【摘要】：【目的】獨(dú)腳金內(nèi)酯是近年來發(fā)現(xiàn)的一種新型激素,能夠有效抑制植物分枝(蘗),在其信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中MAX2/RMS4/D3基因扮演著十分關(guān)鍵的作用。為了研究該基因在甘蔗分蘗性狀表現(xiàn)中的功能作用具有重要意義�！痉椒ā勘狙芯坷肦T-PCR和RACE技術(shù)克隆出其同源基因(ScF-box)的c DNA全長,并對其序列和編碼蛋白開展生物信息學(xué)分析�！窘Y(jié)果】ScF-box基因的c DNA全長為2642 bp(KR870233),具2103 bp的開放閱讀框(ORF,113~2215 bp),編碼700個氨基酸;蛋白質(zhì)分析表明,ScF-box為不穩(wěn)定的水溶性非分泌蛋白,主要在氨基酸生物合成和中央中介代謝中發(fā)揮作用。亞細(xì)胞定位于細(xì)胞質(zhì),存在22個磷酸化位點(diǎn),4個NES信號和1個NLS信號位點(diǎn),不存在信號肽,二級結(jié)構(gòu)以α螺旋和無規(guī)則卷曲為主,保守結(jié)構(gòu)域和三級結(jié)構(gòu)預(yù)測均表明該蛋白存在一個F-box結(jié)構(gòu),能特異識別與之作用的底物。【結(jié)論】推測ScF-box可能作為獨(dú)腳金內(nèi)酯調(diào)控甘蔗分蘗信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中一個具有特異性識別功能的組分而起作用。進(jìn)化樹分析表明該蛋白與高粱、玉米等單子葉植物進(jìn)化關(guān)系較近。
[Abstract]:[OBJECTIVE] Dipterygium lactone is a new hormone discovered in recent years, which can effectively inhibit plant branching (tillering). The MAX2/RMS4/D3 gene plays a very important role in signal transduction pathway. In order to study the function of the gene in the performance of sugarcane tillering traits, it is important to use RT-PCR in this study. The full length of the ScF-box gene was cloned by RACE and its sequence and coding protein were analyzed by bioinformatics. [Results] The full length of the ScF-box gene was 2642 BP (KR870233), with an open reading frame of 2103 BP (ORF, 113-2215 bp), encoding 700 amino acids. Sexual nonsecretory proteins, mainly involved in amino acid biosynthesis and central mediated metabolism, are subcellular localized in the cytoplasm with 22 phosphorylation sites, 4 NES signaling sites and 1 NLS signaling site. There is no signal peptide. The secondary structure of the protein is mainly alpha helix and irregular curl. Conserved domain and tertiary structure prediction indicate that the protein is mainly composed of a helix and irregular curl. [Conclusion] It is speculated that ScF-box may play a role as a specific recognition component in sugarcane tillering signal transduction pathway regulated by monocotyledons such as sorghum and maize.
【作者單位】： 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所/云南省甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)與生物技術(shù)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(31360359,31660421) 云南省中青年學(xué)術(shù)技術(shù)帶頭人后備人才(2014HB038)
【分類號】：S566.1

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本文編號：2215250