【摘要】：從單細胞尺度進行細胞異質(zhì)性的分析是深度理解細胞群體關(guān)系的關(guān)鍵。組織中的單細胞由于細胞類型不同,尺寸往往相差很大,但是目前常用的基于微孔板和Fluidigm公司的微流控的單細胞組學(xué)研究方法,需要入口的單細胞大小相近。本研究以胃組織為例,建立了一種組織單細胞的基因變異分析方法,實現(xiàn)了尺寸差異較大的單細胞的基因變異分析。在該方法中,先將胃組織裂解獲得單個腺體,再將單個腺體酶解得到不同大小的腺體內(nèi)單細胞,然后把這些單細胞鋪在聚乙烯萘膜載玻片上,進行激光顯微切割分選、全基因組放大,最后測其微衛(wèi)星的長度。利用該方法,成功在腸上皮化生腺體內(nèi)部檢測到微衛(wèi)星長度的變化,并靈活地對尺寸差異大的組織細胞以及腸化生腺體細胞進行了精細分析。此外,這種單細胞分析方法還可以對帶有不同標記的細胞進行低通量和高通量的基因組分析,為單細胞尺度上的組織異質(zhì)性研究提供了一種高度靈活的分析方法。
[Abstract]:The analysis of cell heterogeneity on a single cell scale is the key to a deep understanding of cell population relationship. The size of single cells in tissue varies greatly due to different cell types. However, the current microfluidic single cell research methods based on micropore plate and Fluidigm company require the same size of the single cell entrance. In this study, a method for the analysis of single cell gene variation in gastric tissue was established, and the genetic variation analysis of single cell with great difference in size was realized. In this method, a single gland is obtained by splitting the stomach tissue, and then the single cells of different sizes are obtained by enzymatic hydrolysis. Then, the single cells are laid on the polyethylene naphthalene film slide glass for laser microdissection and sorting. The whole genome was amplified and the length of the microsatellite was finally measured. Using this method, microsatellite length was detected successfully in intestinal metaplasia glands, and the fine analysis of large size difference tissue cells and intestinal metaplasia gland cells was carried out. In addition, this single cell analysis method can also carry out low throughput and high throughput genomic analysis of cells with different markers, which provides a highly flexible analysis method for the study of tissue heterogeneity on a single cell scale.
【作者單位】： 上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院;上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬仁濟醫(yī)院;上海交通大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)重大研究計劃項目(編號:91529302)資助~~
【分類號】：Q23

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