【摘要】：為了解我國主要對蝦養(yǎng)殖區(qū)的白斑綜合征病毒(WSSV)膠原蛋白基因(wsv001)蛋白結構變異情況,以2015年13個省市發(fā)病地區(qū)采集的57份WSSV陽性樣品為模板,用特異引物對目的片段進行擴增,連接轉化擴增片段并進行測序分析。結果顯示,57份WSSV陽性樣品中,擴增出現(xiàn)條帶的樣品共有18份。氨基酸序列比對結果顯示,擴增的wsv001片段所編碼氨基酸出現(xiàn)三類變異,包括18個氨基酸小片段缺失,121個氨基酸大片段缺失及氨基酸插入,此外,還有8個氨基酸存在突變。結果表明,我國不同地區(qū)wsv001基因及其編碼氨基酸存在明顯缺失變異。對wsv001蛋白結構缺失變異的分析,為進一步對其蛋白功能和WSSV毒株毒力及WSSV對環(huán)境適應能力的研究提供參考。
[Abstract]:In order to understand the structural variation of (WSSV) collagen gene (wsv001) of white spot syndrome virus (WSSV) in main shrimp culture areas in China, 57 WSSV positive samples collected from 13 provinces and cities in 2015 were used as template. The target fragment was amplified with specific primers, ligated and transformed into the amplified fragment and sequenced. The results showed that 18 of 57 WSSV positive samples were amplified. The results of amino acid sequence alignment showed that there were three kinds of variations in amino acids encoded by the amplified wsv001 fragment, including 18 small amino acid deletion, 121 large amino acid deletion and amino acid insertion, in addition, there were 8 amino acid mutations. The results showed that the wsv001 gene and its encoded amino acids in different regions of China were significantly deleted and mutated. The analysis of structural deletion of wsv001 protein provides a reference for further study on its protein function, virulence of WSSV strain and adaptability of WSSV to environment.
【作者單位】： 農業(yè)部海洋漁業(yè)可持續(xù)發(fā)展重點實驗室中國水產科學研究院黃海水產研究所;上海海洋大學水產與生命學院;青島海洋科學與技術國家實驗室海洋漁業(yè)科學與食物產出過程功能實驗室;
【基金】：國家重點基礎研究發(fā)展計劃(2012CB114401) 農業(yè)部948項目(2016-X56)
【分類號】：S945.4

【參考文獻】

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【相似文獻】

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本文編號：2335387