【摘要】：【目的】本文旨在獲得雨生紅球藻中藍(lán)光受體向光素(Phototropin,PHOT)的全長(zhǎng)序列并進(jìn)行生物信息分析。【方法】采用同源克隆和RACE結(jié)合的方法獲得雨生紅球藻中編碼HaePHOT的c DNA序列全長(zhǎng),并對(duì)HaePHOT進(jìn)行生物信息分析。【結(jié)果】HaePHOT的開(kāi)放閱讀框全長(zhǎng)為2139 bp,編碼712個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)的等電點(diǎn)8.66,理論分子量78.73 k D。經(jīng)BLASTP程序分析,與擬南芥來(lái)源PHOT的相似性達(dá)到58%,與萊茵衣藻來(lái)源PHOT的相似性達(dá)到68%。通過(guò)序列比對(duì)和結(jié)構(gòu)域分析,PHOT蛋白的典型結(jié)構(gòu)域存在于HaePHOT中,包括發(fā)色團(tuán)結(jié)合和激酶結(jié)構(gòu)域。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,高等植物和真核綠藻來(lái)源PHOTs來(lái)自共同祖先�！窘Y(jié)論】首次從雨生紅球藻中獲得編碼PHOT的基因序列,為下一步雨生紅球藻中PHOT的表達(dá)和功能研究奠定基礎(chǔ),同時(shí)為解析藍(lán)光調(diào)控雨生紅球藻蝦青素合成的分子機(jī)制提供線索。
[Abstract]:[objective] to obtain blue light receptor pheromone (Phototropin,) from Haematococcus pluvialis. [methods] the full length of c DNA encoding HaePHOT in Haematococcus pluvialis was obtained by homologous cloning and RACE binding. The total length of HaePHOT open reading frame was 2139 bp, encoding 712 amino acids, the predicted isoelectric point was 8.66, and the theoretical molecular weight was 78.73 KD. By BLASTP program analysis, the similarity between PHOT and Arabidopsis PHOT was 58 and 68 with PHOT from Chlamydomonas rhinorrhoeae. By sequence alignment and domain analysis, the typical domain of PHOT protein was found in HaePHOT, including chromophore binding and kinase domain. Phylogenetic analysis showed that PHOTs from higher plants and eukaryotes originated from common ancestors. [conclusion] the gene sequence encoding PHOT was obtained for the first time from Haematococcus pluvialis, which laid a foundation for further study on the expression and function of PHOT in Haematococcus pluvialis. At the same time, it provides clues to the molecular mechanism of the regulation of astaxanthin synthesis by blue light.
【作者單位】： 大連大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;中國(guó)科學(xué)院煙臺(tái)海岸帶研究所海岸帶生物學(xué)與生物資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;中國(guó)科學(xué)院大學(xué);深圳大學(xué)生命與海洋科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(201611258038) 國(guó)家自然基金項(xiàng)目(41376139)
【分類(lèi)號(hào)】：Q943.2

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本文編號(hào)：2317388