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合成基因線路規(guī)模化設計面臨的挑戰(zhàn)

發(fā)布時間:2019-03-08 10:56
【摘要】:隨著合成基因線路規(guī)模的增加,傳統(tǒng)的合成基因線路設計思路的瓶頸逐漸凸顯,許多之前被忽略的因素對大規(guī);蚓路的性能可能造成顯著影響,這對合成基因線路的設計帶來了新的挑戰(zhàn)。本文重點梳理了基因表達噪聲和競爭效應兩方面對基因線路性能的影響,闡釋了二者間的緊密聯(lián)系,并基于理性設計的思路,從模擬-數字運算設計、網絡拓撲設計、基因線路中的信息傳遞理論和動態(tài)信號等方面,歸納總結了解決這些問題的潛在方案,并展望了規(guī);铣苫蚓路理性設計的未來發(fā)展方向。
[Abstract]:With the increase of the size of synthetic gene circuit, the bottleneck of traditional synthetic gene circuit design is becoming more and more prominent, and many previously neglected factors may have a significant impact on the performance of large-scale gene circuit. This brings new challenges to the design of synthetic gene circuits. This paper focuses on the influence of gene expression noise and competition effect on gene circuit performance, explains the close relationship between the two, and based on the rational design idea, from the analog-digital computing design, network topology design, In terms of information transmission theory and dynamic signal in gene circuits, the potential solutions to these problems are summarized, and the future development direction of rational design of large-scale synthetic gene circuits is prospected.
【作者單位】: 清華大學合成與系統(tǒng)生物學研究中心生物信息學教育部重點實驗室自動化系;清華信息科學與技術國家實驗室(籌)生物信息學研究部;
【基金】:國家自然科學基金(Nos.61322310,31371341) 清華大學自主科研項目(No.20141081175)資助~~
【分類號】:Q78

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本文編號:2436734

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