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茶樹HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及其對非生物脅迫的響應(yīng)分析

發(fā)布時間:2018-09-05 18:51
【摘要】:茶樹作為一種葉用植物,具有重要的經(jīng)濟(jì)價值。非生物脅迫對茶樹的生長發(fā)育過程和茶葉的生產(chǎn)影響很大。本研究采用RT-PCR方法從茶樹‘龍井43’cDNA中克隆獲得1個編碼HD-Zip轉(zhuǎn)錄因子的基因CsHB1。序列分析顯示,CsHB1基因cDNA長為1 380 bp,編碼459個氨基酸,含有典型的START結(jié)構(gòu)域。進(jìn)化分析顯示,茶樹CsHB1屬于HD-Zip家族轉(zhuǎn)錄因子的IV亞族。多序列對比發(fā)現(xiàn),CsHB1與其他物種的HD-Zip類蛋白的氨基酸序列具有78.05%的相似性,如葡萄、煙草、芝麻等。對CsHB1轉(zhuǎn)錄因子理化性質(zhì)、親/疏水性、無序化分析顯示,CsHB1轉(zhuǎn)錄因子是疏水性蛋白且顯偏堿性,不存在無序化區(qū)域?臻g結(jié)構(gòu)分析顯示,CsHB1有3個α-螺旋,多個β-折疊,且有START結(jié)構(gòu)域。利用熒光定量PCR方法分析了CsHB1在高溫(38°C)、低溫(4°C)、PEG干旱(200 g·L~(-1))、NaCl(200 mmol·L~(-1))處理1、4、8、12 h的表達(dá)情況。結(jié)果表明,CsHB1基因在不同非生物脅迫處理下均能誘導(dǎo)表達(dá),且表達(dá)差異性明顯。
[Abstract]:As a kind of leaf plant, tea plant has important economic value. Abiotic stress has a great effect on the growth and development of tea plants and tea production. In this study, a gene encoding HD-Zip transcription factor, CsHB1., was cloned from tea plant 'Longjing 43'cDNA by RT-PCR method. Sequence analysis showed that the cDNA length of CsHB1 gene was 1 380 bp, encoding 459 amino acids, which contained a typical START domain. Phylogenetic analysis showed that tea CsHB1 belonged to the IV subfamily of transcription factors of HD-Zip family. The amino acid sequence of CsHB1 was 78.05% similar to that of other species, such as grape, tobacco, sesame and so on. The physicochemical properties, hydrophobicity and disordering of CsHB1 transcription factors showed that CsHB1 transcription factors were hydrophobic proteins and alkalescent, and there was no disorder region. The spatial structure analysis shows that CsHB1 has three 偽 -helix, many 尾 -folds and START domain. The expression of CsHB1 in high temperature (38 擄C), low temperature (4 擄C), drought (200g L ~ (-1) NaCl (200 mmol L ~ (-1) treatment for 812 h was analyzed by fluorescence quantitative PCR. The results showed that CsHB1 gene could be induced to express under different abiotic stress, and the difference of expression was significant.
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院茶葉科學(xué)研究所;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31570691)~~
【分類號】:Q943.2;S571.1

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本文編號:2225156

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