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黑曲霉誘導子作用下青錢柳細胞轉錄組測序及三萜代謝基因差異分析與克隆

發(fā)布時間:2019-04-01 23:43
【摘要】:青錢柳中含有多種活性次生代謝產(chǎn)物,已被批準為一種新的食品原料,但由于其繁育困難導致資源匱乏,嚴重制約了其開發(fā)利用。三萜是其中重要的活性成分之一,本實驗室利用植物細胞培養(yǎng)技術建立了穩(wěn)定的青錢柳細胞懸浮培養(yǎng)體系,以之生產(chǎn)三萜酸,采用添加外源誘導子方法以促進三萜的合成,已從信號分子轉導途徑和MAPK途徑初步探索了ANE(黑曲霉誘導子)的誘導作用機制。為了更加深入地探索ANE促進細胞合成三萜的作用機制,本文研究了ANE誘導作用下青錢柳懸浮培養(yǎng)細胞抗氧化相關酶的變化規(guī)律,采用Illumina HiSeq 4000測序技術對細胞進行了轉錄組測序分析,以發(fā)掘青錢柳轉錄水平的生物信息,對ANE誘導下抗氧化系統(tǒng)、調(diào)控次生代謝途徑的調(diào)控因子、JA信號轉導途徑及三萜代謝途徑中的差異表達基因進行了全面的分析,并對關鍵酶基因CpSS(青錢柳鯊烯合成酶)進行了克隆及生物信息學分析,從基因表達調(diào)控的角度探討了ANE誘導調(diào)控青錢柳萜類代謝的分子機制。主要結果和結論如下:(1)ANE誘導作用下青錢柳懸浮培養(yǎng)細胞抗氧化相關酶的活性變化規(guī)律:加入ANE誘導10 h左右,細胞三萜含量開始升高,至60 h時達到最高值,含量由12.47μg/mg增至36.46μg/mg,為對照組的3.36倍。ANE誘導作用下,過氧化物酶(POD)、超氧化物歧化酶(SOD)、過氧化氫酶(CAT)、苯丙氨酸解氨酶(PAL)和磷脂酶(PLC)這五種抗氧化系統(tǒng)相關酶的活性均發(fā)生了明顯的時序性變化,各酶的活性均較對照組有明顯的提高。SOD的活性分別在誘導1 h、8 h、66 h時出現(xiàn)了3個峰值,POD酶的活性在分別在誘導1 h、8 h、21 h、66 h時出現(xiàn)4個峰值,CAT酶的活性分別在誘導2 h、8 h、24 h、54 h和66 h時出現(xiàn)了5個峰值,PAL酶的活性分別在誘導7 h、18 h和42 h時出現(xiàn)了3個峰值,PLC酶的活性分別在誘導6 h和24 h時出現(xiàn)了峰值。(2)ANE作用下細胞轉錄組測序與分析:本文采用Illumina HiSeq 4000測序平臺分別對青錢柳懸浮細胞對照組(未添加ANE)、ANE誘導20 h和60 h這三個樣本進行了轉錄組測序,獲得了67230個高質(zhì)量Unigene序列,平均長度和N50分別為744 bp和1379 bp;將組裝得到的67230個Unigenes通過BlastX與NR、Pfam、String、Swissprot、GO、COG和KEGG七個公共數(shù)據(jù)庫進行序列比對分析,有49.78%的Unigenes比對到公共數(shù)據(jù)庫中;共有7694個Unigenes注釋到25個COG功能分類中;共有19398個Unigenes注釋到GO功能分類中,獲得了128396條GO注釋信息。此外,獲得了14986個SSR序列,為進一步的遺傳學分析提供了豐富的信息。(3)ANE作用下細胞差異表達基因分析:通過對細胞Unigenes的差異表達分析,發(fā)現(xiàn)誘導20 h、誘導60 h與CK對照組的DEGs(差異表達基因)分別有24788、24336個;其中與抗氧化系統(tǒng)相關的20個POD、3個SOD和1個CAT候選基因發(fā)生了上調(diào);與JA信號轉導途徑相關的9個JAZ、2個JAR和12個MYC2候選基因發(fā)生了差異表達;鑒定出了15990條候選TF(轉錄因子)基因,其中可能參與調(diào)控三萜代謝途徑的bHLH、ERF、NAC、C2H2和WRKY等TF家族的差異表達基因較多;鑒定出了75個參與萜類骨架生物合成途徑的候選基因及22個參與三萜類生物合成途徑的候選基因。此外,采用RT-qPCR檢測對與三萜代謝相關的12個表達量上調(diào)基因進行驗證,結果顯示這12個基因表達量上調(diào),與轉錄組測序數(shù)據(jù)一致。(4)CpSS全長基因克隆及序列分析:本文根據(jù)青錢柳懸浮培養(yǎng)細胞轉錄組測序信息,注釋到了鯊烯合成酶的候選基因;以該基因序列為基礎,采用RT-PCR和RACE技術從細胞中克隆出了全長為1667 bp的CpSS基因cDNA序列,該序列包含了一個1245 bp的完整ORF,編碼414個氨基酸;CpSS序列與胡桃SS基因的相似度最高,相似度達到了97%,與白樺、葡萄、大豆、甘草、可可等物種的相似度都達85%以上,與胡桃和白樺的親緣性關系最近。序列分析表明,CpSS蛋白屬于不穩(wěn)定親水蛋白,具有典型的鯊烯合成酶保守區(qū)和結構域,存在于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜中,由多個α螺旋組成空穴狀結構,該結構與大多數(shù)植物鯊烯合成酶蛋白的空間結構相似。綜上所述,青錢柳懸浮培養(yǎng)細胞在ANE誘導作用下,抗氧化相關酶的活性明顯提高,通過JA信號轉導途徑介導,調(diào)控三萜合成途徑中的轉錄因子,使其途徑中的關鍵酶基因發(fā)生差異表達,從而促進細胞中三萜的合成與積累。
[Abstract]:......
【學位授予單位】:江西農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:Q943.2;TS201

【參考文獻】

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本文編號:2452017

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