因子(Auxin Response Factors,ARFs)是調(diào)節(jié)生長素表達的轉錄因子響應基因,ARF基因在植物中大多由多基因家族組成;谵D錄組數(shù)據(jù),通過生物信息學方法對荔枝ARF基因進行鑒定,并分析其理化性質(zhì)、亞細胞定位、保守基序、系統(tǒng)進化以及基因的表達模式。在荔枝中鑒定出21個ARF基因,其編碼的蛋白質(zhì)含有53~1 117個氨基酸,分子量約為6.112~123.872 ku,等電點為4.21~9.45。亞細胞定位預測結果顯示21個ARF均定位于細胞核。Lc ARFs基因家族具有相對保守的結構,即包含1個保守的B3 DNA結構域、ARF結構域和Aux/IAA結構域。進化樹分析表明荔枝ARF蛋白分為5個亞家族。21個荔枝ARF基因在花穗發(fā)育過程中有明顯不同的表達規(guī)律。該結果為進一步深入研究荔枝ARF基因家族的功能奠定了基礎。
【作者單位】: 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學院南亞熱帶作物研究所農(nóng)業(yè)部熱帶果樹生物學重點實驗室;
【基金】:中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務專項(No.1630062016006) 國家荔枝龍眼產(chǎn)業(yè)技術體系(No.CARS-33-21)
【分類號】:S667.1

【相似文獻】

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本文編號:2540586

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