【摘要】：目的:了解pnc A基因變異與結(jié)核分枝桿菌耐多藥表型、菌株基因型及初/復(fù)治結(jié)核病的關(guān)系,為結(jié)核分枝桿菌耐吡嗪酰胺的分子檢測及耐藥機制提供實驗室數(shù)據(jù)。方法:收集肺結(jié)核患者痰標(biāo)本,行抗酸桿菌涂片、結(jié)核分枝桿菌培養(yǎng)、菌型鑒定、藥物敏感試驗及基因分型鑒定,提取結(jié)核分枝桿菌DNA,行pnc A基因擴增及測序,與NCBI數(shù)據(jù)庫中標(biāo)準(zhǔn)菌株H37Rv序列比對,最后整理分析結(jié)果。結(jié)果:篩選出耐多藥結(jié)核分枝桿菌103株(耐多藥組)及對一線四種抗結(jié)核藥物(HRSE)均敏感的臨床分離株110例(敏感組)。耐多藥組中,初治28.2%,復(fù)治71.8%;北京型菌株70.9%,非北京型菌株29.1%;48株發(fā)生pnc A基因變異,突變率為46.6%(18/103),其中初治突變占25%,復(fù)治突變占75%,北京型突變菌株占75%,非北京型突變菌株占25%。共檢測到52種pnc A基因突變類型,其中18種與結(jié)核分枝桿菌PZA耐藥高信度相關(guān)、18種已有文獻報道、16種未見文獻報道目前暫定為pnc A基因新突變,包括FSC46(Del G)、CCG54GCG、TTC58GTC、CCG62TCG、TCC65CCC、GGT97CGT、GAA107CAA、GAT126AAT、GAT126CAT、GTC131TTC、ACC135GCC、GTG155GAG、GGT162CGT、GCC170CCC、GTC180CTC及GAG181AAG,已報送美國基因庫進一步核實。敏感組中,初治79.1%,復(fù)治20.9%;北京型菌株52.7%,非北京型菌株47.3%;僅3例出現(xiàn)pnc A基因變異,變異率為2.7%(3/110),其中2株為初治,1株為復(fù)治,2株為北京型,1株為非北京型,CAT42AAT、CGC29TGC及FSC167(Ins C)為新突變類型,已報送美國基因庫進一步核實。結(jié)論:結(jié)核分枝桿菌耐多藥表型與pnc A基因變異存在相關(guān)性,結(jié)合耐多藥表型及pnc A突變可以一定程度預(yù)測和提示可能存在吡嗪酰胺耐藥;北京家族菌株是耐多藥結(jié)核病的主要流行菌株,北京基因型菌株可能更容易對吡嗪酰胺耐藥;復(fù)治結(jié)核病結(jié)核分枝桿菌pnc A基因突變率明顯增高。
[Abstract]:Aim: to investigate the relationship between pnc A gene mutation and multidrug resistance phenotype, genotype of Mycobacterium tuberculosis and primary / retreatment of tuberculosis, and to provide laboratory data for molecular detection and mechanism of resistance to pyrazinamide in Mycobacterium tuberculosis. Methods: sputum samples of patients with pulmonary tuberculosis were collected. The smear of acid-fast bacilli, culture of Mycobacterium tuberculosis, identification of bacteria type, drug sensitivity test and genotyping were collected. The DNA, of Mycobacterium tuberculosis was amplified and sequenced by pnc A gene. The results were compared with that of standard strain H37Rv in NCBI database, and the results were analyzed at last. Results: 103strains of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis (MDR group) and 110 clinical isolates (sensitive group) sensitive to the first-line four anti-tuberculosis drugs (HRSE) were screened. In the multi-drug resistant group, the initial treatment rate was 28.2%, the retreatment rate was 71.8%, the Beijing type strain was 70.9%, the non-Beijing type strain was 29.1%. The mutation rate of pnc A gene was 46.6% (18 / 103) in 48 strains, of which 25% were newly diagnosed, 75% were re-treated, 75% were Beijing-type, and 25% were non-Beijing-type. A total of 52 pnc A gene mutations were detected, 18 of which were associated with the high reliability of PZA resistance in Mycobacterium tuberculosis, 18 have been reported, and 16 have not been tentatively reported as new mutations in the pnc A gene, including FSC46 (Del G), CCG54GCG,TTC58GTC,. CCG62TCG,TCC65CCC,GGT97CGT,GAA107CAA,GAT126AAT,GAT126CAT,GTC131TTC,ACC135GCC,GTG155GAG,GGT162CGT,GCC170CCC,GTC180CTC and GAG181AAG, have been reported to the US gene bank for further verification. In the sensitive group, the first treatment rate was 79.1%, the re-treatment rate was 20.9%, the Beijing type strain was 52.7%, the non Beijing type strain was 47.3%. The mutation rate of pnc A gene was 2.7% in only 3 cases. Among them, 2 strains were newly diagnosed, 1 was retreated, 2 were Beijing type, 1 was non-Beijing type, and CAT42AAT,CGC29TGC and FSC167 (Ins C) were new mutation types. Reported to the U. S. gene bank for further verification. Conclusion: there is a correlation between multidrug resistance phenotype of Mycobacterium tuberculosis and mutation of pnc A gene. The combination of multidrug resistance phenotype and pnc A mutation can predict and suggest the existence of pyrazinamide resistance to some extent. Beijing family strains are the main strains resistant to multi-drug tuberculosis, and Beijing genotype strains may be more susceptible to pyrazinamide resistance, and the mutation rate of pnc A gene in retreated Mycobacterium tuberculosis is significantly increased.
【學(xué)位授予單位】：遵義醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R52

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本文編號：2466842