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百脈根ACC氧化酶基因LcACO1的克隆及序列分析

發(fā)布時(shí)間:2019-05-28 20:54
【摘要】:植物激素乙烯參與植物生長(zhǎng)發(fā)育多個(gè)生理過(guò)程的調(diào)控。ACC氧化酶是植物乙烯合成途徑中的關(guān)鍵合成酶。本研究依據(jù)其它物種ACC氧化酶序列信息設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物,并結(jié)合RT-PCR和快速擴(kuò)增c DNA末端技術(shù)從牧草百脈根中首次克隆到ACC氧化酶基因的全長(zhǎng)c DNA序列,命名為L(zhǎng)cACO1。LcACO1全長(zhǎng)c DNA為1 012 bp,具有一個(gè)924 bp ORF可編碼307個(gè)氨基酸殘基。生物信息學(xué)分析表明,LcACO1是含有Fe2+依賴的加氧酶結(jié)構(gòu)域的穩(wěn)定親水蛋白,沒(méi)有信號(hào)肽和跨膜結(jié)構(gòu)域,亞細(xì)胞定位于細(xì)胞質(zhì)。與其它植物中的ACO蛋白進(jìn)行同源性比對(duì)顯示,LcACO1蛋白與鷹嘴豆中ACO蛋白的一致性高達(dá)90%。實(shí)時(shí)熒光定量PCR表明,LcACO1基因在百脈根不同組織器官中差異表達(dá),根中表達(dá)量最高,推測(cè)其主要在根的生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)節(jié)方面發(fā)揮作用。
[Abstract]:Ethylene, a plant hormone, is involved in the regulation of many physiological processes of plant growth and development. ACC oxidase is the key enzyme in the pathway of plant ethylene synthesis. In this study, degenerate primers were designed according to the sequence information of ACC oxidase in other species, and the full-length c-DNA sequence of ACC oxidase gene was cloned from herbage root for the first time by RT-PCR and rapid amplification of c-DNA terminal technique. The full length c DNA named LcACO1.LcACO1 is 1,012 bp, with a 924 bp ORF encoding 307amino acid residue. Bioinformatics analysis showed that LcACO1 was a stable hydrophilic protein containing Fe2 dependent aerase domain, no signal peptide and transmembrane domain, and subcellular localization in cytoplasm. The homology comparison with ACO protein in other plants showed that the consistency between LcACO1 protein and ACO protein in chickpea was as high as 90%. Real-time fluorescence quantitative PCR showed that LcACO1 gene was differentially expressed in different tissues and organs of Baimai root, and the highest expression was found in roots. It was speculated that LcACO1 gene mainly played a role in the regulation of root growth and development.
【作者單位】: 西安文理學(xué)院 生物與環(huán)境工程學(xué)院;
【基金】:西安市科技計(jì)劃項(xiàng)目(CXY1443WL23) 陜西省教育廳科研項(xiàng)目(2015DC031)共同資助
【分類號(hào)】:S541.6;Q943.2

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本文編號(hào):2487357

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