【摘要】：探討齊口裂腹魚(Schizothorax prenanti)血管內(nèi)皮黏附分子(Cadherin 5,CDH5)的基因特性。用生物信息學(xué)軟件分析齊口裂腹魚CDH5基因序列,用Real-time PCR檢測(cè)CDH5基因在齊口裂腹魚感染溫和氣單胞菌后0 h、24 h和48 h的表達(dá)變化。獲得CDH5基因全長(zhǎng)c DNA序列,Gen Bank登錄號(hào)為KT329441。該序列長(zhǎng)4 825 bp,開放閱讀框長(zhǎng)2 313 bp,編碼770個(gè)氨基酸。蛋白預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,該蛋白相對(duì)分子量為85.19 k D,等電點(diǎn)為5.01。存在信號(hào)肽序列,二級(jí)結(jié)構(gòu)以隨機(jī)卷曲、延伸鏈、α-螺旋為主。齊口裂腹魚CDH5氨基酸序列與斑馬魚同源性達(dá)74%,與人的相似性為43%。CDH5在感染溫和氣單胞菌后在各組織中均有表達(dá)。脾臟中CDH5基因在24 h表達(dá)量顯著高于0 h和48 h(P0.05)。肝臟、腎臟和肌肉中CDH5在48 h的表達(dá)量均顯著高于24 h(P0.05)。心臟和腸道中CDH5基因在48 h的表達(dá)量顯著高于0 h(P0.05)。CDH5基因在可能參與了齊口裂腹魚抗溫和氣單胞菌感染的免疫應(yīng)答,為深入研究CDH5在齊口裂腹魚中的功能奠定基礎(chǔ)。
[Abstract]:To study the gene characteristics of (Schizothorax prenanti) vascular endothelial adhesion molecule (Cadherin 5 + CDH 5). The sequence of CDH5 gene was analyzed by bioinformatics software, and the expression of CDH5 gene was detected by Real-time PCR at 24 h and 48 h after infection with Aeromonas geniformis. Obtaining the full-length c DNA sequence of CDH5 gene GenGen Bank accession number is KT329441. The length of the sequence was 4 825 bp, open reading frame and 2 313 bp, encoding 770 amino acids. The relative molecular weight of the protein was 85.19 KD and the isoelectric point was 5.01. There is signal peptide sequence, the secondary structure is random crimp, extension chain, 偽-helix. The amino acid sequence of CDH5 was 74% homology with zebrafish, and the similarity with human was that 43%.CDH5 was expressed in all tissues after infection with Aeromonas temperate. The expression of CDH5 gene in spleen at 24 h was significantly higher than that at 0 h and 48 h (P0.05). The expression of CDH5 in liver, kidney and muscle at 48 h was significantly higher than that in 24 h (P0.05). The expression of CDH5 gene in heart and intestine at 48 h was significantly higher than that in 0 h (P0.05). CDH5 gene might be involved in the immune response of Astragalus ziphoreus to temperature resistance and Aeromonas infection, which laid a foundation for further study on the function of CDH5 in the fish.
【作者單位】： 西南民族大學(xué)青藏高原研究院;西南民族大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【基金】：四川省科技支撐項(xiàng)目(2016NZ0044) 西南民族大學(xué)研究生學(xué)位點(diǎn)建設(shè)項(xiàng)目(2016XWD-SO71007)
【分類號(hào)】：S943

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本文編號(hào)：2203926