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酒酒球菌β-葡萄糖苷酶基因克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-12-20 22:04
【摘要】:【目的】從分子水平上揭示酒酒球菌β-葡萄糖苷酶基因(bgl)的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),為β-葡萄糖苷在酒酒球菌中的代謝研究提供理論依據(jù)!痉椒ā坎捎肞CR法從4株優(yōu)良的酒酒球菌(SD-1d,SD-2gf,31-DH和NM-2c)中克隆目的基因,并對其編碼產(chǎn)物進(jìn)行生物信息學(xué)分析!窘Y(jié)果】bgl基因含有一個(gè)完整的開放閱讀框,全長2 215 bp,編碼737個(gè)氨基酸,起始密碼子為TTG,終止密碼子為TAA。生物信息學(xué)分析均顯示該蛋白疏水性較弱,無信號肽,無跨膜區(qū),屬于糖苷水解酶家族3成員。【結(jié)論】bgl基因編碼產(chǎn)物為1個(gè)81 625.3 u蛋白,具有一個(gè)明顯的β-葡萄糖苷酶活性位點(diǎn),為非分泌蛋白,主要存在于細(xì)胞質(zhì)中。
[Abstract]:[objective] to reveal the structural characteristics of 尾 -glucosidase gene (bgl) of Bacillus cereus at molecular level. To provide a theoretical basis for the study of 尾 -glucoside metabolism in Bacillus cereus. [methods] the target genes were cloned from four excellent strains of SD-1d,SD-2gf,31-DH and NM-2c by PCR method. The bgl gene contains a complete open reading frame. The total length of 2 215 bp, encodes 737 amino acids, and the initial codon is TTG, terminator codon is TAA.. Bioinformatics analysis showed that the protein had weak hydrophobicity, no signal peptide, no transmembrane region, and belonged to 3 members of the glycoside hydrolase family. [conclusion] the encoding product of bgl gene was 1 81 625.3 u protein. It has an obvious 尾-glucosidase activity site, which is a non-secretory protein and mainly exists in the cytoplasm.
【作者單位】: 西北農(nóng)林科技大學(xué)葡萄酒學(xué)院;西北農(nóng)林科技大學(xué)園藝學(xué)院;陜西省葡萄與葡萄酒工程技術(shù)研究中心;西北農(nóng)林科技大學(xué)合陽葡萄試驗(yàn)示范站;
【基金】:國家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃項(xiàng)目(2016YFD0400504) 國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(nycytx-30-ch-03)
【分類號】:Q811.4;TS262.6

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